TY  - JOUR
A1  - Antoniou, Antonis C.
A1  - Kuchenbaecker, Karoline B.
A1  - Soucy, Penny
A1  - Beesley, Jonathan
A1  - Chen, Xiaoqing
A1  - McGuffog, Lesley
A1  - Lee, Andrew
A1  - Barrowdale, Daniel
A1  - Healey, Sue
A1  - Sinilnikova, Olga M.
A1  - Caligo, Maria A.
A1  - Loman, Niklas
A1  - Harbst, Katja
A1  - Lindblom, Annika
A1  - Arver, Brita
A1  - Rosenquist, Richard
A1  - Karlsson, Per
A1  - Nathanson, Kate
A1  - Domchek, Susan
A1  - Rebbeck, Tim
A1  - Jakubowska, Anna
A1  - Lubinski, Jan
A1  - Jaworska, Katarzyna
A1  - Durda, Katarzyna
A1  - Zlowowcka-Perłowska, Elżbieta
A1  - Osorio, Ana
A1  - Durán, Mercedes
A1  - Andrés, Raquel
A1  - Benítez, Javier
A1  - Hamann, Ute
A1  - Hogervorst, Frans B.
A1  - van Os, Theo A.
A1  - Verhoef, Senno
A1  - Meijers-Heijboer, Hanne E. J.
A1  - Wijnen, Juul
A1  - Garcia, Encarna B. Gómez
A1  - Ligtenberg, Marjolijn J.
A1  - Kriege, Mieke
A1  - Collée, Margriet
A1  - Ausems, Margreet G. E. M.
A1  - Oosterwijk, Jan C.
A1  - Peock, Susan
A1  - Frost, Debra
A1  - Ellis, Steve D.
A1  - Platte, Radka
A1  - Fineberg, Elena
A1  - Evans, D. Gareth
A1  - Lalloo, Fiona
A1  - Jacobs, Chris
A1  - Eeles, Ros
A1  - Adlard, Julian
A1  - Davidson, Rosemarie
A1  - Cole, Trevor
A1  - Cook, Jackie
A1  - Paterson, Joan
A1  - Douglas, Fiona
A1  - Brewer, Carole
A1  - Hodgson, Shirley
A1  - Morrison, Patrick J.
A1  - Walker, Lisa
A1  - Rogers, Mark T.
A1  - Donaldson, Alan
A1  - Dorkins, Huw
A1  - Godwin, Andrew K.
A1  - Bove, Betsy
A1  - Stoppa-Lyonnet, Dominique
A1  - Houdayer, Claude
A1  - Buecher, Bruno
A1  - de Pauw, Antoine
A1  - Mazoyer, Sylvie
A1  - Calender, Alain
A1  - Léoné, Mélanie
A1  - Bressac-de Paillerets, Brigitte
A1  - Caron, Olivier
A1  - Sobol, Hagay
A1  - Frenay, Marc
A1  - Prieur, Fabienne
A1  - Ferrer, Sandra Fert
A1  - Mortemousque, Isabelle
A1  - Buys, Saundra
A1  - Daly, Mary
A1  - Miron, Alexander
A1  - Terry, Mary Beth
A1  - Hopper, John L.
A1  - John, Esther M.
A1  - Southey, Melissa
A1  - Goldgar, David
A1  - Singer, Christian F.
A1  - Fink-Retter, Anneliese
A1  - Muy-Kheng, Tea
A1  - Geschwantler Kaulich, Daphne
A1  - Hansen, Thomas V. O.
A1  - Nielsen, Finn C.
A1  - Barkardottir, Rosa B.
A1  - Gaudet, Mia
A1  - Kirchhoff, Tomas
A1  - Joseph, Vijai
A1  - Dutra-Clarke, Ana
A1  - Offit, Kenneth
A1  - Piedmonte, Marion
A1  - Kirk, Judy
A1  - Cohn, David
A1  - Hurteau, Jean
A1  - Byron, John
A1  - Fiorica, James
A1  - Toland, Amanda E.
