@article{RuttenVermettenVinkersetal.2018,
  author    = {Rutten, BPF and Vermetten, E and Vinkers, CH and Ursini, G and Daskalakis, NP and Pishva, E and de Nijs, L and Houtepen, LC and Eijssen, L and Jaffe, AE and Kenis, G and Viechtbauer, W and van den Hove, D and Schraut, KG and Lesch, K-P and Kleinman, JE and Hyde, TM and Weinberger, DR and Schalkwyk, L and Lunnon, K and Mill, J and Cohen, H and Yehuda, R and Baker, DG and Maihofer, AX and Nievergelt, CM and Geuze, E and Boks, MPM},
  title     = {Longitudinal analyses of the DNA methylome in deployed military servicemen identify susceptibility loci for post-traumatic stress disorder},
  series = {Molecular Psychiatry},
  volume    = {23},
  journal   = {Molecular Psychiatry},
  number    = {5},
  doi       = {10.1038/mp.2017.120},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:20-opus-227171},
  pages     = {1145-11562},
  year      = {2018},
  abstract  = {In order to determine the impact of the epigenetic response to traumatic stress on post-traumatic stress disorder (PTSD), this study examined longitudinal changes of genome-wide blood DNA methylation profiles in relation to the development of PTSD symptoms in two prospective military cohorts (one discovery and one replication data set). In the first cohort consisting of male Dutch military servicemen (n = 93), the emergence of PTSD symptoms over a deployment period to a combat zone was significantly associated with alterations in DNA methylation levels at 17 genomic positions and 12 genomic regions. Evidence for mediation of the relation between combat trauma and PTSD symptoms by longitudinal changes in DNA methylation was observed at several positions and regions. Bioinformatic analyses of the reported associations identified significant enrichment in several pathways relevant for symptoms of PTSD. Targeted analyses of the significant findings from the discovery sample in an independent prospective cohort of male US marines (n = 98) replicated the observed relation between decreases in DNA methylation levels and PTSD symptoms at genomic regions in ZFP57, RNF39 and HIST1H2APS2. Together, our study pinpoints three novel genomic regions where longitudinal decreases in DNA methylation across the period of exposure to combat trauma marks susceptibility for PTSD.},
  language  = {en}
}
@article{AbuHalimaHaeuslerBackesetal.2017,
  author    = {Abu-Halima, Masood and H{\"a}usler, Sebastian and Backes, Christina and Fehlmann, Tobias and Staib, Claudia and Nestel, Sigrun and Nazarenko, Irina and Meese, Eckart and Keller, Andreas},
  title     = {Micro-ribonucleic acids and extracellular vesicles repertoire in the spent culture media is altered in women undergoing \(In\) \(Vitro\) Fertilization},
  series = {Scientific Reports},
  volume    = {7},
  journal   = {Scientific Reports},
  doi       = {10.1038/s41598-017-13683-8},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:20-opus-173632},
  year      = {2017},
  abstract  = {MicroRNAs (miRNAs) are class of small RNA molecules with major impact on gene regulation. We analyzed the potential of miRNAs secreted from pre-implantation embryos into the embryonic culture media as biomarkers to predict successful pregnancy. Using microarray analysis, we profiled the miRNome of the 56 spent culture media (SCM) after embryos transfer and found a total of 621 miRNAs in the SCM. On average, we detected 163 miRNAs in SCM of samples with failed pregnancies, but only 149 SCM miRNAs of embryos leading to pregnancies. MiR-634 predicted an embryo transfer leading to a positive pregnancy with an accuracy of 71\% and a sensitivity of 85\%. Among the 621 miRNAs, 102 (16.4\%) showed a differential expression between positive and negative outcome of pregnancy with miR-29c-3p as the most significantly differentially expressed miRNA. The number of extracellular vehicles was lower in SCM with positive outcomes (3.8 × 10\(^9\)/mL EVs), as compared to a negative outcome (7.35 × 10\(^9\)/mL EVs) possibly explaining the reduced number of miRNAs in the SCM associated with failed pregnancies. The analysis of the miRNome in the SCM of couples undergoing fertility treatment lays the ground towards development of biomarkers to predict successful pregnancy and towards understanding the role of embryonic miRNAs found in the SCM.