TY  - THES
A1  - Jäger, Daniel
T1  - Steuerungsfaktoren der Hangstabilität an Massenbewegungen im Fränkischen Schichtstufenland
T1  - Influences of slope stability on mass movements in northern Bavaria
N2  - Massenbewegungen zählen zu den am häufigsten auftretenden Naturgefahren in Deutschland. Dabei wird die von instabilen Hängen ausgehende Gefährdung speziell in den Regionen der Mittelgebirge regelmäßig unterschätzt. In Bezug auf die Verbreitung von Massenbewegungen in Mittelgebirgen stellt das süddeutsche Schichtstufenland einen besonderen Schwerpunkt dar. 
Die Disposition der Schichtstufenhänge beruht dabei in erster Linie auf einer Wechsellagerung wasserdurchlässiger und wasserstauender geologischer Schichten. Zu Hanginstabilitäten kommt es bevorzugt in Verbindung mit synthetischem Schichtfallen, steilen Hängen und erhöhten Niederschlägen. Rezente Massenbewegungen treten verstärkt in alten Rutsch- und/oder Hangschuttgebieten auf, da sich dort unkonsolidierte Rutschmassen leicht remobilisieren lassen. 
Das Ziel der vorliegenden Arbeit ist es, ein fundiertes Verständnis über Ursachen, Ablauf, Ausprägung und Prozesse von charakteristischen Massenbewegungen sowie dem aktuellen Aufbau der damit verbundenen Schichtstufenhänge in Nordbayern zu erlangen, um daraus grundlegende Einschätzungen zur Stabilität der Rutschgebiete treffen zu können. Neben den rutschungsrelevanten geologischen Schichten sind in diesem Zusammenhang insbesondere der Aufbau, die Eigenschaften und Charakteristika der Rutschmassen von besonderer Wichtigkeit, da besonders die bodenmechanischen und bodenphysikalischen Eigenschaften einen entscheidenden Faktor in Bezug auf die Hangstabilität darstellen. Entsprechend steht die umfassende Analyse dieser Sedimente im Fokus der Studien. 
Die Arbeiten betrachten dabei drei Hänge im fränkischen Schichtstufenland, an denen in der jüngeren Vergangenheit Massenbewegungen auftraten. Ein weiteres zentrales Auswahlkriterium war die Lage der Gebiete in den Schichtstufen der Fränkischen Alb und der westlich vorgelagerten Keuperstufe, wobei hinsichtlich Typ und Verbreitung möglichst charakteristische Massenbewegungen für die jeweilige Region ausgewählt wurden. Bei Ebermannstadt stand demnach die sog. Werkkalkstufe der Weißjura-Kalke im Fokus, nahe Wüstendorf die Sandsteine des Braunjura und bei Gailnau an der Frankenhöhe die Sandsteine des mittleren (Gips-) Keupers. 
Die Untersuchungen der Rutschungen und ihrer Sedimentcharakteristika erfolgte anhand eines speziell konzipierten Multimethodenansatzes mit zahlreichen, multiskaligen Gelände- und Laboranalysen. Neben klassischen, geomorphologischen Kartierungen an der Oberfläche wurden die sedimentologisch-morphologischen Verhältnisse des oberflächennahen Untergrundes in der Vertikalen durch geophysikalische Sondierungen analysiert. Eine Einschätzung der hydrologischen Verhältnisse der Rutschmassen erfolgte auf Basis von Messdaten aus Bodenfeuchtemonitoringsystemen, die an allen Untersuchungsstandorten installiert wurden. Für die bodenphysikalischen und -mechanischen Eigenschaften der Sedimente wurden Korngrößen, Konsistenzgrenzen, Plastizität, Gefüge und Lagerungsdichte untersucht und durch Tonmineralanalysen ergänzt. Die mikromorphologische Analyse von Dünnschliffen aus Rutschungssedimenten und den darin enthaltenen Deformationsstrukturen erweiterten den Gesamtansatz, ermöglichten neuartige Einblicke in die innere Architektur von Rutschmassen und erlaubten die Rekonstruktion von Bewegungsabläufen.
Durch die Arbeiten konnten an den Standorten Ebermannstadt und Gailnau komplexe, vielschichtige Massenbewegungen nachgewiesen werden. In der Rutschung bei Wüstendorf wurden nahezu ausschließlich unkonsolidierte Sedimente feinerer Korngrößen in einem Fließprozess verlagert. Primär erfolgte bei allen Rutschungen nachweislich die Remobilisierung alter Hangsedimente, wobei darüber hinaus auch stets bisher stabile Areale mit in die Bewegung einbezogen wurden.