A1  - Montagna, Marco
A1  - Oliani, Cristina
A1  - Imyanitov, Evgeny
A1  - Isaacs, Claudine
A1  - Tihomirova, Laima
A1  - Blanco, Ignacio
A1  - Lazaro, Conxi
A1  - Teulé, Alex
A1  - Del Valle, J.
A1  - Gayther, Simon A.
A1  - Odunsi, Kunle
A1  - Gross, Jenny
A1  - Karlan, Beth Y.
A1  - Olah, Edith
A1  - Teo, Soo-Hwang
A1  - Ganz, Patricia A.
A1  - Beattie, Mary S.
A1  - Dorfling, Cecelia M.
A1  - Jansen van Rensburg, Elizabeth
A1  - Diez, Orland
A1  - Kwong, Ava
A1  - Schmutzler, Rita K.
A1  - Wappenschmidt, Barbara
A1  - Engel, Christoph
A1  - Meindl, Alfons
A1  - Ditsch, Nina
A1  - Arnold, Norbert
A1  - Heidemann, Simone
A1  - Niederacher, Dieter
A1  - Preisler-Adams, Sabine
A1  - Gadzicki, Dorothea
A1  - Varon-Mateeva, Raymonda
A1  - Deissler, Helmut
A1  - Gehrig, Andrea
A1  - Sutter, Christian
A1  - Kast, Karin
A1  - Fiebig, Britta
A1  - Schäfer, Dieter
A1  - Caldes, Trinidad
A1  - de la Hoya, Miguel
A1  - Nevanlinna, Heli
A1  - Muranen, Taru A.
A1  - Lespérance, Bernard
A1  - Spurdle, Amanda B.
A1  - Neuhausen, Susan L.
A1  - Ding, Yuan C.
A1  - Wang, Xianshu
A1  - Fredericksen, Zachary
A1  - Pankratz, Vernon S.
A1  - Lindor, Noralane M.
A1  - Peterlongo, Paulo
A1  - Manoukian, Siranoush
A1  - Peissel, Bernard
A1  - Zaffaroni, Daniela
A1  - Bonanni, Bernardo
A1  - Bernard, Loris
A1  - Dolcetti, Riccardo
A1  - Papi, Laura
A1  - Ottini, Laura
A1  - Radice, Paolo
A1  - Greene, Mark H.
A1  - Loud, Jennifer T.
A1  - Andrulis, Irene L.
A1  - Ozcelik, Hilmi
A1  - Mulligan, Anna Marie
A1  - Glendon, Gord
A1  - Thomassen, Mads
A1  - Gerdes, Anne-Marie
A1  - Jensen, Uffe B.
A1  - Skytte, Anne-Bine
A1  - Kruse, Torben A.
A1  - Chenevix-Trench, Georgia
A1  - Couch, Fergus J.
A1  - Simard, Jacques
A1  - Easton, Douglas F.
T1  - Common variants at 12p11, 12q24, 9p21, 9q31.2 and in ZNF365 are associated with breast cancer risk for BRCA1 and/or BRCA2 mutation carriers
JF  - Breast Cancer Research
N2  - Introduction: Several common alleles have been shown to be associated with breast and/or ovarian cancer risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Recent genome-wide association studies of breast cancer have identified eight additional breast cancer susceptibility loci: rs1011970 (9p21, CDKN2A/B), rs10995190 (ZNF365), rs704010 (ZMIZ1), rs2380205 (10p15), rs614367 (11q13), rs1292011 (12q24), rs10771399 (12p11 near PTHLH) and rs865686 (9q31.2). 
Methods: To evaluate whether these single nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with breast cancer risk for BRCA1 and BRCA2 carriers, we genotyped these SNPs in 12,599 BRCA1 and 7,132 BRCA2 mutation carriers and analysed the associations with breast cancer risk within a retrospective likelihood framework. 
