Theodor-Boveri-Institut für Biowissenschaften
Refine
Has Fulltext
- yes (336)
Is part of the Bibliography
- yes (336)
Year of publication
Document Type
- Journal article (264)
- Doctoral Thesis (51)
- Book article / Book chapter (9)
- Conference Proceeding (9)
- Book (2)
- Preprint (1)
Language
- English (295)
- German (39)
- Multiple languages (2)
Keywords
- Physiologische Chemie (45)
- Schwertkärpfling (19)
- melanoma (11)
- Melanom (10)
- cancer (10)
- Xiphophorus (9)
- Signaltransduktion (6)
- evolution (6)
- BMP (5)
- Biochemie (5)
- Onkogen (5)
- colorectal cancer (5)
- gene expression (5)
- Biologie (4)
- Drosophila (4)
- Krebs <Medizin> (4)
- MYC (4)
- Myc (4)
- NRF2 (4)
- Taufliege (4)
- Transkriptionsfaktor (4)
- Tumor (4)
- angiogenesis (4)
- animal behaviour (4)
- caloric restriction (4)
- lung cancer (4)
- mass spectrometry (4)
- medaka (4)
- metabolism (4)
- p53 (4)
- signal transduction (4)
- Gen (3)
- Genexpression (3)
- Genregulation (3)
- HUWE1 (3)
- Interleukin 4 (3)
- Japankärpfling (3)
- Knochen-Morphogenese-Proteine (3)
- LC/MS (3)
- Lebendgebärende Zahnkarpfen (3)
- Ligand <Biochemie> (3)
- MIZ1 (3)
- Mitose (3)
- Protein-Tyrosin-Kinasen (3)
- Rezeptor (3)
- Transforming Growth Factor beta (3)
- Transkription <Genetik> (3)
- USP28 (3)
- autophagy (3)
- biodiversity (3)
- chemotherapy (3)
- differentiation (3)
- fish (3)
- gametogenesis (3)
- genome (3)
- metastasis (3)
- methionine restriction (3)
- microRNA (3)
- mushroom body (3)
- nephroblastoma (3)
- nucleolus (3)
- prostate cancer (3)
- therapy (3)
- transcriptome (3)
- zebrafish (3)
- ATF4 (2)
- Allergie (2)
- Apoptose (2)
- Aurora-A (2)
- B-MYB (2)
- CRC (2)
- ChIP-sequencing (2)
- DM-domain gene (2)
- DNA (2)
- DNA damage (2)
- DNA methylation (2)
- DNA-binding proteins (2)
- DNS (2)
- Drosophila melanogaster (2)
- Entstehung (2)
- Fingerprint-Verfahren (2)
- Fish (2)
- Gen notch (2)
- IL-4 (2)
- In vitro (2)
- In vivo (2)
- Interaktion (2)
- Interleukin-4 (2)
- K-RAS (2)
- Krebsforschung (2)
- L929 (2)
- Lungenkrebs (2)
- MMB (2)
- Mc4r (2)
- Molekularbiologie (2)
- N-Myc (2)
- NFATc1 (2)
- Neuroblastom (2)
- PI3K (2)
- RNA-Seq (2)
- Regulation (2)
- Sammeln (2)
- Squalius alburnoides (2)
- T cells (2)
- TP53 (2)
- Ubiquitin (2)
- Umweltfaktor (2)
- Wachstumsfaktor (2)
- Wilms tumour (2)
- Y chromosome (2)
- Zellzyklus (2)
- amino acid (2)
- apoptosis (2)
- bees (2)
- biomarker (2)
- breast cancer (2)
- c-MYC (2)
- cell proliferation (2)
- complication (2)
- crosstalk (2)
- cytotoxic T cells (2)
- developmental biology (2)
- ecosystem function (2)
- expression analysis (2)
- fish model (2)
- gastric cancer (2)
- gene (2)
- gene regulation (2)
- genome annotation (2)
- growth (2)
- in-vitro (2)
- lipid metabolism (2)
- lipidomics (2)
- liquid chromatography/mass spectrometry (2)
- long non-coding RNA (2)
- luciferase (2)
