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Background and objective
Prompt pathogen identification of blood stream infections is essential to provide appropriate antibiotic treatment. Therefore, the objective of this prospective single centre study was to establish an inexpensive, fast and accurate protocol for bacterial species identification with SDS protein-extraction directly from BacT/Alert® blood culture (BC) bottles by VitekMS®.
Results
Correct species identification was obtained for 198/266 (74.4%, 95%-CI = [68.8%, 79.6%]) of pathogens. The protocol was more successful in identifying 87/96 (91.4%, 95%-CI = [83.8%, 93.2%]) gram-negative bacteria than 110/167 (65.9%, 95%-CI = [58.1%, 73.0%]) gram-positive bacteria. The hands-on time for sample preparation and measurement was about 15 min for up to five samples. This is shorter than for most other protocols using a similar lysis-centrifugation approach for the combination of BacT/Alert® BC bottles and the Vitek® MS mass spectrometer. The estimated costs per sample were approx. 1.80€ which is much cheaper than for commercial kits.
Conclusion
This optimized protocol allows for accurate identification of bacteria directly from blood culture bottles for laboratories equipped with BacT/Alert® blood culture bottles and VitekMS® mass spectrometer.
We compared the feasibility of 4 cytomegalovirus (CMV)- and Aspergillus-reactive T-cell immunoassay protocols in allogenic stem cell transplant recipients. While enzyme-linked immunospot performed best overall, logistically advantageous whole blood–based assays performed comparably in patients with less severe lymphocytopenia. CMV-induced interferon-gamma responses correlated strongly across all protocols and showed high concordance with serology.
Bei Patienten mit invasiver Aspergillose fanden sich gegenüber gesunden Probanden deutlich erhöhte Werte A. fumigatus spezifischer CD154+/CD4+ Zellen. Die Anwendbarkeit dieses Assays im klinischen Routinebetrieb und bei gegenüber A. fumigatus epxonierten Probanden und Patienten sollte in dieser translationalen Arbeit untersucht werden.
Für den vorbeschriebenen Assay zur Bestimmung CD154+/CD4+ Zellen aus aufgereinigten PBMCs zeigt diese Arbeit eine signifikant reduzierte Detektionsrate nach Blutprobenlagerung von über 2 Stunden. In der Literatur beschriebene Verfahren zur verlängerten Lagerungszeit von heparinisierten Blutproben mittels vorhergehender Dilution und Agitation ermöglichen keine Verlängerung präanalytischer Lagerungszeiten über 6 Stunden. Die Kryokonservierung frisch aufbereiteter PBMCs bei −20 C vor Bestimmung A. fumigatus spezifischer T-Zellen wird als Versandmöglichkeit in einem multizentrischen Setting gezeigt. Um die klinische Anwendbarkeit zu verbessern, wird ein Vollblutprotokoll zur Detektion A. fumigatus spezifischer CD154+/CD4+ Zellen demonstriert, das die Verwendung von bettseitig mit Vollblut beimpften Blutmonovetten mit vorgelegtem A. fumigatus-Lysat ermöglicht.
Die Anwendung des Assays zur Bestimmung A. fumigatus spezifischer T-Zellen wurde bei hämatoonkologischen Patienten vor und drei Monate nach Stammzelltransplantation untersucht. Insbesondere eine reduzierte Zellzahl der gemessenen Lymphozyten ist hier ein limitierender Faktor der erfolgreichen Messung. Aufgrund der generell nied- rigen Erfolgsrate von 20 % bzw. 54 % vor bzw. nach HSCT ist die Anwendbarkeit des Assays in diesem Kollektiv fraglich. Die Erhebung von Expositionsfaktoren gesunder Probanden gegenüber A. fumigatus ermöglicht die Einteilung in eine schwach und stark gegenüber A. fumigatus exponierte Gruppe mit signifikant erhöhtem Anteil A. fumigatus spezifischer CD154+/CD4+ Zellen. Hierzu trägt insbesondere das Vorliegen antigenspezifischer T-Gedächtniszellen als Korrelat einer langfristigen Exposition bei. Retrospektiv fand sich auch nach kurzfris- tiger beruflicher Exposition ein Anstieg CD154+/CD4+ spezifischer T-Zellen. Dies legt eine Verwendung CD154+/CD4+ spezifischer T-Zellen als Biomarker in Bereichen der umweltmedizinischen Abklärung von Schimmelpilzexposition oder der Diagnostik allergischer Erkrankungen nahe.