Filtern
Volltext vorhanden
- ja (228)
Gehört zur Bibliographie
- ja (228)
Erscheinungsjahr
Dokumenttyp
- Artikel / Aufsatz in einer Zeitschrift (120)
- Dissertation (107)
- Sonstiges (1)
Schlagworte
- Neisseria meningitidis (43)
- Echinococcus (14)
- Fuchsbandwurm (13)
- Meningokokken (8)
- MRSA (7)
- Candida (6)
- Haemophilus influenzae (6)
- Tanzania (6)
- meningococcal disease (6)
- Candida albicans (5)
Institut
- Institut für Hygiene und Mikrobiologie (228) (entfernen)
Sonstige beteiligte Institutionen
- Broad Institute, USA (1)
- Department Pharmazie - Zentrum für Pharmaforschung, Ludwig-Maximilians-Universität München (1)
- Department of Hematology and Oncology, Sana Hospital Hof, Hof, Germany (1)
- Department of Laboratory Medicine and Medicine Huddinge, Karolinska Institutet and University Hospital, Stockholm, Sweden (1)
- Department of Medicine A, University Hospital of Münster, Münster, Germany (1)
- Instituto de Higiene, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay (1)
- Instituto de Hygiene Montevideo, Uruguay (1)
- Krankenhaushygiene und Antimicrobial Stewardship (1)
- Krankenhaushygiene und Antimicrobial Stewardship (Universitätsklinikum) (1)
- Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie Hans-Knöll-Institut (1)
EU-Projektnummer / Contract (GA) number
- 2016 FGR 0053 (1)
- 278864 (1)
- 847507 (1)
Candida lusitaniae is a rare cause of candidemia that is known for its unique capability to rapidly acquire resistance to amphotericin B. We report the case of an adolescent with grade IV graft-vs.-host disease after hematopoietic cell transplantation who developed catheter-associated C. lusitaniae candidemia while on therapeutic doses of liposomal amphotericin B. We review the epidemiology of C. lusitaniae bloodstream infections in adult and pediatric patients, the development of resistance, and its role in breakthrough candidemia. Appropriate species identification, in vitro susceptibility testing, and source control are pivotal to optimal management of C. lusitaniae candidemia. Initial antifungal therapy may consist of an echinocandin and be guided by in vitro susceptibility and clinical response.
Background:
Commensal bacteria like Neisseria meningitidis sometimes cause serious disease. However, genomic comparison of hyperinvasive and apathogenic lineages did not reveal unambiguous hints towards indispensable virulence factors. Here, in a systems biological approach we compared gene expression of the invasive strain MC58 and the carriage strain α522 under different ex vivo conditions mimicking commensal and virulence compartments to assess the strain-specific impact of gene regulation on meningococcal virulence.
Results:
Despite indistinguishable ex vivo phenotypes, both strains differed in the expression of over 500 genes under infection mimicking conditions. These differences comprised in particular metabolic and information processing genes as well as genes known to be involved in host-damage such as the nitrite reductase and numerous LOS biosynthesis genes. A model based analysis of the transcriptomic differences in human blood suggested ensuing metabolic flux differences in energy, glutamine and cysteine metabolic pathways along with differences in the activation of the stringent response in both strains. In support of the computational findings, experimental analyses revealed differences in cysteine and glutamine auxotrophy in both strains as well as a strain and condition dependent essentiality of the (p)ppGpp synthetase gene relA and of a short non-coding AT-rich repeat element in its promoter region.
Conclusions:
Our data suggest that meningococcal virulence is linked to transcriptional buffering of cryptic genetic variation in metabolic genes including global stress responses. They further highlight the role of regulatory elements for bacterial virulence and the limitations of model strain approaches when studying such genetically diverse species as N. meningitidis.
Candida auris was first described as a yeast pathogen in 2009. Since then, the species has emerged worldwide. In contrast to most other Candida spp., C. auris frequently exhibits multi-drug resistance and is readily transmitted in hospital settings. While most detections so far are from colonised patients, C. auris does cause superficial and life-threatening invasive infections. During management of the first documented C. auris transmission in a German hospital, experts from the National Reference Centers for Invasive Fungal Infections (NRZMyk) and the National Reference Center for Surveillance of Nosocomial Infections screened available literature and integrated available knowledge on infection prevention and C. auris epidemiology and biology to enable optimal containment. Relevant recommendations developed during this process are summarised in this guidance document, intended to assist in management of C. auris transmission and potential outbreak situations. Rapid and effective measures to contain C. auris spread require a multi-disciplinary approach that includes clinical specialists of the affected unit, nursing staff, hospital hygiene, diagnostic microbiology, cleaning staff, hospital management and experts in diagnostic mycology / fungal infections. Action should be initiated in a step-wise process and relevant interventions differ between management of singular C. auris colonised / infected patients and detection of potential C. auris transmission or nosocomial outbreaks.