- lysosome (2)
- molecular phylogeny (2)
- mouse (2)
- oncogenes (2)
- oncolysis (2)
- oncolytic virus (2)
- outcome (2)
- paraspeckles (2)
- preexisting bias (2)
- proliferation (2)
- proteomics (2)
- puberty (2)
- reactive oxygen species (2)
- receptor (2)
- receptor tyrosine kinase (2)
- reproductive success (2)
- reveals (2)
- ribosome (2)
- ribosome biogenesis (2)
- sequence alignment (2)
- sex chromosomes (2)
- sex determination (2)
- sex differentiation (2)
- sexual selection (2)
- testis (2)
- transcription (2)
- transcription factors (2)
- transposable elements (2)
- ubiquitination (2)
- 2-DG (1)
- 2-deoxy-D-glucose (1)
- 28 (1)
- 5-fluorouracil (1)
- AFLP (1)
- AMACR (1)
- AMP-activated protein kinase (AMPK) (1)
- AP-1 (1)
- APEX2 (1)
- ARF tumor-suppressor induced lymphomagenes (1)
- ATG7 (1)
- ATM (1)
- Acipenser baerii (1)
- Activation (1)
- Adenocarcinomas (1)
- Allerg (1)
- Allergy (1)
- Alpha-Methylacyl-CoA-Racemase (1)
- Amazon Molly (1)
- Aminosäuren (1)
- Angiogenese (1)
- Angiopoietin-2 (1)
- Annotation (1)
- Antioxidantien (1)
- Antwortschwellen (1)
- Apis mellifera (1)
- Apoptosis (1)
- Arbeitsteilung (1)
- Aulonocara (1)
- B cell receptors (1)
- B cells (1)
- B chromosomes (1)
- BCL-X-L P53 (1)
- BDNF (1)
- BIAcore (1)
- BM (1)
- BMP Rezeptoren (1)
- BMP antagonist (1)
- BMP receptos (1)
- BMP signaling (1)
- BMPR-IB (1)
- BMPs (1)
- BRAF (1)
- BRCA1 positive (1)
- BRCA1/2 negative (1)
- BRCA2 positive (1)
- Bauchfellentzündung (1)
- Bauchspeicheldrüsenkrebs (1)
- Bcl-X (1)
- Beige adipocytes (1)
- Bevacizumab (1)
- Bewegungsdetektion (1)
- Bewegungssehen (1)
- Biene (1)
- Bienen <Familie> (1)
- Bienensprache (1)
- Bienenstaat (1)
- Biology (1)
- Biomarker (1)
- Bodenplatte (1)
- Bombina variegata (1)
- Bone regeneration (1)
- Bordetella (1)
- Bordetella bronchiseptica (1)
- Brain-derived neurotrophic factor (1)
- Bre (1)
- Bre-knockout (1)
- Buntbarsche (1)
- C-MYC PUMA (1)
- C.376A>G (p.S126G) (1)
- C/EBP (1)
- CCR7 (1)
- CD274 (1)
- CHAC1 (1)
- CO2 (1)
- COVID-19 pandemic (1)
- COX2 expression (1)
- CRISPR-Cas9 (1)
- CRISPR/Cas9 (1)
- CSP (1)
- CX5461 (1)
- Cancer (1)
- Cancer Cell (1)
- Carcinogenese (1)
- Cardiomyocyte (1)
- Cassidinae (1)
- Ccl2 (1)
- Cell-line (1)
- Centromer (1)
- Cestode (1)
- Chemosensitivity (1)
- Chemosensitivität (1)
- Chemotaxis (1)
- Chirurgie (1)
- Chlamydia trachomatis (1)
- Chromosomal Passenger Complex (1)
- Chrysomelidae (1)
- Cisplatin (1)
- Co-option (1)
- Coahuila (1)
- Colonkrebs (1)
- Cushing (1)
- Cynoglossus semilaevis (1)
- Cysteinderivate (1)
- Cytokine (1)
- Cytoskeleton Chromosomal Passenger Complex Interaction GAR Domain (1)
- DMRT1 (1)
- DNA antibodies (1)
- DNA fingerprinting (1)
- DNA storage (1)
- DNA transcription (1)
- DNA-PK (1)
- DNS-Bindung (1)
- DNS-Reparatur (1)
- DRD1 (1)
- DREAM complex (1)
- DUB inhibitor (1)
