TY  - THES
A1  - Zink, Johannes
T1  - Algorithms for Drawing Graphs and Polylines with Straight-Line Segments
T1  - Algorithmen zum Zeichnen von Graphen und Polygonzügen mittels Strecken
N2  - Graphs provide a key means to model relationships between entities.
They consist of vertices representing the entities,
and edges representing relationships between pairs of entities.
To make people conceive the structure of a graph,
it is almost inevitable to visualize the graph.
We call such a visualization a graph drawing.
Moreover, we have a straight-line graph drawing
if each vertex is represented as a point
(or a small geometric object, e.g., a rectangle)
and each edge is represented as a line segment between its two vertices.
A polyline is a very simple straight-line graph drawing,
where the vertices form a sequence according to which the vertices are connected by edges.
An example of a polyline in practice is a GPS trajectory.
The underlying road network, in turn, can be modeled as a graph.

This book addresses problems that arise
when working with straight-line graph drawings and polylines.
In particular, we study algorithms 
for recognizing certain graphs representable with line segments,
for generating straight-line graph drawings,
and for abstracting polylines.

In the first part, we first examine,
how and in which time we can decide
whether a given graph is a stick graph,
that is, whether its vertices can be represented as
vertical and horizontal line segments on a diagonal line,
which intersect if and only if there is an edge between them.
We then consider the visual complexity of graphs.
Specifically, we investigate, for certain classes of graphs,
how many line segments are necessary for any straight-line graph drawing,
and whether three (or more) different slopes of the line segments
are sufficient to draw all edges.
Last, we study the question,
how to assign (ordered) colors to the vertices of a graph
with both directed and undirected edges
such that no neighboring vertices get the same color
and colors are ascending along directed edges.
Here, the special property of the considered graph is
that the vertices can be represented as intervals
that overlap if and only if there is an edge between them.

The latter problem is motivated by an application
in automated drawing of cable plans with vertical and horizontal line segments,
which we cover in the second part.
We describe an algorithm that
gets the abstract description of a cable plan as input,
and generates a drawing that takes into account
the special properties of these cable plans,
like plugs and groups of wires.
We then experimentally evaluate the quality of the resulting drawings.

In the third part, we study the problem of abstracting (or simplifying)
a single polyline and a bundle of polylines.
In this problem, the objective is to remove as many vertices as possible from the given polyline(s)
while keeping each resulting polyline sufficiently similar to its original course
(according to a given similarity measure).
N2  - Graphen stellen ein wichtiges Mittel dar,
um Beziehungen zwischen Objekten zu modellieren.
Sie bestehen aus Knoten, die die Objekte repräsentieren,
und Kanten, die Beziehungen zwischen Paaren von Objekten abbilden.
Um Menschen die Struktur eines Graphen zu vermitteln,
ist es nahezu unumgänglich den Graphen zu visualisieren.
Eine solche Visualisierung nennen wir Graphzeichnung.
Eine Graphzeichnung ist geradlinig, wenn jeder Knoten als ein Punkt
(oder ein kleines geometrisches Objekt, z. B. ein Rechteck)
und jede Kante als eine Strecke zwischen ihren beiden Knoten dargestellt ist.
Eine sehr einfache geradlinige Graphzeichnung, bei der alle Knoten eine
Folge bilden, entlang der die Knoten durch Kanten verbunden sind,
nennen wir Polylinie.
Ein Beispiel für eine Polylinie in der Praxis ist eine GPS-Trajektorie.
Das zugrundeliegende Straßennetzwerk wiederum kann als Graph repräsentiert werden.

In diesem Buch befassen wir uns mit Fragen,
die sich bei der Arbeit mit geradlinigen Graphzeichnungen und Polylinien stellen.
Insbesondere untersuchen wir Algorithmen
zum Erkennen von bestimmten mit Strecken darstellbaren Graphen,
zum Generieren von geradlinigen Graphzeichnungen
und zum Abstrahieren von Polylinien.