Der sedimentologische Aufbau der Rutschmassen ist speziell im Falle großer und komplexer Rutschungen mitunter extrem heterogen. Im Zuge der Arbeiten konnten interne Makrostrukturen der Sedimentablagerungen, wie beispielsweise Rotationsflächen oder die Lage von Schollen detektiert werden. Trotz geophysikalisch und visuell auffälliger Beimischungen von Grobschutt, entfallen die größten Mengenanteile aber stets auf die veränderlich feste Feinmaterialfraktion. Im Rahmen der mikromorphologischen Untersuchungen der Sedimentdünnschliffe konnten auch in diesen Sedimenten zahlreiche Deformationsstrukturen nachgewiesen werden. 
Die Arbeit unterstreicht insgesamt die Bedeutung dieser bindigen Bestandteile für die (Re)Mobilisierung von Sedimentablagerungen. Die Stabilität des Feinmaterials steht dabei in engem Zusammenhang mit der hydraulischen Leitfähigkeit und dem Eintrag von Wasser, welches zu wechselnden Steifigkeiten der Sedimente führt. Im Falle erhöhter Bodenwassergehalte konnte eine Plastifizierung der Feinkornfraktion ermittelt werden. Kommt es zu einer starken Durchnässung des Untergrundes, führt dies zu einer Plastifizierung der tonigen Lagen und einer entsprechenden Reduktion der Scherfestigkeit, was letztlich zum Auslösen von Massenbewegungen führt. Neben den geologisch-sedimentologischen Voraussetzungen impliziert dies auch eine hohe Bedeutung der Niederschlagscharakteristika in Bezug auf das Auslösen rezenter Massenbewegungen. 
Die Bodenwassergehalte unterliegen im Jahresverlauf einer deutlichen saisonalen Variabilität. Während der Sommermonate wurden einheitlich niedrige Feuchtigkeitswerte im oberflächennahen Untergrund verzeichnet, was in erster Linie auf den Einfluss der Vegetation zurückzuführen ist. Auch sommerliche Starkregenereignisse besitzen unter diesen Bedingungen lediglich eine reduzierte Wirkung auf die Durchfeuchtung des Bodens. Demgegenüber erfolgt während der kalten Jahreszeit ein signifikanter Anstieg der Bodenwassergehalte. Neben den Regenfällen kommt vor allem der Schneeschmelze eine essentielle Bedeutung zu, da sie für eine zusätzliche und anhaltende Durchfeuchtung der Schichten besonders im Spätwinter bzw. Frühjahr sorgt. Entsprechend besteht vor allem während der Monate Februar bis April eine erhöhte Disposition für Rutschungen in Nordbayern. Im Hinblick auf die Niederschlagssummen gingen den Rutschungen in den Untersuchungsgebieten zwar keine besonders extremen Ereignisse, aber durchaus deutlich überdurchschnittliche Niederschlagssummen voraus, weshalb unter Berücksichtigung der im Zuge des Klimawandels ansteigenden Winterniederschläge von einer generell verstärkten Rutschungsaktivität auszugehen ist. 
Vergleiche mit den Daten aus zahlreichen Übersichtskartierungen von Rutschungen aus den fränkischen Schichtstufengebieten verdeutlichen, dass die ermittelten Ergebnisse auf eine Vielzahl der verzeichneten Rutschungen übertragbar sind.
N2  - Mass movements are considered common natural hazards in Germany. Nevertheless, the endangerments of slope instabilities are frequently neglected. This applies particularly for low mountain areas such as the cuesta landscape in southwestern Germany, although the slopes are highly prone to landslides. 
In this region the susceptibility for mass movements is mainly based on a bipartite geological structure with permeable and impermeable layers. These conditions, in combination with layer dipping, steep slope gradients and high precipitation rates lead to slope failures and therefore mass movements. Recent mass movements frequently appear in slope areas containing old slide masses or debris accumulations due to a remobilization of unconsolidated sediments.
This work aims to collect precise information on triggers, movements, characteristics and processes of landslides in northern Bavaria in order to achieve a profound knowledge on the specific slope and sediment stabilities. Besides relevant geological layers, characteristics and structures of landslide sediment deposits are of great importance in this context, as those factors tend to control the stability of a slope in general. Therefore, the main focus of this work is set on a comprehensive analysis of these sediments. 