},
  language  = {en}
}
@phdthesis{Neufeld2000,
  author    = {Neufeld, Bernd},
  title     = {Neue Interaktionspartner der MAPKAP-Kinasen 3pK und MK2},
  url       = {http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:20-opus-1765},
  school      = {Universit{\"a}t W{\"u}rzburg},
  year      = {2000},
  abstract  = {Auf der Suche nach physiologischen Substraten der MAPK-aktivierten Proteinkinasen (MAPKAP-Kinasen), 3pK und MAPKAP-K2 (MK2), wurden Mitglieder eines S{\"a}uger-Polycomb-Komplexes, HPH2 und das Protoonkoprotein Bmi1, als Interaktionspartner identifiziert. Proteine aus der Polycomb-Gruppe (PcG) sind daf{\"u}r bekannt, multimere, Chromatin-assoziierte Proteinkomplexe zu bilden. Diese wirken als transkriptionelle Repressoren und spielen als solche eine wichtige Rolle sowohl in der Regulation von Entwicklungsprozessen als auch in der Kontrolle der zellul{\"a}ren Proliferation. HPH2 bindet im Hefe two-hybrid-System sowohl an 3pK als auch an MK2. Die Kinasen coimmunpr{\"a}zipitieren auch mit den PcG-Proteinen. Weiterhin wurde festgestellt, daß nicht aktivierte und DNA-assoziierte 3pK, {\"a}hnlich wie Bmi1, in einem in vivo Repressionsassay als transkriptioneller Repressor wirkt. Dies unterstellt, daß 3pK, wie Bmi1, f{\"a}hig sein muß, andere PcG-Proteine an das Zielgen zu rekrutieren, wo sich dann ein biologisch funktioneller Repressionskomplex rekonstituiert. Bmi1 ist ein Phosphoprotein und beide MAPKAP-Kinasen konnten in dieser Arbeit als in vitro Bmi1-Kinasen identifiziert werden. Da der Phosphorylierungsstatus von Bmi1 mit seiner Dissoziation und der anderer PcG-Proteine vom Chromatin korreliert, k{\"o}nnten die MAPKAP-Kinasen Regulatoren einer phosphorylierungs-abh{\"a}ngigen PcG-Komplex/Chromatin-Interaktion sein. 3pK und MK2 wurden hier als die ersten Kinasen identifiziert, die in Assoziation mit Proteinen von PcG-Komplexen vorliegen, was ein funktionelles Zusammenwirken von MAPK-Signaltransduktionsnetzwerk und der Regulation der PcG-Funktion nahe legt. Ein weiterer durch das two-hybrid-System und Coimmunpr{\"a}zipitationsexperimente identifizierter Interaktionspartner beider hier analysierter MAPKAP-Kinasen ist der basische Helix-Loop-Helix- (bHLH) Transkriptionsfaktor E47. Dieses E2A-kodierte Protein bindet als Homo- bzw. Heterodimer mit gewebespezifischen bHLH-Proteinen an sogenannte E-Box-DNA-Motive und ist so in die Regulation gewebespezifischer Genexpression und Zelldifferenzierung involviert. In dieser Arbeit konnten 3pK und MK2 als in vitro Kinasen des in Zellen phosphoryliert vorliegenden Transkriptionsfaktors identifiziert werden. Weiterhin f{\"u}hrte die transiente Expression jeder dieser Kinasen in einem Reportergenassay mit einem E-Box-Promotorkonstrukt zu einer Repression der transkriptionellen Aktivit{\"a}t von E47. Der bHLH-Transkriptionsfaktor E47 interagiert also mit beiden MAPKAP-Kinasen, 3pK und MK2, was die Kinasen als neu identifizierte Regulatoren der E47-abh{\"a}ngigen Genexpression pr{\"a}sentiert. Mit dieser Arbeit ist ein erster Aufschluß der physiologischen Aktivit{\"a}t der MAPKAP-Kinasen 3pK und MK2 als transkriptionelle Regulatoren gelungen.},
  subject      = {MAP-Kinase},
  language  = {de}
}