Im ersten Teil schauen wir uns zunächst an,
wie und in welcher Zeit wir entscheiden können,
ob ein gegebener Graph ein Stickgraph ist,
das heißt, ob sich seine Knoten als
vertikale und horizontale Strecken auf einer diagonalen Geraden darstellen lassen,
die sich genau dann schneiden, wenn zwischen ihnen eine Kante liegt.
Anschließend betrachten wir die visuelle Komplexität von Graphen.
Konkret untersuchen wir für bestimmte Graphklassen,
wie viele Strecken für jede geradlinige Graphzeichnung notwendig sind,
und, ob drei (oder mehr) verschiedene Streckensteigungen
ausreichend sind, um alle Kanten zu zeichnen.
Zuletzt beschäftigen wir uns mit der Frage,
wie wir den Knoten eines Graphen mit gerichteten und ungerichteten Kanten
(geordnete) Farben zuweisen können,
sodass keine benachbarten Knoten dieselbe Farbe haben und Farben
entlang gerichteter Kanten aufsteigend sind.
Hierbei ist die spezielle Eigenschaft der betrachteten Graphen,
dass sich die Knoten als Intervalle darstellen lassen, die sich genau
dann überschneiden, wenn eine Kanten zwischen ihnen verläuft.

Das letztgenannte Problem ist motiviert von einer Anwendung
beim automatisierten Zeichnen von Kabelplänen mit vertikalen und horizontalen Streckenverläufen,
womit wir uns im zweiten Teil befassen.
Wir beschreiben einen Algorithmus,
welcher die abstrakte Beschreibung eines Kabelplans entgegennimmt
und daraus eine Zeichnung generiert,
welche die speziellen Eigenschaften dieser Kabelpläne,
wie Stecker und Gruppen von zusammengehörigen Drähten, berücksichtigt.
Anschließend evaluieren wir die Qualität der so erzeugten Zeichnungen experimentell.

Im dritten Teil befassen wir uns
mit dem Abstrahieren bzw. Vereinfachen einer einzelnen Polylinie
und eines Bündels von Polylinien.
Bei diesem Problem sollen aus einer oder mehreren gegebenen Polylinie(n)
so viele Knoten wie möglich entfernt werden, wobei
jede resultierende Polylinie ihrem ursprünglichen Verlauf
(nach einem gegeben Maß) hinreichend ähnlich bleiben muss.
KW  - Graphenzeichnen
KW  - Algorithmische Geometrie
KW  - Algorithmus
KW  - Algorithmik
KW  - Polygonzüge
KW  - graph drawing
KW  - complexity
KW  - algorithms
KW  - straight-line segments
KW  - polylines
KW  - graphs
KW  - Strecken
KW  - Graphen
Y1  - 2024
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-354756
ER  - 
TY  - THES
A1  - Hutterer, née Herzog, Katharina
T1  - Treatment-like use of discrimination training to reduce generalization of conditioned fear
T1  - Behandlungsähnlicher Einsatz eines Diskriminationstrainings zur Verringerung von Generalisierung konditionierter Furcht
N2  - Anxiety patients overgeneralize fear, also because of an inability to perceptually discriminate threat and safety signals. Therefore, some studies have developed discrimination training that successfully reduced the occurrence of fear generalization. The present work is the first to take a treatment-like approach by using discrimination training after generalization has occurred. Therefore, two studies were conducted with healthy participants using the same fear conditioning and generalization paradigm, with two faces as conditioned stimuli (CSs), and four facial morphs between CSs as generalization stimuli (GSs). Only one face (CS+) was followed by a loud scream (unconditioned stimulus, US). In Study 1, participants underwent either fear-relevant (discriminating faces) or fear-irrelevant discrimination training (discriminating width of lines) or a non-discriminative control training between the two generalization tests, each with or without feedback (n = 20 each). Generalization of US expectancy was reduced more effectively by fear-relevant compared to fear-irrelevant discrimination training. However, neither discrimination training was more effective than non-discriminative control training. Moreover, feedback reduced generalization of US expectancy only in discrimination training. Study 2 was designed to replicate the effects of the discrimination-training conditions in a large sample (N = 244) and examine their benefits in individuals at risk for anxiety disorders. Again, feedback reduced fear generalization particularly well for US expectancy. Fear relevance was not confirmed to be particularly fear-reducing in healthy participants, but may enhance training effects in individuals at risk of anxiety disorder. In summary, this work provides evidence that existing fear generalization can be reduced by discrimination training, likely involving several (higher-level) processes besides perceptual discrimination (e.g., motivational mechanisms in feedback conditions). Its use may be promising as part of individualized therapy for patients with difficulty discriminating similar stimuli.