Studies were carried out on three slopes of the Franconian cuesta, which were affected by landslides in the recent past. Further criteria for their selection were an equally spatial distribution on the cuesta of the Franconian Alb and the hills of the Frankenhöhe. Additionally, the selected objects represent characteristic mass movements for their specific region, especially in terms of the type of movement.
In accordance with these prerequisites, study areas are located near Ebermannstadt (Franconian Alb) for investigating the Upper Jurassic limestone layers of the Oxfordian, near Wüstendorf (Franconian Alb) in terms of Middle Jurassic sandstone layers (Aalenian) and near Gailnau (Frankenhöhe) for the Late Triassic sandstones of the Carnian. 
The landslide and its sediment characteristics were investigated using a multiscale and multimethod approach containing different investigations both in the field and in the laboratory. Classical geomorphological mappings investigated the morphology of the landslides and the adjacent slopes. Geophysical soundings provide a vertical insight into the architecture of the subsurface. Soil moisture monitoring systems were installed in all three study areas, aiming to address the hydrological conditions of the slide masses. In order to determine soil physical and basic mechanical characteristica, the respective grain size, Atterberg limits, plasticity, structure and bulk density were obtained, complemented by an analysis of clay minerals. Furthermore, micromorphological analyses of deformation structures in thin sections of landslide sediments provide an additional element for studying the inner architecture of the slide masses and for reconstructing specific mass movement processes.
The investigations proved the existence of complex landslides in Ebermannstadt and Gailnau, consisting of different types of movement processes in specific areas of the slope. Near Wüstendorf, a flowing process relocated fine grained and mostly unconsolidated sediments. All movements primarily remobilized old slope sediments, however, movements also affected previously undisturbed layers adjacent to the former accumulations. 
In case of those large and complex landslides, the specific accumulations provide a very heterogeneous sedimentology. Investigations revealed the existence of internal macrostructures, such as rotational slip surfaces or slide blocks in the sediment accumulations. Although blocks and debris were visible and detected by geophysical soundings, slide masses were still dominated by fine grained material. During micromorphological analyses of thin sections, several deformation structures were determined in those clayey and silty sediments. 
The studies generally emphasize the importance of this cohesive fine material concerning a potential (re)mobilization of slope sediments. Depending on the specific hydraulic conductivity of their cohesive sediments, solidity of slide masses is subject to change under varying amounts of water intake. An increased inflow of water leads to more plastic conditions and behaviours of the unconsolidated slide mass. An increasing plastification of the clayey components causes a decrease of shear strength, which results in mass movements. This implies the importance of hydrological parameters and the relevance of precipitation characteristics beside the typical geological-sedimentological factors for triggering mass movements.  
Over the course of one year, soil water contents show a significant seasonal variability. Generally low values during summers indicate a strong influence of vegetation in the surface near layers. Under these circumstances, even heavy rainfalls generate a significantly reduced effect on soil moisture. The highest soil water contents were generally obtained during winter, not only because of rainfalls without the hampering of vegetation, but because of snow melting. Between February and April, snow melting provides an important additional input of water for the subsurface. This results in an increased disposition for mass movements in northern Bavaria during these months. In the case of the investigated landslides, precipitation rates in the months before the events unveiled above average precipitation rates but no extraordinary (high) values. Nonetheless, with regard to climate change and the effects of higher precipitation sums, especially in winter, this leads to the expectation of an increasing landslide activity.  
As characteristics of other landslide areas, which were mapped along the Franconian cuesta, revealed, most results obtained during this study are comparable to numerous landslide objects in this region.
KW  - Geografikum
KW  - Massenbewegungen
KW  - Hangstabilität
KW  - Fränkischens Schichtstufenland
Y1  - 2016
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-139140
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Koch, Oliver
A1  - Cappel, Daniel
A1  - Nocker, Monika
A1  - Jäger, Timo
A1  - Flohé, Leopold
A1  - Sotriffer, Christoph A.
A1  - Selzer, Paul M.