- Danio-rerio (1)
- DeepSqueak (1)
- Deletion analysis (1)
- Deutsche Forschungsgemeinschaft (1)
- Dicyclohexylcarbodiimid (1)
- Dmrt1bY (1)
- Dreidimensionale NMR-Spektroskopie (1)
- Echinococcosis (1)
- Echinococcus (1)
- Ectopic bone formation (1)
- Elongation (Transkription) (1)
- Embryonale Stammzelle (1)
- Embryonalentwicklung (1)
- Endothelial cells (1)
- Endothelzellen (1)
- Enhancer (1)
- Entwicklungsgeschwindigkeit (1)
- Enzyme Regulation (1)
- Ep45 (1)
- Epidermaler Wachstumsfaktor-Rezeptor (1)
- Escherichia coli (1)
- Escherichia coli-derived recombinant human bone morphogenetic protein-2 (1)
- Eukaryoten (1)
- European orchard bee (Osmia cornuta) (1)
- Expressionsanalyse (1)
- Extracellular matrix (1)
- Extrazellulärraum (1)
- Extrembiotop (1)
- FBXW7 (1)
- FOSL1 (1)
- FWGE (1)
- Fabry disease (1)
- Fbw7 (1)
- Fisch (1)
- Fisch-Modell-System (1)
- Fische (1)
- Flagella (1)
- Flagellensynthese (1)
- Flexibilität (1)
- Freeze-etching (1)
- Fructosebisphosphat-Aldolase (1)
- Förster Resonance Energy Transfer (1)
- GABA (1)
- GAD1 (1)
- GAS2L3 (1)
- GDF-5 (1)
- GDNF5 (1)
- GPCR (1)
- GSH (1)
- GST fusion protein (1)
- GST-Fusionsprotein (1)
- Galectin-1 (1)
- Gedächtnis (1)
- Gefäße (1)
- Gene expression analysis (1)
- Gene regulation (1)
- Gene-expression (1)
- Genetik (1)
- Genmutation (1)
- Genome (1)
- Genome assembly (1)
- Genome comparison (1)
- Genomics (1)
- Gentransfer (1)
- German Research Foundation (1)
- Germany (1)
- Geruch (1)
- Gewebe (1)
- Glucosaminoglykane (1)
- Goldbrasse (1)
- Government research funding (1)
- HECT (1)
- HECT Ligase (1)
- Hauttumor (1)
- Heart development (1)
- Helicobacter pylori (1)
- Herz (1)
- Hey (1)
- Hey Proteine (1)
- Hey proteins (1)
- Hey1 (1)
- Hey2 (1)
- Hill numbers (1)
- Hippo pathway (1)
- Homeobox Gene (1)
- Homeobox genes (1)
- Homöobox (1)
- Honeybee (1)
- Honigbiene (1)
- Host-parasite interaction (1)
- Human (1)
- Human lung-cancer (1)
- Humangenetik (1)
- Hummeln (1)
- Huwe1 (1)
- Hypoxia (1)
- IL-2 (1)
- IL-7 (1)
- IR (1)
- Immunologie (1)
- Immunsystem (1)
- Improved survival (1)
- In-vivo (1)
- IncuCyte\(^®\)S3 (1)
- Induced senescence (1)
- Insulin (1)
- Interferon (1)
- Interleukin 13 (1)
- Interleukin 2 (1)
- Interleukin 7 (1)
- Isoenzym (1)
- JAK2 (1)
- JNK (1)
- JUN (1)
- Jak/ STAT (1)
- Jmjd6 (1)
- K-Ras (1)
- Kalyx (1)
- Karyotyp (1)
- Kidney cancer (1)
- Kinase inhibitor (1)
- Kinase pathway (1)
- Kinasen (1)
- Kinetochor (1)
- Knockout <Molekulargenetik> (1)
- Koexistenz (1)
- Kolonkarzinom (1)
- Kommunikation (1)
- Konservierung (1)
- Kristallstruktur (1)
- Kälteschock (1)
- Kälteschock-Proteine (1)
- Lamina (1)
- Laparoscopy (1)
- Latimeria menadoensis (1)
- LeishBASEedit (1)
- Leishmania (1)
- Lernen (1)
- Limb development (1)
- Listeria monocytogenes (1)
- Lobula Platte (1)
- Lymph nodes (1)
- MAPK signaling cascades (1)