N2  - Angstpatienten übergeneralisieren Furcht, unter anderem weil sie nicht in der Lage sind, Bedrohungs- und Sicherheitsreize zu unterscheiden. Daher wurde in einigen Studien ein Diskriminationstraining entwickelt, das das Auftreten von Furchtgeneralisierung erfolgreich reduzierte. Die vorliegende Arbeit ist die erste, die einen behandlungsähnlichen Ansatz verfolgt, indem sie Diskriminationstraining einsetzt, nachdem die Generalisierung stattgefunden hat. Zu diesem Zweck wurden zwei Studien mit gesunden Teilnehmern durchgeführt, die dasselbe Paradigma zur Furchtkonditionierung und -generalisierung verwendeten, mit zwei Gesichtern als konditionierte Stimuli (CSs) und vier Gesichtsmorphen zwischen den CS als Generalisierungsstimuli (GSs). Nur auf ein Gesicht (CS+) folgte ein lauter Schrei (unkonditionierter Stimulus, US). In Studie 1 durchliefen die Teilnehmer zwischen den beiden Generalisierungstests entweder ein furchtrelevantes (Unterscheidung von Gesichtern) oder ein furchtirrelevantes Diskriminationstraining (Unterscheidung der Breite von Linien) oder ein non-diskriminatives Kontrolltraining, jeweils mit oder ohne Feedback (jeweils n = 20). Die Generalisierung der US-Erwartung wurde durch furchtrelevante im Vergleich zu furchtirrelevanten Diskriminationstrainings effektiver reduziert. Keines der beiden Diskriminationstrainings war jedoch effektiver als ein non-diskriminatives Kontrolltraining. Darüber hinaus verringerte das Feedback die Generalisierung der US-Erwartung nur im Diskriminationstraining. Studie 2 sollte die Effekte der Diskriminationstrainingsbedingungen in einer großen Stichprobe (N = 244) replizieren und ihre Effekte bei Individuen mit einem Risiko für Angststörungen untersuchen. Auch hier reduzierte das Feedback die Furchtgeneralisierung besonders gut für die US-Erwartung. Die Furchtrelevanz erwies sich bei gesunden Teilnehmern nicht als besonders furchtreduzierend, könnte aber die Trainingseffekte bei Personen mit einem Risiko einer Angststörung verstärken. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass diese Arbeit Hinweise dafür liefert, dass bestehende Furchtgeneralisierung durch ein Diskriminationstraining reduziert werden kann, wobei wahrscheinlich mehrere Prozesse (höherer Ordnung) neben der perzeptuellen Diskrimination beteiligt sind (z. B. motivationale Mechanismen in den Feedback Bedingungen). Die Anwendung des Diskriminationstrainings als Teil einer individualisierten Therapie für Patienten mit Schwierigkeiten bei der Unterscheidung ähnlicher Stimuli könnte vielversprechend sein.