T1  - Molecular Dynamics Reveal Binding Mode of Glutathionylspermidine by Trypanothione Synthetase
JF  - PLoS ONE
N2  - The trypanothione synthetase (TryS) catalyses the two-step biosynthesis of trypanothione from spermidine and glutathione and is an attractive new drug target for the development of trypanocidal and antileishmanial drugs, especially since the structural information of TryS from Leishmania major has become available. Unfortunately, the TryS structure was solved without any of the substrates and lacks loop regions that are mechanistically important. This contribution describes docking and molecular dynamics simulations that led to further insights into trypanothione biosynthesis and, in particular, explains the binding modes of substrates for the second catalytic step. The structural model essentially confirm previously proposed binding sites for glutathione, ATP and two \(Mg^{2+}\) ions, which appear identical for both catalytic steps. The analysis of an unsolved loop region near the proposed spermidine binding site revealed a new pocket that was demonstrated to bind glutathionylspermidine in an inverted orientation. For the second step of trypanothione synthesis glutathionylspermidine is bound in a way that preferentially allows \(N^1\)-glutathionylation of \(N^8\)-glutathionylspermidine, classifying \(N^8\)-glutathionylspermidine as the favoured substrate. By inhibitor docking, the binding site for \(N^8\)-glutathionylspermidine was characterised as druggable.
KW  - purification
KW  - crithidia fasciulata
KW  - trypanosoma cruzi
KW  - RESP model
KW  - biosynthesis
KW  - chemotherapy
KW  - metabolism
KW  - brucei
KW  - system
KW  - leishmaniasis
Y1  - 2013
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-131070
VL  - 8
IS  - 2
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Glöggler, Julia C.
A1  - Hellmann, Daniel
A1  - Von Manstein, Maja
A1  - Jäger, Rudolph
A1  - Repky, Stefan
A1  - Beyersmann, Jan
A1  - Lapatki, Bernd G.
T1  - Motor learning might contribute to a therapeutic anterior shift of the habitual mandibular position—An exploratory study
JF  - Journal of Oral Rehabilitation
N2  - Background
Passive mandibular advancement with functional appliances is commonly used to treat juvenile patients with mandibular retrognathism.
Objective
The aim of this study was to investigate whether active repetitive training of the mandible into an anterior position would result in a shift of the habitual mandibular position (HMP).
Methods
Twenty adult healthy subjects were randomly assigned to one of two groups: a training group receiving six supervised functional training sessions of 10 min each and a control group without training. Bonded lateral biteplates disengaged occlusion among both groups throughout the 15‐day experiment. Customised registration‐training appliances consisted of a maxillary component with an anterior plane and a mandibular component with an attached metal sphere. Training sessions consisted of repeated mouth‐opening/closing cycles (frequency: 30/min) to hit an anteriorly positioned hemispherical target notch with this metal sphere. The HMP was registered at defined times during the experiment.
Results
The HMP in the training group showed a statistically significant anterior shift of 1.6 mm (interquartile range [IQR]: 1.2 mm), compared with a significant posterior shift of −0.8 mm (IQR: 2.8 mm) in the control group (p < .05). Although the anterior shift among the training group showed a partial relapse 4 days after the first training block, it then advanced slightly in the 4‐day interval after the second training block, which might indicate neuroplasticity of the masticatory motor system.
Conclusions
Motor learning by repetitive training of the mandible into an anterior position might help to improve the results of functional appliance therapy among patients with mandibular retrognathism.
KW  - mandibular advancement
KW  - mandibular shift
KW  - masticatory system
KW  - motor training
KW  - mandibular resting position
KW  - habitual mandibular position
KW  - masticatory muscles
KW  - motor skill learning
Y1  - 2021
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-262644
VL  - 48
IS  - 8
SP  - 891
EP  - 900
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Blein, Sophie
A1  - Bardel, Claire
A1  - Danjean, Vincent
A1  - McGuffog, Lesley
A1  - Healay, Sue
A1  - Barrowdale, Daniel
A1  - Lee, Andrew
A1  - Dennis, Joe
A1  - Kuchenbaecker, Karoline B.
A1  - Soucy, Penny
A1  - Terry, Mary Beth
A1  - Chung, Wendy K.
A1  - Goldgar, David E.
A1  - Buys, Saundra S.
A1  - Janavicius, Ramunas
A1  - Tihomirova, Laima
A1  - Tung, Nadine
A1  - Dorfling, Cecilia M.
A1  - van Rensburg, Elizabeth J.
A1  - Neuhausen, Susan L.
A1  - Ding, Yuan Chun
A1  - Gerdes, Anne-Marie
A1  - Ejlertsen, Bent
A1  - Nielsen, Finn C.
A1  - Hansen, Thomas V. O.