- MITE (1)
- MITF (1)
- MSH2 (1)
- MTL30 (1)
- MYCN (1)
- MYCN-amplified (1)
- Malaria (1)
- Male intromittent organ (1)
- Malignant melanoma (1)
- Medaka - Genetransfer - Transient expression - DNA fate - Fish developmental biology (1)
- Medaka fish (1)
- Medicine (1)
- Medizin (1)
- Megalobrama amblycephala (1)
- Melanoma (1)
- Melanoma Maintenance (1)
- Mensch (1)
- Merkel cell carcinoma (1)
- Merkel-Zellkarzinom (1)
- Merkelzellkarzinom (1)
- Messenger-RNS (1)
- Metaphaseplatte (1)
- Methylene blue (1)
- Microarray data (1)
- Microsatellite (1)
- Midkine (1)
- Mikrobiologie (1)
- Mikrohabitat (1)
- Mikroklima (1)
- Mikrosatellit (1)
- Minimally invasive surgery (1)
- MircoRNA (1)
- Mismatch (1)
- Mismatchrepair (1)
- Mismatchreparatur (1)
- Miz1 (1)
- Model (1)
- Modell (1)
- Molecular Biophysics (1)
- Molekulare Erkennung (1)
- Molekulargenetik (1)
- Monogamie (1)
- Motilität (1)
- Motion detection (1)
- Mund-Kiefer-Gesichts-Chirurgie (1)
- Mutation screening (1)
- Myb-MuvB (1)
- Myb-MuvB complex (1)
- Myc Transcription (1)
- Mykose (1)
- NCI-60 (1)
- NEAT1 (1)
- NF-κB (1)
- NGF (1)
- NGS (1)
- NMR spectroscopy (1)
- NONO (1)
- NOTCH (1)
- NSCLC (1)
- NTA Lipide (1)
- NTA lipids (1)
- Nahrungserwerb (1)
- Nahrungsqualität (1)
- National Science Foundation (1)
- Nectar Foraging (1)
- Nektar (1)
- Nephroblastom (1)
- Nephroblastoma (1)
- Nerve growth factor (1)
- Nervengift (1)
- Nervenwachstumsfaktor (1)
- Nervenzelle (1)
- Nestklima (1)
- Neuroblastoma (1)
- Neurogenese (1)
- Neuronal survival (1)
- Neurophysiologie (1)
- Neurospora crassa (1)
- Nicht-kleinzelliges Bronchialkarzinom (1)
- Nicht-kleinzelliges Bronchialkarzinom (NSCLC) (1)
- Niedere Wirbeltiere (1)
- Njassasee (1)
- Notch Signalweg (1)
- Notch signalling (1)
- Oberflächenplasmonresonanz (SPR) (1)
- OmoMYC (1)
- Oncology (1)
- Oralchirurgie (1)
- Oxidativer Stress (1)
- P14ARF (1)
- P53 (1)
- PCP signaling (1)
- PCP-Signalweg (1)
- PCR (1)
- PD-L1 (1)
- PSMA (1)
- PTEN (1)
- Pain (1)
- Peptid (1)
- Peptide (1)
- Peroxisom (1)
- Peroxisomale Biogenese Defekte (1)
- Perugia-Kärpfling (1)
- Phosphotransfer reactions (1)
- Phosphotransferreaktionen (1)
- Phytanoyl-CoA-Hydroxylase (1)
- Phytansäure (1)
- Phänologie (1)
- Pigmentmuster (1)
- Pilzkörper (1)
- Piping Signal (1)
- Poecilia (Teleostei: Poeciliidae) (1)
- Poeciliid fish (1)
- Pollen (1)
- Polo-like kinase 1 (1)
- Polylactide-co-glycolide (1)
- PrfA (1)
- Profiling (1)
- Prognosis (1)
- Promotor (1)
- Proteasomaler Abbau (1)
- Protein Lipidierungen (1)
- Protein kinase D1 (PKD1) (1)
- Protein kinase D3 (PKD3) (1)
- Protein-Serin-Threonin-Ki (1)
- Proteinbiochemie (1)
- Proteinfaltung (1)
- Proteinkristallographie (1)
- Proteinmodifikationen (1)
- Protoonkogen (1)
- Protopterus annectens (1)
- Psychobiologie (1)
- Qinghaosu (1)
- RAS (1)
- RCC (1)
- RET6 (1)
- RNA (1)
