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Der plasmamembran assoziierte Transportregulator RS1 bindet Ubiquitin und gelangt in den Zellkern
(2001)
Die vorliegende Arbeit liefert wichtige Erkenntnisse über die subzelluläre Verteilung und die Funktion des RS1-Proteins vom Schwein (pRS1), einem Regulator von Plasmamembran-transportern. Das grün fluoreszierende Protein (GFP) wurde mit pRS1 fusioniert und in LLC-PK1 Zellen exprimiert. Das GFP-pRS1 Fusionsprodukt (96 kD) konnte an der Plasmamembran, im Zytosol und im Zellkern entdeckt werden. Bei GFP-Fusion mit trunkierten pRS1-Proteinen zeigte sich, dass der C-Terminus die Kernlokalisierung beeinflusst. Dagegen wurde die Kernlokalisierung durch eine Trunkierung des N-Terminus nicht gestört. Im C-Terminus des pRS1 konnte von AS 579 bis 616 eine Ubiquitin associated domain (UBA) identifiziert werden, die auch in den anderen bisher bekannten RS1-Proteinen aus Mensch, Kaninchen und Maus konserviert vorliegt. Eine Ubiquitin-Affinitätschromatographie zeigte, dass das pRS1-Protein Ubiquitin auf nicht kovalente Weise bindet. Nach der Trunkierung der UBA-Domäne war keine Wechselwirkung des pRS1-Proteins mit Ubiquitin mehr feststellbar. Ein konserviertes Di-Leucin-Endozytose-Motiv (pRS1 AS 366/67) deutet eine Funktion des pRS1-Proteins bei der Internalisierung von Plasmamembranproteinen an. Deshalb wurde das Endozytoseverhalten von pRS1 überexprimierenden LLC-PK1 Zellen untersucht, wobei sich zeigte, dass diese Zellen eine deutlich höhere Aufnahme des Endozytosefarbstoffes RH 414 aufwiesen als Zellen, die pRS1 nicht überexprimierten. Die in dieser Arbeit gesammelten Daten zum RS1-Protein wurden zusammen mit früher erhobenen Ergebnissen zum RS1-Protein im Rahmen eines Modells zusammengefasst. In diesem hypothetischen Modell wird angenommen, dass RS1 ein Adapterprotein ist, welches die ubiquitinabhängige Endozytose von Plasmamembrantransportern vermittelt und als Signalmolekül in den Zellkern gelangen kann, wo es an der Transcriptionsrepression des SGLT1 beteiligt ist.
Deregulation of the HECT-type ubiquitin ligase E6AP (UBE3A) is implicated in human papilloma virus-induced cervical tumorigenesis and several neurodevelopmental disorders. Yet the structural underpinnings of activity and specificity in this crucial ligase are incompletely understood. Here, we unravel the determinants of ubiquitin recognition by the catalytic domain of E6AP and assign them to particular steps in the catalytic cycle. We identify a functionally critical interface that is specifically required during the initial formation of a thioester-linked intermediate between the C terminus of ubiquitin and the ligase-active site. This interface resembles the one utilized by NEDD4-type enzymes, indicating that it is widely conserved across HECT ligases, independent of their linkage specificities. Moreover, we uncover surface regions in ubiquitin and E6AP, both in the N- and C-terminal portions of the catalytic domain, that are important for the subsequent reaction step of isopeptide bond formation between two ubiquitin molecules. We decipher key elements of linkage specificity, including the C-terminal tail of E6AP and a hydrophilic surface region of ubiquitin in proximity to the acceptor site Lys-48. Intriguingly, mutation of Glu-51, a single residue within this region, permits formation of alternative chain types, thus pointing to a key role of ubiquitin in conferring linkage specificity to E6AP. We speculate that substrate-assisted catalysis, as described previously for certain RING-associated ubiquitin-conjugating enzymes, constitutes a common principle during linkage-specific ubiquitin chain assembly by diverse classes of ubiquitination enzymes, including HECT ligases.
Background
To use combinatorial epitope mapping ("fingerprinting") of the antibody response to identify targets of the humoral immune response in patients with transitional cell carcinoma (TCC) of the bladder.
Methods
A combinatorial random peptide library was screened on the circulating pool of immunoglobulins purified from an index patient with a high risk TCC (pTa high grade plus carcinoma in situ) to identify corresponding target antigens. A patient cohort was investigated for antibody titers against ubiquitin.
Results
We selected, isolated, and validated an immunogenic peptide motif from ubiquitin as a dominant epitope of the humoral response. Patients with TCC had significantly higher antibody titers against ubiquitin than healthy donors (p<0.007), prostate cancer patients (p<0.0007), and all patients without TCC taken together (p<0.0001). Titers from superficial tumors were not significantly different from muscle invasive tumors (p = 0.0929). For antibody response against ubiquitin, sensitivity for detection of TCC was 0.44, specificity 0.96, positive predictive value 0.96 and negative predictive value 0.41. No significant titer changes were observed during the standard BCG induction immunotherapy.
Conclusions
This is the first report to demonstrate an anti-ubiquitin antibody response in patients with TCC. Although sensitivity of antibody production was low, a high specificity and positive predictive value make ubiquitin an interesting candidate for further diagnostic and possibly immune modulating studies.