A1  - Osorio, Ana
A1  - Benitez, Javier
A1  - Andreas Conejero, Raquel
A1  - Segota, Ena
A1  - Weitzel, Jeffrey N.
A1  - Thelander, Margo
A1  - Peterlongo, Paolo
A1  - Radice, Paolo
A1  - Pensotti, Valeria
A1  - Dolcetti, Riccardo
A1  - Bonanni, Bernardo
A1  - Peissel, Bernard
A1  - Zaffaroni, Daniela
A1  - Scuvera, Giulietta
A1  - Manoukian, Siranoush
A1  - Varesco, Liliana
A1  - Capone, Gabriele L.
A1  - Papi, Laura
A1  - Ottini, Laura
A1  - Yannoukakos, Drakoulis
A1  - Konstantopoulou, Irene
A1  - Garber, Judy
A1  - Hamann, Ute
A1  - Donaldson, Alan
A1  - Brady, Angela
A1  - Brewer, Carole
A1  - Foo, Claire
A1  - Evans, D. Gareth
A1  - Frost, Debra
A1  - Eccles, Diana
A1  - Douglas, Fiona
A1  - Cook, Jackie
A1  - Adlard, Julian
A1  - Barwell, Julian
A1  - Walker, Lisa
A1  - Izatt, Louise
A1  - Side, Lucy E.
A1  - Kennedy, M. John
A1  - Tischkowitz, Marc
A1  - Rogers, Mark T.
A1  - Porteous, Mary E.
A1  - Morrison, Patrick J.
A1  - Platte, Radka
A1  - Eeles, Ros
A1  - Davidson, Rosemarie
A1  - Hodgson, Shirley
A1  - Cole, Trevor
A1  - Godwin, Andrew K
A1  - Isaacs, Claudine
A1  - Claes, Kathleen
A1  - De Leeneer, Kim
A1  - Meindl, Alfons
A1  - Gehrig, Andrea
A1  - Wappenschmidt, Barbara
A1  - Sutter, Christian
A1  - Engel, Christoph
A1  - Niederacher, Dieter
A1  - Steinemann, Doris
A1  - Plendl, Hansjoerg
A1  - Kast, Karin
A1  - Rhiem, Kerstin
A1  - Ditsch, Nina
A1  - Arnold, Norbert
A1  - Varon-Mateeva, Raymonda
A1  - Schmutzler, Rita K.
A1  - Preisler-Adams, Sabine
A1  - Markov, Nadja Bogdanova
A1  - Wang-Gohrke, Shan
A1  - de Pauw, Antoine
A1  - Lefol, Cedrick
A1  - Lasset, Christine
A1  - Leroux, Dominique
A1  - Rouleau, Etienne
A1  - Damiola, Francesca
A1  - Dreyfus, Helene
A1  - Barjhoux, Laure
A1  - Golmard, Lisa
A1  - Uhrhammer, Nancy
A1  - Bonadona, Valerie
A1  - Sornin, Valerie
A1  - Bignon, Yves-Jean
A1  - Carter, Jonathan
A1  - Van Le, Linda
A1  - Piedmonte, Marion
A1  - DiSilvestro, Paul A.
A1  - de la Hoya, Miguel
A1  - Caldes, Trinidad
A1  - Nevanlinna, Heli
A1  - Aittomäki, Kristiina
A1  - Jager, Agnes
A1  - van den Ouweland, Ans M. W.
A1  - Kets, Carolien M.
A1  - Aalfs, Cora M.
A1  - van Leeuwen, Flora E.
A1  - Hogervorst, Frans B. L.
A1  - Meijers-Heijboer, Hanne E. J.
A1  - Oosterwijk, Jan C.
A1  - van Roozendaal, Kees E. P.
A1  - Rookus, Matti A.
A1  - Devilee, Peter
A1  - van der Luijt, Rob B.
A1  - Olah, Edith
A1  - Diez, Orland
A1  - Teule, Alex
A1  - Lazaro, Conxi
A1  - Blanco, Ignacio
A1  - Del Valle, Jesus
A1  - Jakubowska, Anna
A1  - Sukiennicki, Grzegorz
A1  - Gronwald, Jacek
A1  - Spurdle, Amanda B.
A1  - Foulkes, William
A1  - Olswold, Curtis
A1  - Lindor, Noralene M.
A1  - Pankratz, Vernon S.
A1  - Szabo, Csilla I.