- RNA polymerase II (1)
- RNA transport (1)
- RNA-SEQ data (1)
- RNA-binding proteins (1)
- RNA-seq transcriptome (1)
- RNAPOL1 (1)
- RNS-Polymerase II (1)
- RT -PCR (1)
- RTK (1)
- Racemase (1)
- Rbm8a (1)
- Real time quantitative PCR (1)
- Receptor kinase (1)
- Recombinant DNA ; Growth hormone gene ; PCR; Silver carp ; Fish (1)
- Recombinant DNA ; polymerase chain reaction ; metallothionein gene ; rainbow trout ; fish (1)
- Recombinant protein expression (1)
- Rectal cancer (1)
- Renal cell carcinoma (1)
- Renaturierung <Biochemie> (1)
- Repression (1)
- Rezeptortyrosinkinase (1)
- Ribosom (1)
- Risikostreuung (1)
- Räuberdruck (1)
- SCC (1)
- SCD (1)
- SGNH hydrolase (1)
- SLC7A11 (1)
- SMAD signaling (1)
- SOX9 (1)
- SPRED (1)
- SPRED2 (1)
- SSCP analysis (1)
- SSI (1)
- STAT (1)
- STAT6 (1)
- Schildkäfer (1)
- Schwertkräpfling (1)
- Selbstorgansation (1)
- Self-renewal (1)
- Serpin (1)
- Signaltransduction (1)
- Single nucleotide change (1)
- Ska complex (1)
- Ska-Komplex (1)
- Smad (1)
- Somatotropin (1)
- Sox5 (1)
- Soziale Insekten (1)
- Sparus aurata (1)
- Spongilla lacustris (1)
- Sprouting angiogenesis (1)
- Src-Proteine (1)
- Stat6 (1)
- Structural Biology (1)
- Strukturaufklärung (1)
- Strukturbiologie (1)
- Sunitinib (1)
- Surgical and invasive medical procedures (1)
- Surgical oncology (1)
- Synapse (1)
- Synaptische Vesikel (1)
- Synaptophysin (1)
- Synökologie (1)
- Süßwasserpolypen (1)
- T cell receptors (1)
- T-Lymphozyt (1)
- T-cells (1)
- TCR signaling cascade (1)
- TGF (1)
- TGF-ß (1)
- TGF-β superfamily (1)
- TME (1)
- TNNI3 (1)
- Tapeworm (1)
- Temperaturabhängigkeit (1)
- Tetanus Neurotoxin (1)
- Therapie (1)
- Therapy (1)
- Thermoregulation (1)
- Thermoregultion (1)
- Tissue Engineering (1)
- Tp63 (1)
- Transcription (1)
- Transcriptomic (1)
- Transfektion (1)
- Transforming Growth Factor (1)
- Transforming growth factor beta (1)
- Transgene Tiere (1)
- Transkriptionsfaktoren (1)
- Transmission electron microscopy (1)
- TrkB (1)
- Tumor angiogenesis (1)
- Tumor suppressor gene (1)
- Tumorzelle (1)
- Tumour markers (1)
- Tyrosine kinase inhibition (1)
- USP25 (1)
- Ubiquitinierung (1)
- Ultrastruktur (1)
- V-ATPase (1)
- VEGFA (1)
- Veracruz <Stadt> (1)
- Verhaltensökologie (1)
- Vicia faba (L.) (1)
- Virulenz (1)
- Visuelles System (1)
- Volatile Organic Compound (VOC) (1)
- WDR5 (1)
- WTI (1)
- Wachstum (1)
- Westafrika (1)
- Wilms Tumor (1)
- Wilms tumor (1)
- Wilms' tumor (1)
- Windengewächse (1)
- X-Ray Chrystallography (1)
- X. couchianus (1)
- X. hellerii (1)
- Xiphophorus fish (1)
- Xmrk (1)
- YAP (1)
- Zebrabärbling (1)
- Zebrafisch (1)
- Zebrafish (1)
- Zeitdifferenzierung (1)
- Zellmigration (1)
- Zellteilung (1)
- Zellzykluskontrolle (1)
- Zinc finger gene (1)
- Zittertanz (1)
- acipenserid minisatellite (1)
- activity-based probes (1)
- adaptive evolution (1)