Results: Only SNP rs10771399 near PTHLH was associated with breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers (per-allele hazard ratio (HR) = 0.87, 95% CI: 0.81 to 0.94, P-trend = 3 x 10\(^{-4}\)). The association was restricted to mutations proven or predicted to lead to absence of protein expression (HR = 0.82, 95% CI: 0.74 to 0.90, P-trend = 3.1 x 10\(^{-5}\), P-difference = 0.03). Four SNPs were associated with the risk of breast cancer for BRCA2 mutation carriers: rs10995190, P-trend = 0.015; rs1011970, P-trend = 0.048; rs865686, 2df P = 0.007; rs1292011 2df P = 0.03. rs10771399 (PTHLH) was predominantly associated with estrogen receptor (ER)-negative breast cancer for BRCA1 mutation carriers (HR = 0.81, 95% CI: 0.74 to 0.90, P-trend = 4 x 10\(^{-5}\)) and there was marginal evidence of association with ER- negative breast cancer for BRCA2 mutation carriers (HR = 0.78, 95% CI: 0.62 to 1.00, P-trend = 0.049). 
Conclusions: The present findings, in combination with previously identified modifiers of risk, will ultimately lead to more accurate risk prediction and an improved understanding of the disease etiology in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.
KW  - investigators
KW  - genetic modifiers
KW  - mammographic density
KW  - susceptibility loci
KW  - ovarian cancer
KW  - hormone-related protein
KW  - genome-wide association
KW  - tumor subtypes
KW  - alleles
KW  - consortium
Y1  - 2012
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-130449
VL  - 14
IS  - R33
ER  - 
TY  - THES
A1  - Schäfer, David
T1  - Entwicklung eines Transmissionsmikroskops für weiche Röntgenstrahlung und die Anwendung an Laborquellen
T1  - Table-Top Transmission Soft X-ray Microscope for laboratory applications
N2  - Die vorliegende Arbeit befasst sich mit der Entwicklung und Konstruktion eines mobilen Transmissionsmikroskops für weiche Röntgenstrahlung. Dieses ist speziell für den Einsatz an Laborquellen konzipiert und erlaubt durch einen modularen Aufbau auch den Betrieb an Synchrotroneinrichtungen. Das Mikroskop basiert auf einem abbildenden System mit einer Zonenplatte als Objektiv und einer CCD-Kamera als Detektor. Das Anwendungsgebiet erstreckt sich über den spektralen Bereich des Wasserfensters zwischen 2,3 nm und 4,4 nm Wellenlänge bis hin zu extrem ultravioletter Strahlung (Wellenlänge < 20 nm). Dabei können vakuumtaugliche Proben, wie beispielsweise lithographische Testobjekte, Kieselalgen oder chemisch fixierte biologische Zellen untersucht werden. Bei den verwendeten Laborquellen handelt es sich zum einen um ein laserinduziertes Plasma mit einem flüssigen Stickstoffstrahl als Target und zum anderen um eine elektrische Stickstoffgas-Entladungsquelle mit Hohlkathoden-Elektrodengeometrie. Aufgrund der stark unterschiedlichen Quellkonzepte müssen die Quellen für die Entwicklung entsprechender Kondensorkonzepte in Bezug auf ihre spektrale Strahldichte und Brillanz charakterisiert werden. Daher wurden neben Messungen mit einem absolut kalibrierten Spektrographen auch die Quellgrößen und Linienbreiten der wasserstoff- und heliumähnlichen Emissionslinien von Stickstoff bei N-Ly-alpha = 2,48 nm und N-He-alpha = 2,88 nm untersucht. Für eine gute Bildqualität sind neben einer gleichmäßigen, monochromatischen Ausleuchtung die Intensität in der Objektebene und eine Anpassung der numerischen Apertur von Kondensor und abbildender Optik wichtige Parameter. Daher wird an der laserinduzierten Plasmaquelle eine Zonenplatte als Kondensor verwendet. Diese bildet die Quelle 1:1 in die Objektebene ab und wirkt gleichzeitig als Linearmonochromator. Aufgrund der wellenlängenabhängigen Brennweite bietet sie zudem die Möglichkeit Spektromikroskopie zu betreiben. Da die emittierende Quellfläche der Entladungsquelle etwa vier Größenordnungen größer ist als die der laserinduzierten Plasmaquelle, wird an der Entladungsquelle ein mit Gold bedampfter, rotationssymmetrischer Ellipsoid für die Objektbeleuchtung verwendet. Angesichts einer geringeren Plasmatemperatur der Entladungsquelle und der damit verbundenen schwachen Emission der wasserstoffähnlichen Linien kann die He-alpha-Linie mit Hilfe eines