TY - JOUR A1 - Blanco, Ignacio A1 - Kuchenbaecker, Karoline A1 - Cuadras, Daniel A1 - Wang, Xianshu A1 - Barrowdale, Daniel A1 - Ruiz de Garibay, Gorka A1 - Librado, Pablo A1 - Sanchez-Gracia, Alejandro A1 - Rozas, Julio A1 - Bonifaci, Núria A1 - McGuffog, Lesley A1 - Pankratz, Vernon S. A1 - Islam, Abul A1 - Mateo, Francesca A1 - Berenguer, Antoni A1 - Petit, Anna A1 - Català, Isabel A1 - Brunet, Joan A1 - Feliubadaló, Lidia A1 - Tornero, Eva A1 - Benítez, Javier A1 - Osorio, Ana A1 - Ramón y Cajal, Teresa A1 - Nevanlinna, Heli A1 - Aittomäki, Kristina A1 - Arun, Banu K. A1 - Toland, Amanda E. A1 - Karlan, Beth Y. A1 - Walsh, Christine A1 - Lester, Jenny A1 - Greene, Mark H. A1 - Mai, Phuong L. A1 - Nussbaum, Robert L. A1 - Andrulis, Irene L. A1 - Domchek, Susan M. A1 - Nathanson, Katherine L. A1 - Rebbeck, Timothy R. A1 - Barkardottir, Rosa B. A1 - Jakubowska, Anna A1 - Lubinski, Jan A1 - Durda, Katarzyna A1 - Jaworska-Bieniek, Katarzyna A1 - Claes, Kathleen A1 - Van Maerken, Tom A1 - Díez, Orland A1 - Hansen, Thomas V. A1 - Jønson, Lars A1 - Gerdes, Anne-Marie A1 - Ejlertsen, Bent A1 - De la Hoya, Miguel A1 - Caldés, Trinidad A1 - Dunning, Alison M. A1 - Oliver, Clare A1 - Fineberg, Elena A1 - Cook, Margaret A1 - Peock, Susan A1 - McCann, Emma A1 - Murray, Alex A1 - Jacobs, Chris A1 - Pichert, Gabriella A1 - Lalloo, Fiona A1 - Chu, Carol A1 - Dorkins, Huw A1 - Paterson, Joan A1 - Ong, Kai-Ren A1 - Teixeira, Manuel R. A1 - Hogervorst, Frans B. L. A1 - Van der Hout, Annemarie H. A1 - Seynaeve, Caroline A1 - Van der Luijt, Rob B. A1 - Ligtenberg, Marjolijn J. L. A1 - Devilee, Peter A1 - Wijnen, Juul T. A1 - Rookus, Matti A. A1 - Meijers-Heijboer, Hanne E. J. A1 - Blok, Marinus J. A1 - Van den Ouweland, Ans M. W. A1 - Aalfs, Cora M. A1 - Rodriguez, Gustavo C. A1 - Phillips, Kelly-Anne A. A1 - Piedmonte, Marion A1 - Nerenstone, Stacy R. A1 - Bae-Jump, Victoria L. A1 - O'Malley, David M. A1 - Schmutzler, Rita K. A1 - Wappenschmidt, Barbara A1 - Rhiem, Kerstin A1 - Engel, Christoph A1 - Meindl, Alfons A1 - Ditsch, Nina A1 - Arnold, Norbert A1 - Plendl, Hansjoerg J. A1 - Niederacher, Dieter A1 - Sutter, Christian A1 - Wang-Gohrke, Shan A1 - Steinemann, Doris A1 - Preisler-Adams, Sabine A1 - Kast, Karin A1 - Varon-Mateeva, Raymonda A1 - Gehrig, Andrea A1 - Bojesen, Anders A1 - Pedersen, Inge Sokilde A1 - Sunde, Lone A1 - Birk Jensen, Uffe A1 - Thomassen, Mads A1 - Kruse, Torben A. A1 - Foretova, Lenka A1 - Peterlongo, Paolo A1 - Bernard, Loris A1 - Peissel, Bernard A1 - Scuvera, Giulietta A1 - Manoukian, Siranoush A1 - Radice, Paolo A1 - Ottini, Laura A1 - Montagna, Marco A1 - Agata, Simona A1 - Maugard, Christine A1 - Simard, Jacques A1 - Soucy, Penny A1 - Berger, Andreas A1 - Fink-Retter, Anneliese A1 - Singer, Christian F. A1 - Rappaport, Christine A1 - Geschwantler-Kaulich, Daphne A1 - Tea, Muy-Kheng A1 - Pfeiler, Georg A1 - John, Esther M. A1 - Miron, Alex A1 - Neuhausen, Susan L. A1 - Terry, Mary Beth A1 - Chung, Wendy K. A1 - Daly, Mary B. A1 - Goldgar, David E. A1 - Janavicius, Ramunas A1 - Dorfling, Cecilia M. A1 - Van Rensburg, Elisabeth J. A1 - Fostira, Florentia A1 - Konstantopoulou, Irene A1 - Garber, Judy A1 - Godwin, Andrew K. A1 - Olah, Edith A1 - Narod, Steven A. A1 - Rennert, Gad A1 - Paluch, Shani Shimon A1 - Laitman, Yael A1 - Friedman, Eitan A1 - Liljegren, Annelie A1 - Rantala, Johanna A1 - Stenmark-Askmalm, Marie A1 - Loman, Niklas A1 - Imyanitov, Evgeny N. A1 - Hamann, Ute A1 - Spurdle, Amanda B. A1 - Healey, Sue A1 - Weitzel, Jeffrey N. A1 - Herzog, Josef A1 - Margileth, David A1 - Gorrini, Chiara A1 - Esteller, Manel A1 - Gómez, Antonio A1 - Sayols, Sergi A1 - Vidal, Enrique A1 - Heyn, Holger A1 - Stoppa-Lyonnet, Dominique A1 - Léoné, Melanie A1 - Barjhoux, Laure A1 - Fassy-Colcombet, Marion A1 - Pauw, Antoine de A1 - Lasset, Christine A1 - Fert Ferrer, Sandra A1 - Castera, Laurent A1 - Berthet, Pascaline A1 - Cornelis, François A1 - Bignon, Yves-Jean A1 - Damiola, Francesca A1 - Mazoyer, Sylvie A1 - Sinilnikova, Olga M. A1 - Maxwell, Christopher A. A1 - Vijai, Joseph A1 - Robson, Mark A1 - Kauff, Noah A1 - Corines, Marina J. A1 - Villano, Danylko A1 - Cunningham, Julie A1 - Lee, Adam A1 - Lindor, Noralane A1 - Lázaro, Conxi A1 - Easton, Douglas F. A1 - Offit, Kenneth A1 - Chenevix-Trench, Georgia A1 - Couch, Fergus J. A1 - Antoniou, Antonis C. A1 - Pujana, Miguel Angel T1 - Assessing associations between the AURKA-HMMR-TPX2-TUBG1 functional module and breast cancer risk in BRCA1/2 mutation carriers JF - PLoS ONE N2 - While interplay between BRCA1 and AURKA-RHAMM-TPX2-TUBG1 regulates mammary epithelial polarization, common genetic variation in HMMR (gene product RHAMM) may be associated with risk of breast cancer in BRCA1 mutation carriers. Following on these observations, we further assessed the link between the AURKA-HMMR-TPX2-TUBG1 functional module and risk of breast cancer in BRCA1 or BRCA2 mutation carriers. Forty-one single nucleotide polymorphisms (SNPs) were genotyped in 15,252 BRCA1 and 8,211 BRCA2 mutation carriers and subsequently analyzed using a retrospective likelihood approach. The association of HMMR rs299290 with breast cancer risk in BRCA1 mutation carriers was confirmed: per-allele hazard ratio (HR) = 1.10, 95% confidence interval (CI) 1.04 - 1.15, p = 1.9 x 10\(^{-4}\) (false discovery rate (FDR)-adjusted p = 0.043). Variation in CSTF1, located next to AURKA, was also found to be associated with breast cancer risk in BRCA2 mutation carriers: rs2426618 per-allele HR = 1.10, 95% CI 1.03 - 1.16, p = 0.005 (FDR-adjusted p = 0.045). Assessment of pairwise interactions provided suggestions (FDR-adjusted p\(_{interaction}\) values > 0.05) for deviations from the multiplicative model for rs299290 and CSTF1 rs6064391, and rs299290 and TUBG1 rs11649877 in both BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Following these suggestions, the expression of HMMR and AURKA or TUBG1 in sporadic breast tumors was found to potentially interact, influencing patients' survival. Together, the results of this study support the hypothesis of a causative link between altered function of AURKA-HMMR-TPX2-TUBG1 and breast carcinogenesis in BRCA1/2 mutation carriers. KW - genetic interaction networks KW - genome-wide association KW - expression signature KW - susceptibility loci KW - survival KW - modifiers KW - polymorphism KW - cell KW - chip-seq KW - elements Y1 - 2015 U6 - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-143469 VL - 10 IS - 4 ER - TY - BOOK A1 - Lauth, Hans-Joachim A1 - Kauff, Oliver T1 - Demokratiemessung: Der KID als aggregiertes Maß für die komparative Forschung. Empirische Befunde der Regimeentwicklung von 1996 bis 2010 T1 - Measurement of Democracy: The Combined Index of Democracy (CID) as an aggregated measurement for Comparative Research. Empirical Findings of Regime Formation between 1996 and 2010 N2 - Der Kombinierte Index der Demokratie (KID) und der Kombinierte Index der Demokratie 3 Dimensionen (KID3D ) messen die Regimequalität von 161 Ländern über den Zeitraum von 1996 bis 2010. Dabei werden die Datenreihen von Freedom House, Polity und den Governance Indicators der Weltbank gezielt zu zwei Meta-Indizes kombiniert, um deren Defizite zu kompensieren. Der KID3D beruht auf einem dreidimensionalen Demokratieverständnis, das sich auf die Dimensionen der Freiheit, Gleichheit und politischen und rechtlichen Kontrolle erstreckt. Während durch den Einbezug der Daten der Political Rights-Skala von Freedom House und der DEMOC-Skala von Polity maßgeblich die Dimensionen der Freiheit und der Gleichheit abgebildet werden, wird mit dem Index „rule of law“ der Governance-Indikatoren der Weltbank die Kontrolldimension und damit Aspekte der horizontalen Accountability und der Rechtsstaatlichkeit aufgenommen. Beim KID wird der Faktor „Staatlichkeit“ zusätzlich in den Demokratie¬index einbezogen. Bei Freedom House und Polity sowie bei den Governance-Indikatoren zu rule of law ist dies aufgrund der Indikatoren nur sehr begrenzt gegeben. Auch in