- adaptive radiation (1)
- adjuvant (1)
- adrenal surgery (1)
- adrenal tumors (1)
- adrenalectomia (1)
- adrenocortical adenocarcinoma (1)
- adrenocortical carcinoma (1)
- agrobacterium tumefaciens (1)
- all-fish genes (1)
- alpha-Oxidation (1)
- alpha-oxidation (1)
- alpha-tubulin-II (1)
- alternative splicing (1)
- amacr (1)
- amino acid analogues (1)
- amino acid restriction (1)
- amino acid sequence (1)
- anaplasia (1)
- anastomotic leakage (1)
- androgen-induced masculinization (1)
- animal physiology (1)
- annotation (1)
- appendectomy (1)
- appendicitis (1)
- arabidopsis thaliana (1)
- arginine metabolism (1)
- asexual reproduction (1)
- automated solid-phase Edman degradation (1)
- balance hypothesis (1)
- basal ganglia (1)
- bcl-X (1)
- beetle horns (1)
- behavioral conditioning (1)
- benzoquinone (1)
- beta-catenin (1)
- beta-oxidation (1)
- bevacizumab (1)
- binding protein (1)
- bioinformatic (1)
- biological sciences (1)
- biomarkers (1)
- blocking antibodies (1)
- bone morphogenetic proteins (1)
- brachtydacyly type A2 (1)
- brain development (1)
- brain disorders (1)
- brain metastases (1)
- breeding season (1)
- buparlisib (1)
- bush ecotone (1)
- caco-2 cells (1)
- calyx (1)
- cameleon (1)
- cancer biology (1)
- cancer cell (1)
- cancer cells (1)
- cancer diagnosis (1)
- cancer genomics (1)
- cancer microenvironment (1)
- cancer models (1)
- cancer predisposition syndromes (1)
- cancer therapy (1)
- canine cancer therapy (1)
- carbon dioxide (CO2) (1)
- carcinomas (1)
- cardiac aging (1)
- cardiac fibrosis (1)
- cardiolipin (1)
- cardiomyopathy (1)
- cathepsin (1)
- cell binding (1)
- cell biology (1)
- cell cycle (1)
- cell cycle and cell division (1)
- cell cycle control (1)
- cell fusion (1)
- cell size (1)
- cell velocimetry (1)
- cell-cycle arrest cancer therapy (1)
- cellline transfection (1)
- cellular senescence (1)
- central complex (1)
- cerebral metastases (1)
- chain reaction (1)
- chemical ecology (1)
- chemische Familienabzeichen (1)
- chemokine receptor (1)
- chemotherapy resistance (1)
- chimera formation (1)
- chimeric RTKs (1)
- cholesterol (1)
- chromatin structure (1)
- chromosome congression (1)
- circadian rhythm (1)
- climate (1)
- clinical malformations (1)
- coexistence (1)
- cold-shock (1)
- colon (1)
- colon resection (1)
- coloration (1)
- colorectal carcinoma (1)
- combination therapy (1)
- comparative genomics (1)
- complex (1)
- complex-III (1)
- conditioned response (1)
- conservation biology (1)
- contact inhibition (1)
- contralateral breast cancer (1)
- contributes (1)
- control group (1)
- conventional laparoscopic appendectomy (1)
- copy number (1)
- copy-number alteration (1)
- cortico-striatal synapse (1)
- cost-effectiveness (1)
- cryptic (1)
- crystal-structure (1)
- cultures (1)
- cysteine restriction (1)
- cysteine synthase inhibitor (1)