KW  - Furcht
KW  - Generalisierung
KW  - Diskriminationslernen
KW  - classical conditioning
KW  - fear generalization
KW  - discrimination training
KW  - Diskriminationstraining
KW  - Klassische Konditionierung
Y1  - 2024
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-317286
ER  - 
TY  - THES
A1  - Weigel [verh. Hoffmann], Mathis Leonard
T1  - Thrombozytenfunktionsanalyse als potenzielles Instrument zur Früherkennung von Sepsis
T1  - Platelet function analysis as a potential tool for early sepsis diagnosis
N2  - Sepsis ist ein häufiges und akut lebensbedrohliches Syndrom, das eine Organfunktionsstörung in Folge einer dysregulierten Immunantwort auf eine Infektion beschreibt. Eine frühzeitige Diagnosestellung und Therapieeinleitung sind von zentraler Bedeutung für das Überleben der Patient:innen. In einer Pilotstudie konnte unsere Forschungsgruppe mittels Durchflusszytometrie eine ausgeprägte Hyporeaktivität der Thrombozyten bei Sepsis nachweisen, die einen potenziell neuen Biomarker zur Sepsis-Früherkennung darstellt. Zur Evaluation des Ausmaßes und Entstehungszeitpunktes der detektierten Thrombozytenfunktionsstörung wurden im Rahmen der vorliegenden Arbeit zusätzlich zu Patient:innen mit Sepsis (SOFA-Score ≥ 2; n=13) auch hospitalisierte Patient:innen mit einer Infektion ohne Sepsis (SOFA-Score < 2; n=12) rekrutiert. Beide Kohorten wurden zu zwei Zeitpunkten (t1: <24h; t2: Tag 5-7) im Krankheitsverlauf mittels Durchflusszytometrie und PFA-200 untersucht und mit einer gesunden Kontrollgruppe (n=28) verglichen. 
Phänotypische Auffälligkeiten der Thrombozyten bei Sepsis umfassten: (i) eine veränderte Expression verschiedener Untereinheiten des GPIb-IX-V-Rezeptorkomplexes, die auf ein verstärktes Rezeptor-Shedding hindeutet; (ii) ein ausgeprägtes Mepacrin-Beladungsdefizit, das auf eine zunehmend reduzierte Anzahl von δ-Granula entlang des Infektion-Sepsis Kontinuums hinweist; (iii) eine Reduktion endständig gebundener Sialinsäure im Sinne einer verstärkten Desialylierung. Die funktionelle Analyse der Thrombozyten bei Sepsis ergab bei durchflusszytometrischer Messung der Integrin αIIbβ3-Aktivierung (PAC-1-Bindung) eine ausgeprägte generalisierte Hyporeaktivität gegenüber multiplen Agonisten, die abgeschwächt bereits bei Infektion nachweisbar war und gemäß ROC-Analysen gut zwischen Infektion und Sepsis diskriminierte (AUC >0.80 für alle Agonisten). Im Gegensatz dazu zeigten Thrombozyten bei Sepsis und Analyse mittels PFA-200 unter Einfluss physiologischer Scherkräfte eine normale bis gar beschleunigte Aggregation. 
Die Reaktivitätsmessung von Thrombozyten mittels Durchflusszytometrie stellt weiterhin einen vielversprechenden Biomarker für die Sepsis-Früherkennung dar. Für weitere Schlussfolgerungen ist jedoch eine größere Kohorte erforderlich. In nachfolgenden Untersuchungen sollten zudem mechanistische Ursachen der beschriebenen phänotypischen und funktionellen Auffälligkeiten von Thrombozyten bei Infektion und Sepsis z.B. mittels Koinkubationsexperimenten untersucht werden.
N2  - Sepsis is a frequent and life-threatening condition that describes organ dysfunction resulting from a dysregulated host immune response to infection. Early diagnosis and treatment are essential to improve patient survival. In a previous pilot study with sepsis patients, our research identified a severe platelet hyporeactivity using flow cytometry which could become a potential new biomarker for early sepsis diagnosis. To evaluate onset and extend of the detected platelet dysfunction in this study, we extended our patient cohort in addition to sepsis (SOFA-score ≥2; n=13) also to hospitalized patients with infection without sepsis (SOFA-score <2; n=12). Both cohorts were assessed at two time points during the disease (t1: <24h; t2: day 5-7) by flow cytometry and PFA-200 and compared with a healthy control group (n=28). 