Titan-Filters freigestellt werden. Anhand von Testobjekten und biologischen Proben wurde die Leistungsfähigkeit der beiden Konzepte gegenübergestellt. Während die räumliche Auflösung nach dem Rayleigh-Kriterium an der laserinduzierten Plasmaquelle durch Vibrationen im Aufbau auf ca. 70 nm begrenzt ist, konnte an der elektrischen Entladungsquelle eine nahezu beugungsbegrenzte Auflösung von 40 nm nachgewiesen werden. Die Belichtungszeiten bei 1000-facher Vergrößerung liegen bei der laserinduzierten Quelle je nach Objekt zwischen 10 und 30 Minuten. Durch die zehnfach höhere Intensität in der Objektebene ist die Belichtungszeit an der elektrischen Entladungsquelle entsprechend kürzer. Neben diesen Ergebnissen wird ein neues Anwendungsgebiet im Bereich organischer Halbleiter vorgestellt und erste Experimente präsentiert.
N2  - The presented work deals with the development and construction of a portable soft X-ray transmission microscope. It is specially designed for applications at laboratory sources but can also be operated at synchrotron facilities due to its modular layout. The microscope is based on a zone plate imaging system in conjunction with a CCD-camera as detector. The field of application ranges from the water-window spectral region between 2.3 nm and 4.4 nm wavelength to the extreme ultraviolet (wavelength < 20 nm). Vacuum prepared samples like lithographical test objects, diatoms or chemically fixed biological cells can be investigated. Two laboratory sources, a laser induced plasma based on a liquid nitrogen jet target and an electrical discharge source using hollow cathode electrode geometry, have been utilized. Due to the highly different source concepts the sources had to be characterized with regard to the radiant intensity and brilliance in order to determine an adequate condenser system. Therefore, beside measurements with an absolute calibrated spectrograph, the source sizes and line widths of the hydrogen- and helium-like emission lines of nitrogen at N-Ly-alpha = 2,48 nm and N-He-alpha = 2,88 nm have been investigated. For good image quality, parameters like uniform and monochromatic illumination of the object with high intensity and matched numerical aperture of condenser and imaging optics are important parameters. Therefore a zone plate is used as condenser at the laser induced plasma source. The zone plate images the source into the object plane and also acts as a linear monochromator. Due to the wavelength depending focal length of the zone plate the setup features spectral imaging capabilities. Since the emitting source area of the electrical discharge is about four orders of magnitude larger than the source size of the laser induced plasma, a gold-coated axially symmetric ellipsoid is used for object illumination at the discharge source. With respect to the lower plasma temperature of the discharge source and closely related weak emission of hydrogen like emission lines, the He-emission line can be selected by applying a titanium filter. The performance of both concepts is presented by imaging of test objects and biological cells. Whereas the spatial Rayleigh-resolution at the laser induced plasma source is limited to 70 nm due to vibrations, a nearly diffraction limited resolution of 40 nm can be demonstrated at the electrical discharge source. The exposure time at the laser induced plasma source at a magnification of 1000 depends on the object and ranges from 10 to 30 minutes. Due to a 10-times higher intensity in the object plane at the electrical discharge source the exposure time at this source is proportionate shorter. Besides performance tests a new field of application in organic semiconductors is described and first experiments are presented.
KW  - Röntgenmikroskop
KW  - Weiche Röntgenstrahlung
KW  - Transmission <Physik>
KW  - Wasserfenster
KW  - Labormikroskopie
KW  - Transmissionsmikroskopie
KW  - Fresnel-Zonenplatte
KW  - Lasererzeugtes Plasma
KW  - Elektrische Entladung
KW  - Table-top
KW  - soft x-ray
KW  - transmission microscopy
KW  - zone plate
KW  - water window
Y1  - 2010
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-54383
ER  -