@article{LatifiHolzwarthSkidmoreetal.2021,
  author    = {Latifi, Hooman and Holzwarth, Stefanie and Skidmore, Andrew and Brůna, Josef and Červenka, Jaroslav and Darvishzadeh, Roshanak and Hais, Martin and Heiden, Uta and Homolov{\´a}, Lucie and Krzystek, Peter and Schneider, Thomas and Star{\´y}, Martin and Wang, Tiejun and M{\"u}ller, J{\"o}rg and Heurich, Marco},
  title     = {A laboratory for conceiving Essential Biodiversity Variables (EBVs)—The 'Data pool initiative for the Bohemian Forest Ecosystem'},
  series = {Methods in Ecology and Evolution},
  volume    = {12},
  journal   = {Methods in Ecology and Evolution},
  number    = {11},
  doi       = {10.1111/2041-210X.13695},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:20-opus-262743},
  pages     = {2073-2083},
  year      = {2021},
  abstract  = {Effects of climate change-induced events on forest ecosystem dynamics of composition, function and structure call for increased long-term, interdisciplinary and integrated research on biodiversity indicators, in particular within strictly protected areas with extensive non-intervention zones. The long-established concept of forest supersites generally relies on long-term funds from national agencies and goes beyond the logistic and financial capabilities of state- or region-wide protected area administrations, universities and research institutes. We introduce the concept of data pools as a smaller-scale, user-driven and reasonable alternative to co-develop remote sensing and forest ecosystem science to validated products, biodiversity indicators and management plans. We demonstrate this concept with the Bohemian Forest Ecosystem Data Pool, which has been established as an interdisciplinary, international data pool within the strictly protected Bavarian Forest and Šumava National Parks and currently comprises 10 active partners. We demonstrate how the structure and impact of the data pool differs from comparable cases. We assessed the international influence and visibility of the data pool with the help of a systematic literature search and a brief analysis of the results. Results primarily suggest an increase in the impact and visibility of published material during the life span of the data pool, with highest visibilities achieved by research conducted on leaf traits, vegetation phenology and 3D-based forest inventory. We conclude that the data pool results in an efficient contribution to the concept of global biodiversity observatory by evolving towards a training platform, functioning as a pool of data and algorithms, directly communicating with management for implementation and providing test fields for feasibility studies on earth observation missions.},
  language  = {en}
}
@phdthesis{Schneider2011,
  author    = {Schneider, Thomas},
  title     = {Synthese von reversiblen und kovalent-reversiblen Cysteinprotease-Inhibitoren},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:20-opus-67491},
  school      = {Universit{\"a}t W{\"u}rzburg},
  year      = {2011},
  abstract  = {Als Vorlage f{\"u}r diese Inhibitoren diente der kovalent gebundene Inhibitor 9IN aus der Kristallstruktur 2AMD. Die Entwicklung der neuen Leitstruktur (Abbildung 7-1) erfolgte dabei durch Fragmentierung mit dem Programm FRED im Arbeitskreis Prof. Knut Baumann (Univ. Braunschweig). Die dargestellten Verbindungen wurden als nicht-kovalent gebundene Inhibitoren entwickelt und sowohl an SARS-CoV-Mpro als auch an SARSCoV-PLpro getestet. Da die Basisverbindung 34j (R = H) in durchgef{\"u}hrten Dockingstudien die Enzym-Bindetaschen S1, S2 und S4 bereits ausreichend besetzt hatte, war das Ziel v.a. die noch freie Bindetasche S1' mit eingef{\"u}gten Resten R zu besetzen. Dazu wurden in der Reihe 34a-t verschiedene Alkylreste eingef{\"u}gt. Die Verbindungen 37a-cc bzw. 38a-p besitzen hingegen die Reste C(O)NHR, CO2R, CH2C(O)NHR und CH2CO2R. Im Verlauf der Synthese wurde der teure Baustein 4-Methylcyclohexancarbons{\"a}ure durch die g{\"u}nstigere Verbindung Cyclohexancarbons{\"a}ure ersetzt. Keine der dargestellten Verbindungen wies eine besondere Hemmung auf. Trotz geringer Hemmung konnte Verbindung 34e mit dem Enzym SARS-CoV-Mpro co-kristallisiert werden. Die genaue Lage des Inhibitors in der Bindetasche ist bislang noch nicht eindeutig gekl{\"a}rt. Der zweite Teil der vorliegenden Arbeit besch{\"a}ftigt sich mit der Entwicklung von kovalent-reversiblen Inhibitoren von Cysteinproteasen auf Grundlage von Vinylsulfonen. Bisherige bekannte Vinylsulfone reagieren wie ein Michaelsystem in einer irreversiblen Addition. Es wurden durch QM-Rechnungen in der Arbeitsgruppe Prof. Bernd Engels substituierte Vinylsulfone vorgeschlagen, die f{\"a}hig sein sollten, mit Cysteinproteasen eine kovalent-reversible Bindung eingehen zu k{\"o}nnen. Durch die Wahl sowohl eines geeigneten Substituenten als auch einer geeigneten Abgangsgruppe sollte die Reaktion reversibel sein, wenn sie thermoneutral bis schwach endergon verl{\"a}uft. Um diese Berechnungen zu best{\"a}tigen, wurden die dargestellten Verbindungen mit einem {\"U}berschuss 2-Phenylethanthiol umgesetzt und der Reaktionsverlauf durch NMR-Spektroskopie verfolgt. Dabei konnte die Einstellung eines Gleichgewichts und damit auch die Reversibilit{\"a}t der Reaktion beobachtet werden. Aus den berechneten Gleichgewichtskonstanten konnten die freien Reaktionsenergien ΔG berechnet werden. Die Ergebnisse zeigen, dass die Reaktionen nahezu thermoneutral verlaufen und best{\"a}tigen damit die QM-Berechnungen.},
  subject      = {Coronaviren},
  language  = {de}
}