Platelet phenotypic abnormalities during sepsis included: (i) altered expression of subunits of the GPIb-IX-V receptor complex, pointing to increased receptor shedding; (ii) a severe mepacrine loading deficit, indicating an increasingly reduced number of δ-granules along the infection-sepsis continuum; (iii) a reduction of terminally bound sialic acid, suggesting increased desialylation. Functional analysis of platelets in sepsis revealed a marked and generalized hyporeactivity toward multiple agonists when integrin αIIbβ3 activation (PAC-1 binding) was measured by flow cytometry, which was already to a lesser extend present in patients with infection and discriminated well between infection and sepsis according to ROC analysis (AUC >0.80 for all agonists). In contrast, platelets from septic patients showed normal to even accelerated aggregation when measured under flow condition and physiological shear forces by PFA-200. 
Analysis of platelet reactivity by flow cytometry remains a promising biomarker for early sepsis detection, but a larger cohort is needed for further conclusions. In subsequent studies, mechanistic causes of the described alterations in platelet phenotype and function during infection and sepsis should be investigated, e.g. by means of co-incubation experiments.
KW  - Sepsis
KW  - Thrombozyt
KW  - Biomarker
KW  - Frühdiagnostik
KW  - Durchflusscytometrie
KW  - Thrombozytenfunktionsanalyse
Y1  - 2024
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-358193
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Hauer, Nadine N.
A1  - Popp, Bernt
A1  - Taher, Leila
A1  - Vogl, Carina
A1  - Dhandapany, Perundurai S.
A1  - Büttner, Christian
A1  - Uebe, Steffen
A1  - Sticht, Heinrich
A1  - Ferrazzi, Fulvia
A1  - Ekici, Arif B.
A1  - De Luca, Alessandro
A1  - Klinger, Patrizia
A1  - Kraus, Cornelia
A1  - Zweier, Christiane
A1  - Wiesener, Antje
A1  - Abou Jamra, Rami
A1  - Kunstmann, Erdmute
A1  - Rauch, Anita
A1  - Wieczorek, Dagmar
A1  - Jung, Anna-Marie
A1  - Rohrer, Tilman R.
A1  - Zenker, Martin
A1  - Doerr, Helmuth-Guenther
A1  - Reis, André
A1  - Thiel, Christian T.
T1  - Evolutionary conserved networks of human height identify multiple Mendelian causes of short stature
JF  - European Journal of Human Genetics
N2  - Height is a heritable and highly heterogeneous trait. Short stature affects 3% of the population and in most cases is genetic in origin. After excluding known causes, 67% of affected individuals remain without diagnosis. To identify novel candidate genes for short stature, we performed exome sequencing in 254 unrelated families with short stature of unknown cause and identified variants in 63 candidate genes in 92 (36%) independent families. Based on systematic characterization of variants and functional analysis including expression in chondrocytes, we classified 13 genes as strong candidates. Whereas variants in at least two families were detected for all 13 candidates, two genes had variants in 6 (UBR4) and 8 (LAMA5) families, respectively. To facilitate their characterization, we established a clustered network of 1025 known growth and short stature genes, which yielded 29 significantly enriched clusters, including skeletal system development, appendage development, metabolic processes, and ciliopathy. Eleven of the candidate genes mapped to 21 of these clusters, including CPZ, EDEM3, FBRS, IFT81, KCND1, PLXNA3, RASA3, SLC7A8, UBR4, USP45, and ZFHX3. Fifty additional growth-related candidates we identified await confirmation in other affected families. Our study identifies Mendelian forms of growth retardation as an important component of idiopathic short stature.
KW  - disease genetics
KW  - DNA sequencing
KW  - genetic counselling
Y1  - 2019
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-227899
VL  - 27
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - He, Tao
A1  - Wu, Yanfei
A1  - D'Avino, Gabriele
A1  - Schmidt, Elliot
A1  - Stolte, Matthias
A1  - Cornil, Jérôme
A1  - Beljonne, David
A1  - Ruden, P. Paul
A1  - Würthner, Frank
A1  - Frisbie, C. Daniel
T1  - Crystal step edges can trap electrons on the surfaces of n-type organic semiconductors
JF  - Nature Communications
N2  - Understanding relationships between microstructure and electrical transport is an important goal for the materials science of organic semiconductors. Combining high-resolution surface potential mapping by scanning Kelvin probe microscopy (SKPM) with systematic field effect transport measurements, we show that step edges can trap electrons on the surfaces of single crystal organic semiconductors. n-type organic semiconductor crystals exhibiting positive step edge surface potentials display threshold voltages that increase and carrier mobilities that decrease with increasing step density, characteristic of trapping, whereas crystals that do not have positive step edge surface potentials do not have strongly step density dependent transport. A device model and microelectrostatics calculations suggest that trapping can be intrinsic to step edges for crystals of molecules with polar substituents. The results provide a unique example of a specific microstructure–charge trapping relationship and highlight the utility of surface potential imaging in combination with transport measurements as a productive strategy for uncovering microscopic structure–property relationships in organic semiconductors.