A1  - Lincoln, Anne
A1  - Jacobs, Lauren
A1  - Corines, Marina
A1  - Robson, Mark
A1  - Vijai, Joseph
A1  - Berger, Andreas
A1  - Fink-Retter, Anneliese
A1  - Singer, Christian F.
A1  - Rappaport, Christine
A1  - Geschwantler Kaulich, Daphne
A1  - Pfeiler, Georg
A1  - Tea, Muy-Kheng
A1  - Greene, Mark H.
A1  - Mai, Phuong L.
A1  - Rennert, Gad
A1  - Imyanitov, Evgeny N.
A1  - Mulligan, Anna Marie
A1  - Glendon, Gord
A1  - Andrulis, Irene L.
A1  - Tchatchou, Andrine
A1  - Toland, Amanda Ewart
A1  - Pedersen, Inge Sokilde
A1  - Thomassen, Mads
A1  - Kruse, Torben A.
A1  - Jensen, Uffe Birk
A1  - Caligo, Maria A.
A1  - Friedman, Eitan
A1  - Zidan, Jamal
A1  - Laitman, Yael
A1  - Lindblom, Annika
A1  - Melin, Beatrice
A1  - Arver, Brita
A1  - Loman, Niklas
A1  - Rosenquist, Richard
A1  - Olopade, Olufunmilayo I.
A1  - Nussbaum, Robert L.
A1  - Ramus, Susan J.
A1  - Nathanson, Katherine L.
A1  - Domchek, Susan M.
A1  - Rebbeck, Timothy R.
A1  - Arun, Banu K.
A1  - Mitchell, Gillian
A1  - Karlan, Bethy Y.
A1  - Lester, Jenny
A1  - Orsulic, Sandra
A1  - Stoppa-Lyonnet, Dominique
A1  - Thomas, Gilles
A1  - Simard, Jacques
A1  - Couch, Fergus J.
A1  - Offit, Kenenth
A1  - Easton, Douglas F.
A1  - Chenevix-Trench, Georgia
A1  - Antoniou, Antonis C.
A1  - Mazoyer, Sylvie
A1  - Phelan, Catherine M.
A1  - Sinilnikova, Olga M.
A1  - Cox, David G.
T1  - An original phylogenetic approach identified mitochondrial haplogroup T1a1 as inversely associated with breast cancer risk in BRCA2 mutation carriers
JF  - Breast Cancer Research
N2  - Introduction: 
Individuals carrying pathogenic mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes have a high lifetime risk of breast cancer. BRCA1 and BRCA2 are involved in DNA double-strand break repair, DNA alterations that can be caused by exposure to reactive oxygen species, a main source of which are mitochondria. Mitochondrial genome variations affect electron transport chain efficiency and reactive oxygen species production. Individuals with different mitochondrial haplogroups differ in their metabolism and sensitivity to oxidative stress. Variability in mitochondrial genetic background can alter reactive oxygen species production, leading to cancer risk. In the present study, we tested the hypothesis that mitochondrial haplogroups modify breast cancer risk in BRCA1/2 mutation carriers. 

Methods: 
We genotyped 22,214 (11,421 affected, 10,793 unaffected) mutation carriers belonging to the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 for 129 mitochondrial polymorphisms using the iCOGS array. Haplogroup inference and association detection were performed using a phylogenetic approach. ALTree was applied to explore the reference mitochondrial evolutionary tree and detect subclades enriched in affected or unaffected individuals. 

Results: 
We discovered that subclade T1a1 was depleted in affected BRCA2 mutation carriers compared with the rest of clade T (hazard ratio (HR) = 0.55; 95% confidence interval (CI), 0.34 to 0.88; P = 0.01). Compared with the most frequent haplogroup in the general population (that is, H and T clades), the T1a1 haplogroup has a HR of 0.62 (95% CI, 0.40 to 0.95; P = 0.03). We also identified three potential susceptibility loci, including G13708A/rs28359178, which has demonstrated an inverse association with familial breast cancer risk. 

Conclusions:
This study illustrates how original approaches such as the phylogeny-based method we used can empower classical molecular epidemiological studies aimed at identifying association or risk modification effects.
KW  - single-nucleotide polymorphisms
KW  - genetic modifiers
KW  - oxidative stress
KW  - consortium
KW  - multiple diseases
KW  - DNA
KW  - haplogroups
KW  - susceptibility
KW  - Ovarian
KW  - variants
Y1  - 2015
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-145458
VL  - 17
IS  - 61
ER  -