diesem Fall liefert die Governance-Datenreihe der Weltbank mit „Political Stability” einen Indikator, der den Aspekt eines funktionsfähigen Gewaltmonopols aufgreift. Die Skala des KID3D und KID umfasst die Werte von 0 bis 10. Während 0 ein stark autokratisches System bezeichnet, steht die 10 für ein umfassend demokratisches System. Die KID3D-Schwellenwerte liegen für eine defizitäre beziehungsweise funktionierende Demokratie bei den Werten sechs und acht; beim KID bei fünf und sieben. Das Arbeitspapier stellt nach dem konzeptionellen Teil die empirischen Befunde vor: Wie haben sich die Regime von 1996 bis 2010 entwickelt? Angesprochen werden sowohl Regimewechsel als auch der Wandel in der Qualität der Demokratie. Welcher Trend lässt sich in den einzelnen Weltregionen verzeichnen und kann von einer Regression der De-mokratie gesprochen werden? Dieser Teil enthält zudem eine externe Validitätsprüfung, die auf einem Abgleich mit Werten zur Korruptions¬entwicklung basiert. Darüber hinaus werden die Übereinstimmung verschiedener Demokratie-Indizes mit dem KID3D und KID getestet sowie abweichende Falleinschätzungen diskutiert. Die kompletten Daten des KID finden sich schließlich im Anhang und auf: www.politikwissenschaft.uni-wuerzburg.de/lehrbereiche/vergleichende/forschung/kombinierter_index_der_demokratie_kid/ N2 - The Combined Index of Democracy (CID) measures the quality of regimes in 161 states between 1996 and 2010. Our two meta-indices – the CID3D (Combined Index of Democracy 3 dimensions) and the CID – result from combining data from Freedom House, Polity and the Governance Indicators collected by the World Bank in order to overcome shortcomings of those indices. First we will discuss different existing approaches of measuring democracy and then introduce our own propositions – CID3D and CID. The CID3D is based on a three di-mensional concept of democracy including the dimensions freedom, equality, political and judicial control. The data of the dimensions ‘freedom’ and ‘equality’ are derived from Freedoms House’s Political Rights Rating and Polity’s DEMOC indicator. The data of the third dimension is based on the ‘rule of law’ index of the World Bank’s Governance Indicators. It encloses control and thereby aspects of horizontal accountability and rule of law. The CID also includes stateness as an additional factor. Freedom House, Polity and the Governance Indicators of ‘rule of law’ fall short in providing adequate indicators for this factor. The Word Bank’s Governance dataset furnishes information about an effec-tive state monopoly on the use of force with the ‘political stability’ indicator. CID3D and CID scores can range from a scale of 0 to 10. The lowest score describes an intensely autocratic regime, the highest score relates to a full democratic system. CID3D scores of six and eight and the CID scores of five and seven mark thresholds for defective respectively functioning democracies. In the second part of our paper we present empirical results: In which direction have regimes developed between 1996 and 2010? We discuss regime changes as well as altera-tion regarding the quality of democracy. What trends can be observed in different world regions and is there any regression of democracy? The third part of the paper will undertake an external validity check comparing scores with those of corruption development. We also test CID3D and CID compliance with other democracy indices and discuss deviate results. CID’s complete data is provided in the appendix. www.politikwissenschaft.uni-wuerzburg.de/lehrbereiche/vergleichende/forschung/kombinierter_index_der_demokratie_kid/ T3 - Würzburger Arbeitspapiere zur Politikwissenschaft und Soziologie (WAPS) - 2 KW - Demokratie KW - Vergleichende politische Wissenschaft KW - Demokratieforschung KW - Tatu Vanhanen KW - Demokratiemessung KW - Freedom House KW - Polity KW - Robert Dahl KW - Würzburg KW - democracy KW - CID Y1 - 2012 U6 - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-73033 ER -