Candida glabrata ist die zweithäufigste Ursache von Candidämien und invasiven Hefepilzinfektionen in Europa. Im Gegensatz zu C. albicans zeigt C. glabrata eine reduzierte Empfindlichkeit gegen bestimmte Antimykotika und kann unter Therapie rasch Resistenzen entwickeln.
Diese Arbeit umfasst eine systematische geno- und phänotypische Resistenzanalyse einer der größten europäischen - durch das NRZMyk in 5 Jahren zusammengetragenen - C. glabrata Stammsammlungen bestehend aus 176 klinisch relevanter Isolate. 84 der Stämme wurden anhand Referenztestung nach EUCAST zunächst als Anidulafungin (AND) resistent eingestuft. 71 wiesen konkordante Mutationen in den für die Glucan-Synthetase kodierenden FKS-Genen auf (13 % in FKS1, 87 % in FKS2). Vor allem die Position Ser-663 (FKS2-HS1) imponierte mit signifikant erhöhten AND MHK-Werten. 11 FKS-Wildtyp-Isolate, die ursprünglich als AND resistent klassifiziert wurden, wiesen in multiplen Nachtestungen um den Breakpoint undulierende AND MHK-Werte auf. 2 FKS-Wildtyp Isolate zeigten durchgängig hohe AND MHK-Werte und mussten daher - trotz fehlender Zielgenmutationen - als resistent eingestuft werden. Diese extremen Phänotypen wurden durch einen verblindeten nationalen Ringversuch bestätigt. Über ein Drittel der Isolate war multiresistent. Stämme aus Blutstrominfektionen und Ser-663 Mutation waren mit einer erhöhten Mortalität assoziiert. Ein weiteres Kernelement war die Detektion von Azol-resistenten C. glabrata petite-Phänotypen in der Routinediagnostik. Hier wurden innerhalb von 8 Monaten 20 relevante Isolate identifiziert.
Die Ergebnisse belegen das regelmäßige Auftreten single- / multidrug-resistenter C. glabrata Isolate in Deutschland. Phänotypische Resistenztestungen können zu Fehlklassifizierung von sensiblen Isolaten führen. FKS-Genotypisierungen hingegen sind ein nützliches Tool zur Identifizierung relevanter Resistenzen. In seltenen Fällen scheint jedoch eine Echinocandin-Resistenz ohne genotypisches Korrelat möglich zu sein.
Migration and interactions of immune cells are routinely studied by time-lapse microscopy of in vitro migration and confrontation assays. To objectively quantify the dynamic behavior of cells, software tools for automated cell tracking can be applied. However, many existing tracking algorithms recognize only rather short fragments of a whole cell track and rely on cell staining to enhance cell segmentation. While our previously developed segmentation approach enables tracking of label-free cells, it still suffers from frequently recognizing only short track fragments. In this study, we identify sources of track fragmentation and provide solutions to obtain longer cell tracks. This is achieved by improving the detection of low-contrast cells and by optimizing the value of the gap size parameter, which defines the number of missing cell positions between track fragments that is accepted for still connecting them into one track. We find that the enhanced track recognition increases the average length of cell tracks up to 2.2-fold. Recognizing cell tracks as a whole will enable studying and quantifying more complex patterns of cell behavior, e.g. switches in migration mode or dependence of the phagocytosis efficiency on the number and type of preceding interactions. Such quantitative analyses will improve our understanding of how immune cells interact and function in health and disease.
Background and Objective: Staphylococcus aureus is one of the major pathogens of nosocomial infections as wells as community-acquired (CA) infections worldwide. So far, large-scale comprehensive molecular and epidemiological characterisation of S. aureus from very diverse settings has not been carried out in India. The objective of this study is to evaluate the molecular, epidemiological and virulence characteristics of S. aureus in both community and hospital settings in Chennai, southern India. Methods: S. aureus isolates were obtained from four different groups (a) healthy individuals from closed community settings, (b) inpatients from hospitals, (c) outpatients from hospitals, representing isolates of hospital-community interface and (d) HIV-infected patients to define isolates associated with the immunocompromised. Antibiotic susceptibility testing, multiplex polymerase chain reactions for detection of virulence and resistance determinants, molecular typing including Staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) and agr typing, were carried out. Sequencing-based typing was done using spa and multilocus sequence typing (MLST) methods. Clonal complexes (CC) of hospital and CA methicillin-resistant S. aureus (MRSA) were identified and compared for virulence and resistance.
Results and Conclusion: A total of 769 isolates of S. aureus isolates were studied. The prevalence of MRSA was found to be 7.17%, 81.67%, 58.33% and 22.85% for groups a, b, c and d, respectively. Of the four SCCmec types (I, III, IV and V) detected, SCCmec V was found to be predominant. Panton-Valentine leucocidin toxin genes were detected among MRSA isolates harbouring SCCmec IV and V. A total of 78 spa types were detected, t657 being the most prevalent. 13 MLST types belonging to 9 CC were detected. CC1 (ST-772, ST-1) and CC8 (ST238, ST368 and ST1208) were found to be predominant among MRSA. CA-MRSA isolates with SCCmec IV and V were isolated from all study groups including hospitalised patients and were found to be similar by molecular tools. This shows that CA MRSA has probably infiltrated into the hospital settings.
