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Genetische Diversität der humanen kommensalen Bakterienart Neisseria lactamica in epidemiologisch verknüpften Gruppen

Genetic Diversity of Neisseria lactamica Strains form Epidemiologically Defined Carriers

Please always quote using this URN: urn:nbn:de:bvb:20-opus-10142
  • Im Rahmen der von November 1999 bis März 2000 durchgeführten bayerischen Meningokokkenträgerstudie wurden in zahlreichen Kindergärten und Schulen der bayerischen Gemeinden Ansbach, Augsburg, Erlangen, Griesbach, Ingolstadt, München, Pfarrkirchen, Sonthofen und Weiden insgesamt 287 Neisseria lactamica-Stämme isoliert. 26 ausgewählte, aus den benachbarten Städten Augsburg, Ingolstadt und München stammende Isolate wurden einer Multi-Lokus-Sequenztypisierung (MLST) zur Untersuchung ihrer genetischen Diversität unterzogen. Dabei wurden sowohlIm Rahmen der von November 1999 bis März 2000 durchgeführten bayerischen Meningokokkenträgerstudie wurden in zahlreichen Kindergärten und Schulen der bayerischen Gemeinden Ansbach, Augsburg, Erlangen, Griesbach, Ingolstadt, München, Pfarrkirchen, Sonthofen und Weiden insgesamt 287 Neisseria lactamica-Stämme isoliert. 26 ausgewählte, aus den benachbarten Städten Augsburg, Ingolstadt und München stammende Isolate wurden einer Multi-Lokus-Sequenztypisierung (MLST) zur Untersuchung ihrer genetischen Diversität unterzogen. Dabei wurden sowohl Sequenzen der 3 Stoffwechselgene argF, recA und rho, als auch Sequenzen des 16S rRNA-Gens analysiert. Für das 16S rRNA-Gen fanden sich zehn, für argF fünf, für recA acht und für rho neun differente Allele. Auf Basis der vier analysierten Gene konnten 17 verschiedene Genotypen definiert werden, von denen zwölf nur einmal, fünf hingegen mehrmals vorkamen. Es ist anzunehmen, dass durch Sequenzierung der vier in dieser Studie verwendeten Gene bereits eine ausreichende Diskriminierung von Neisseria lactamica erfolgte, da Versuche eine weiterführende Diskriminierung durch Sequenzierung des porB-Gens zu erreichen, keine wesentlichen zusätzlichen Informationen erbrachten. Durch visuelle Inspektion der Sequenzen konnte bei allen vier Genloci das Überwiegen von Rekombinationsereignissen gegenüber Punktmutationen bestätigt werden, so dass für die Spezies Neisseria lactamica horizontaler Gentransfer anzunehmen ist. Da nur ein einziger Genotyp in zwei verschiedenen Städten beobachtet wurde, zeigen die Ergebnisse der vorliegenden Arbeit, dass eine klonale Ausbreitung von Neisseria lactamica nur dann nachweisbar ist, wenn eine epidemiologische Verknüpfung zwischen Trägern besteht.show moreshow less
  • We assessed the genetic diversity of 26 Neisseria lactamica strains from epidemiologically related sources, i.e., groups of kindergartens and primary schools in three Bavarian towns, by the partial sequencing of the argF, rho, recA, and 16S ribosomal genes. We found a total of 17 genotypes, of which 12 were found only in one strain. The genotypes comprised 5 alleles of the argF gene, 9 of rho, 8 of recA, and 10 of the 16S ribosomal DNA. Sequence analysis by determination of homoplasy ratios and split decomposition analysis revealed abundantWe assessed the genetic diversity of 26 Neisseria lactamica strains from epidemiologically related sources, i.e., groups of kindergartens and primary schools in three Bavarian towns, by the partial sequencing of the argF, rho, recA, and 16S ribosomal genes. We found a total of 17 genotypes, of which 12 were found only in one strain. The genotypes comprised 5 alleles of the argF gene, 9 of rho, 8 of recA, and 10 of the 16S ribosomal DNA. Sequence analysis by determination of homoplasy ratios and split decomposition analysis revealed abundant recombination within N. lactamica.show moreshow less

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Metadaten
Author: Marc Oberkötter
URN:urn:nbn:de:bvb:20-opus-10142
Document Type:Doctoral Thesis
Granting Institution:Universität Würzburg, Medizinische Fakultät
Faculties:Medizinische Fakultät / Institut für Hygiene und Mikrobiologie
Date of final exam:2004/07/06
Language:German
Year of Completion:2003
Dewey Decimal Classification:6 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / 61 Medizin und Gesundheit / 610 Medizin und Gesundheit
Tag:Homoplasie Testung; Neisseria lactamica; Neisseria meningitidis; Populationsstruktur; Split Decomposition Analyse
Homoplasy Ratio; Neisseria lactamica; Neisseria meningitidis; Split Decompostion Analysis
Release Date:2004/09/09
Advisor:Prof. Dr. med. Ulrich Vogel