Mining Genomes of Three Marine Sponge-Associated Actinobacterial Isolates for Secondary Metabolism
Zitieren Sie bitte immer diese URN: urn:nbn:de:bvb:20-opus-124887
- Here, we report the draft genome sequences of three actinobacterial isolates, Micromonospora sp. RV43, Rubrobacter sp. RV113, and Nocardiopsis sp. RV163 that had previously been isolated from Mediterranean sponges. The draft genomes were analyzed for the presence of gene clusters indicative of secondary metabolism using antiSMASH 3.0 and NapDos pipelines. Our findings demonstrated the chemical richness of sponge-associated actinomycetes and the efficacy of genome mining in exploring the genomic potential of sponge-derived actinomycetes.
| Autor(en): | Hannes Horn, Ute Hentschel, Usama Ramadan Abdelmohsen |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:bvb:20-opus-124887 |
| Dokumentart: | Artikel / Aufsatz in einer Zeitschrift |
| Institute der Universität: | Fakultät für Biologie / Julius-von-Sachs-Institut für Biowissenschaften |
| Sprache der Veröffentlichung: | Englisch |
| Titel des übergeordneten Werkes / der Zeitschrift (Englisch): | Genome Announcements |
| Erscheinungsjahr: | 2015 |
| Band / Jahrgang: | 3 |
| Heft / Ausgabe: | 5 |
| Seitenangabe: | e01106-15 |
| Originalveröffentlichung / Quelle: | Genome Announcements 3(5):e01106-15. doi:10.1128/genomeA.01106-15 |
| DOI: | https://doi.org/10.1128/genomeA.01106-15 |
| Allgemeine fachliche Zuordnung (DDC-Klassifikation): | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 59 Tiere (Zoologie) / 593 Wirbellose des Meeres und der Meeresküste |
| Datum der Freischaltung: | 26.01.2016 |
| Sammlungen: | Open-Access-Publikationsfonds / Förderzeitraum 2015 |
| Lizenz (Deutsch): |  CC BY: Creative-Commons-Lizenz: Namensnennung |