@phdthesis{Rohde2022,
  author    = {Rohde, J{\"o}rn},
  title     = {Identifizierung von Schl{\"u}sselgenen, die an der Bildung von terti{\"a}r lymphatischen Organen im zentralen Nervensystem in einem B-Zell-abh{\"a}ngigen Mausmodell der Multiplen Sklerose beteiligt sind},
  doi       = {10.25972/OPUS-26766},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:20-opus-267669},
  school      = {Universit{\"a}t W{\"u}rzburg},
  year      = {2022},
  abstract  = {Bei Patienten, die an einer speziellen Form der MS erkrankten, konnten Entz{\"u}ndungsinfiltrate in den Meningen nachgewiesen werden, die in ihrem Aufbau lymphoidem Gewebe {\"a}hnelten. Das Auftreten dieser Infiltrate war mit einem schwereren Krankheitsverlauf assoziiert. Das Mausmodell der B-Zell-abh{\"a}ngigen MP4-induzierten experimentellen autoimmunen Enzephalomyelitis (EAE) zeigt in den Kleinhirnen der M{\"a}use Infiltrate, die den Infiltraten beim Menschen {\"a}hneln. Wir nutzten die MP4-induzierte EAE, um die Mechanismen der Erkrankungsentstehung und Progression besser zu verstehen. Ziel dieser Arbeit war es intakte und stabile Ribonukleins{\"a}uren (RNA) aus den Infiltraten der M{\"a}use zu isolieren. Sowie Identifizierung von Gene, die w{\"a}hrend verschiedener Stadien der zerebralen Entz{\"u}ndungsreaktion hochreguliert waren. Wir verglichen die M{\"o}glichkeiten der RNA-Isolation bei Paraffin-eingebettetem Gewebe und kryofixiertem Gewebe. Um die Vergleichbarkeit der Qualit{\"a}ts- und Quantit{\"a}tsanalyse zu gew{\"a}hrleisten, wurde f{\"u}r jede Probe eine RNA Integrit{\"a}tsnummer (RIN) ermittelt. Wir f{\"u}hrten eine Laser Capture Microdissection (LCM) und anschließende Gensequenzierung der zerebralen Infiltrate bei M{\"a}usen durch, bei denen eine MP4-abh{\"a}ngige EAE ausgel{\"o}st wurde. Des Weiteren verglichen wir die Ergebnisse mit den Expressionsprofilen von sekund{\"a}r lymphatischen Organen (SLOs). Insgesamt konnten wir 43 Gene herausfiltern, die im Vergleich zu den Kontrollgruppen hochreguliert waren. Die Entwicklung von ektopen lymphatischen Strukturen (ELS) im zentralen Nervensystem (ZNS) ist ein komplexer und bisher wenig verstandener Prozess. In dieser Studie beobachteten wir 43 Gene, die w{\"a}hrend der Entwicklung von B- Zell-Infiltraten in den Kleinhirnen von MP4-immunisierten M{\"a}usen signifikant hochreguliert waren. Von diesen Genen wurden bereits 14 im Zusammenhang mit der MS erw{\"a}hnt und sind zum Teil Gegenstand aktiver Forschung.},
  subject      = {Multiple Sklerose},
  language  = {de}
}
@article{RohdeHimmelHofingeretal.2022,
  author    = {Rohde, J{\"o}rn and Himmel, Wolfgang and Hofinger, Clemens and L{\^a}m, Thi{\^e}n-Tr{\´i} and Schrader, Hanna and Wallstabe, Julia and Kurzai, Oliver and G{\´a}gyor, Ildik{\´o}},
  title     = {Diagnostic accuracy and feasibility of a rapid SARS-CoV-2 antigen test in general practice - a prospective multicenter validation and implementation study},
  series = {BMC Primary Care},
  volume    = {23},
  journal   = {BMC Primary Care},
  number    = {1},
  doi       = {10.1186/s12875-022-01756-1},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:20-opus-299659},
  year      = {2022},
  abstract  = {Background PCR testing is considered the gold standard for SARS-CoV-2 diagnosis but its results are earliest available hours to days after testing. Rapid antigen tests represent a diagnostic tool enabling testing at the point of care. Rapid antigen tests have mostly been validated by the manufacturer or in controlled laboratory settings only. External validation at the point of care, particularly in general practice where the test is frequently used, is needed. Furthermore, it is unclear how well point of care tests are accepted by the practice staff. Methods In this prospective multicenter validation study in primary care, general practitioners included adult individuals presenting with symptoms suggesting COVID-19. Each patient was tested by the general practitioner, first with a nasopharyngeal swab for the point of care test (Roche SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test) and then with a second swab for PCR testing. Using the RT-PCR result as a reference, we calculated specificity, sensitivity, positive predictive value and negative predictive value, with their 95\% confidence intervals. General practitioners and medical assistants completed a survey to assess feasibility and usefulness of the point of care tests. Results In 40 practices in W{\"u}rzburg, Germany, 1518 patients were recruited between 12/2020 and 06/2021. The point of care test achieved a sensitivity of 78.3\% and a specificity of 99.5\% compared to RT-PCR. With a prevalence of 9.5\%, the positive predictive value was 93.9\% and the negative predictive value was 97.8\%. General practitioners rated the point of care test as a helpful tool to support diagnostics in patients with signs and symptoms suggestive for infection, particularly in situations where decision on further care is needed at short notice. Conclusion The point of care test used in this study showed a sensitivity below the manufacturer's specification (Sensitivity 96.25\%) in the practice but high values for specificity and high positive predictive value and negative predictive value. Although widely accepted in the practice, measures for further patient management require a sensitive interpretation of the point of care test results.},
  language  = {en}
}