Permanente ZNS-Zelllinien der Ratte wurden mit Toxoplasma gondii unter Betrachtung der Invasions-, Replikations- und Stadienkonversionfähigeit des Parasiten infiziert. Additiv zu bekannten Tiermodellen konnte so ein Zellkulturmodell zur Erforschung der zerebralen Persistenz des Protozoons etabliert werden.
Die Bedeutung des Zwei-Partner-Sekretionssystems für die Adhärenz von Meningokokken an Epithelzellen
(2009)
Das two-partner secretion-system (TPS-System) ist ein unter Gram-negativen Bakterien weit verbreiteter Weg der Proteinsekretion. Die als TpsA bezeichneten Exoproteine des TPS Systems benötigen ein spezifisches Partnerprotein (genannt TpsB) in Form eines kanalbildenden Transporters. Im sequenzierten Genom des Meningokokkenstammes MC58 finden sich fünf putative tpsA Gene, die als hemagglutinin/hemolysin-related protein (hrps) bezeichnete werden. Neben MC58 finden sich auch in den anderen sequenzierten Meningokokkenstämmen (FAM18, Z2491, alpha14) hrps. Diese weisen N-terminal Homologien zum filamentösen Hämagglutinin (FHA) von B. pertussis auf, das als TpsA-Protein des two-partner-secretion-system (TPS) aus der Zelle transportiert wird. In dieser Arbeit werden die hrps als hrpA Gene bzw. HrpA-Proteine bezeichnet. Alle sequenzierten Meningokokkenstämme verfügen über tpsB homologe Gene (hrpB), die jeweils in enger Nachbarschaft zu den hrpA Genen zu finden sind. Das Vorhandensein von hrpA und hrpB Genen deutet darauf hin, dass auch Meningokokken über ein funktionales TPS-System verfügen. Bei einer Dot-Blot-Analyse von 830 Meningokokkenstämmen aus einer bayerischen Trägerstudie mit Sonden spezifisch für die C-terminalen Bereiche der im Stamm MC58 gefundenen hrpA Gene hybridisierten 80% der ausgewerteten Stämme mit mindestens einer der Sonden. Stämme der hypervirulenten klonalen Komplexen (ST-8, ST-11, ST32, ST-44) zeigten sogar in über 99% eine positive Reaktion. Dagegen wiesen die nicht-hypervirulenten klonalen Komplexe zu 29% im Dot Blot kein hrpA auf, das homolog zu den hrpA Genen von Stamm MC58 ist, wobei es sich hierbei mehrheitlich (82%) um cnl Stämme handelte, so dass sich nur in 10% der untersuchten Kapsel-null-locus-Stämme (cnl) ein zu den hrpA Genen von MC58 homologes Gen nachweisen ließ. Mit der Hypothese, dass auch diese Stämme ein hrpA besitzen, welches sich im C-terimalen Anteil von denen des MC58 unterscheidet wurden in dieser Arbeit Dot Blots durchgeführt, deren Sonde spezifisch für das hrpB NMC0443 war. 97,6% der mit dieser Sonde untersuchten Stämme zeigten die Anwesenheit eines hrpB Homologs. Um die Vermutung zu bestätigen, dass allen hrpB Genen ein zugehöriges hrpA Gen benachbart liegt, wurden repräsentativ PCRs von häufigen klonalen Komplexen durchgeführt. Dabei konnte gezeigt werden, dass ein TPS-System sowohl in den hypervirulenten als auch den nicht-hypervirulenten klonalen Komplexen der Meningokokken vorkommt. Die vielfältigen Funktionen von bereits untersuchten TpsA Proteinen sind zumeist mit der Pathogenität der Bakterien assoziiert. In dieser Arbeit wurde ein möglicher Einfluss der HrpA Proteine auf die Adhäsion der Bakterien an humane Zellen untersucht. Es konnte gezeigt werden, dass sowohl eine kapsellose, als auch eine kapsellose, LPS-trunkierte hrpA Deletionsmutante signifikant schlechter an Epithelzellen adhäriert als die parentalen Vergleichsstämme. Ebenso zeigten die analog durchgeführten Infektionsversuche mit der hrpB Deletionsmutante einen Adhärenzverlust, der jedoch nur für die unbekapselte und LPS trunkierte hrpB Deletionsmutante signifikant war. In dieser Arbeit ist es gelungen das HrpB Protein des Stammes 2120 in E. coli zu exprimieren und aufzureinigen, sodass die Entwicklung eines gegen HrpB gerichteten Antikörpers in Auftrag gegeben werden konnte. Mit Hilfe dieses Antikörpers sollen noch offene Fragen zur Synthese und dem Transport des HrpB Transportproteins beantwortet werden. Außerdem können weitere Untersuchungen zur Lage und Verteilung der HrpBs in der Meningokokkenmembran dazu beitragen, weiteren Aufschluss über die Komplexität von Pathogenität und Virulenz von N. meningitidis zu geben.