KW  - electronic and spintronic devices
KW  - electronic devices
KW  - scanning probe microscopy
Y1  - 2018
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-227957
VL  - 9
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - He, Jiangang
A1  - Di Sante, Domenico
A1  - Li, Ronghan
A1  - Chen, Xing-Qiu
A1  - Rondinelli, James M.
A1  - Franchini, Cesare
T1  - Tunable metal-insulator transition, Rashba effect and Weyl Fermions in a relativistic charge-ordered ferroelectric oxide
JF  - Nature Communications
N2  - Controllable metal–insulator transitions (MIT), Rashba–Dresselhaus (RD) spin splitting, and Weyl semimetals are promising schemes for realizing processing devices. Complex oxides are a desirable materials platform for such devices, as they host delicate and tunable charge, spin, orbital, and lattice degrees of freedoms. Here, using first-principles calculations and symmetry analysis, we identify an electric-field tunable MIT, RD effect, and Weyl semimetal in a known, charge-ordered, and polar relativistic oxide Ag2BiO3 at room temperature. Remarkably, a centrosymmetric BiO6 octahedral-breathing distortion induces a sizable spontaneous ferroelectric polarization through Bi3+/Bi5+ charge disproportionation, which stabilizes simultaneously the insulating phase. The continuous attenuation of the Bi3+/Bi5+ disproportionation obtained by applying an external electric field reduces the band gap and RD spin splitting and drives the phase transition from a ferroelectric RD insulator to a paraelectric Dirac semimetal, through a topological Weyl semimetal intermediate state. These findings suggest that Ag2BiO3 is a promising material for spin-orbitonic applications.
KW  - electronic properties and materials
KW  - ferroelectrics and multiferroics
KW  - topological matter
Y1  - 2018
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-227946
VL  - 9
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Gilder, Stuart A.
A1  - Wack, Michael
A1  - Kaub, Leon
A1  - Roud, Sophie C.
A1  - Petersen, Nikolai
A1  - Heinsen, Helmut
A1  - Hillenbrand, Peter
A1  - Milz, Stefan
A1  - Schmitz, Chistoph
T1  - Distribution of magnetic remanence carriers in the human brain
JF  - Scientific Reports
N2  - That the human brain contains magnetite is well established; however, its spatial distribution in the brain has remained unknown. We present room temperature, remanent magnetization measurements on 822 specimens from seven dissected whole human brains in order to systematically map concentrations of magnetic remanence carriers. Median saturation remanent magnetizations from the cerebellum were approximately twice as high as those from the cerebral cortex in all seven cases (statistically significantly distinct, p = 0.016). Brain stems were over two times higher in magnetization on average than the cerebral cortex. The ventral (lowermost) horizontal layer of the cerebral cortex was consistently more magnetic than the average cerebral cortex in each of the seven studied cases. Although exceptions existed, the reproducible magnetization patterns lead us to conclude that magnetite is preferentially partitioned in the human brain, specifically in the cerebellum and brain stem.
KW  - brain
KW  - neurophysiology
Y1  - 2018
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-233035
VL  - 8
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Gotru, Sanjeev Kiran
A1  - van Geffen, Johanna P.
A1  - Nagy, Magdolna
A1  - Mammadova-Bach, Elmina
A1  - Eilenberger, Julia
A1  - Volz, Julia
A1  - Manukjan, Georgi
A1  - Schulze, Harald
A1  - Wagner, Leonard
A1  - Eber, Stefan
A1  - Schambeck, Christian
A1  - Deppermann, Carsten
A1  - Brouns, Sanne
A1  - Nurden, Paquita
A1  - Greinacher, Andreas
A1  - Sachs, Ulrich
A1  - Nieswandt, Bernhard
A1  - Hermanns, Heike M.
A1  - Heemskerk, Johan W. M.
A1  - Braun, Attila
T1  - Defective Zn2+ homeostasis in mouse and human platelets with α- and δ-storage pool diseases
JF  - Scientific Reports
N2  - Zinc (Zn2+) can modulate platelet and coagulation activation pathways, including fibrin formation. Here, we studied the (patho)physiological consequences of abnormal platelet Zn2+ storage and release. To visualize Zn2+ storage in human and mouse platelets, the Zn2+ specific fluorescent dye FluoZin3 was used. In resting platelets, the dye transiently accumulated into distinct cytosolic puncta, which were lost upon platelet activation. Platelets isolated from Unc13d−/− mice, characterized by combined defects of α/δ granular release, showed a markedly impaired Zn2+ release upon activation. Platelets from Nbeal2−/− mice mimicking Gray platelet syndrome (GPS), characterized by primarily loss of the α-granule content, had strongly reduced Zn2+ levels, which was also confirmed in primary megakaryocytes. In human platelets isolated from patients with GPS, Hermansky-Pudlak Syndrome (HPS) and Storage Pool Disease (SPD) altered Zn2+ homeostasis was detected. In turbidity and flow based assays, platelet-dependent fibrin formation was impaired in both Nbeal2−/− and Unc13d−/− mice, and the impairment could be partially restored by extracellular Zn2+. Altogether, we conclude that the release of ionic Zn2+ store from secretory granules upon platelet activation contributes to the procoagulant role of Zn2+ in platelet-dependent fibrin formation.
KW  - coagulation system
KW  - metals
Y1  - 2019
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-227455
VL  - 9
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Gore, Lia
A1  - Locatelli, Franco
A1  - Zugmaier, Gerhard
A1  - Handgretinger, Rupert
A1  - O'Brien, Maureen M.
A1  - Bader, Peter
A1  - Bhojwani, Deepa
A1  - Schlegel, Paul-Gerhardt
A1  - Tuglus, Catherine A.
A1  - Stackelberg, Arend von
T1  - Survival after blinatumomab treatment in pediatric patients with relapsed/refractory B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia
JF  - Blood Cancer Journal
N2  - no abstract available
KW  - acute lymphocytic leukaemia
KW  - immunotherapy
Y1  - 2018
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-230726
VL  - 8
ER  - 
TY  - JOUR
A1  - Franchini, Paolo
A1  - Jones, Julia C.
A1  - Xiong, Peiwen
A1  - Kneitz, Susanne
A1  - Gompert, Zachariah
A1  - Warren, Wesley C.
A1  - Walter, Ronald B.
A1  - Meyer, Axel
A1  - Schartl, Manfred
T1  - Long-term experimental hybridisation results in the evolution of a new sex chromosome in swordtail fish
JF  - Nature Communications
N2  - The remarkable diversity of sex determination mechanisms known in fish may be fuelled by exceptionally high rates of sex chromosome turnovers or transitions. However, the evolutionary causes and genomic mechanisms underlying this variation and instability are yet to be understood. Here we report on an over 30-year evolutionary experiment in which we tested the genomic consequences of hybridisation and selection between two Xiphophorus fish species with different sex chromosome systems. We find that introgression and imposing selection for pigmentation phenotypes results in the retention of an unexpectedly large maternally derived genomic region. During the hybridisation process, the sex-determining region of the X chromosome from one parental species was translocated to an autosome in the hybrids leading to the evolution of a new sex chromosome. Our results highlight the complexity of factors contributing to patterns observed in hybrid genomes, and we experimentally demonstrate that hybridisation can catalyze rapid evolution of a new sex chromosome.
KW  - evolutionary genetics
KW  - experimental evolution
KW  - genome evolution
Y1  - 2018
U6  - http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:20-opus-228396
VL  - 9
ER  -