- cytokine (1)
- cytokinesis (1)
- cytosine base editor (CBE) toolbox (1)
- cytoskeleton (1)
- cytostatic (1)
- cytotoxicity (1)
- dMyc (1)
- dSPN (1)
- dachsous (1)
- das Promotor (1)
- das in vitro Transkriptionssystem (1)
- data storage (1)
- decapentaplegic (1)
- decay (1)
- decentralized control (1)
- decision-making (1)
- determination locus (1)
- determining genes (1)
- deuterostomes (1)
- developing country (1)
- developmental time (1)
- diacylglycerol (DAG) (1)
- diagnosis (1)
- digestive system (1)
- dimorphic expression (1)
- direct pathway (1)
- disease model (1)
- divergent expression regulation (1)
- division of labor (1)
- dmP53 (1)
- dominant-negative mutatio (1)
- drug discovery (1)
- drug selection (1)
- dynamic protein-protein interactions (1)
- dynamics (1)
- echinocytes (1)
- ecology (1)
- ecosystem services (1)
- electron microscopy (1)
- electroporation (1)
- embryonic stem cells (1)
- embryonic stem-cells (1)
- endoreplication (1)
- endosponge (1)
- energy homeostasis (1)
- energy restriction (1)
- enhancer (1)
- enteric glial cells (1)
- enteric nervous system (1)
- entomology (1)
- error (1)
- error-transfer (1)
- erythroyte invation (1)
- evolutionary genetics (1)
- evolutionary mutant model (1)
- exaptation (1)
- explainability of machine learning (1)
- expression (1)
- extracellular matrix (1)
- extrazelluläre Matrix (1)
- factor acetylhydrolase activity (1)
- fat (1)
- feature analysis (1)
- feature selection (1)
- feeding (1)
- fish model system (1)
- fishes Xiphophorus (1)
- fission (1)
- fitness (1)
- fjx (1)
- fjx1 (1)
- floor plate (1)
- flowering plants (1)
- flowers (1)
- fluorescence lifetime imaging microscopy (1)
- fluorescent recombinant vaccinia virus (1)
- fokale Adhäsionskinase (FAK) (1)
- foraging (1)
- forecasting (1)
- forest management (1)
- four-jointed (1)
- fungal infection (1)
- gain (1)
- gametocyte (1)
- gefitinib (1)
- gene duplications (1)
- gene editing (1)
- gene encoding noggin (1)
- gene prediction (1)
- gene regulatory network evolution (1)
- gene targeting (1)
- generation (1)
- genetic markers (1)
- genetic oscillators (1)
- genetic screen (1)
- genetic variation (1)
- genetics (1)
- genetischer Fingerabdruck (1)
- genome assembly (1)
- genome cells (1)
- genomic organization (1)
- genomic stability (1)
- genomics (1)
- genus Xiphophorus (1)
- geriatric (1)
- glioblastoma (1)
- global change (1)
- globotriaosylceramide (1)
- glucosaminoglycans (1)
- glucose restriction (1)
- glucose transporter (1)
- glycerol (1)
- gonadal development (1)
- gonopodium (1)
- growth factor beta (1)
- growth hormone gene (1)
- gut barrier (1)
- gut microflora (1)
- gynogeaesls (1)
- gynogenesis (1)
- harvesting (1)
- heart (1)
- hedge index (1)
- hedgerow (1)
- helitron (1)
- hemoglobin jet (1)
- hemolymph lipids (1)
- herbivorous diet (1)
- hereditary melanoma (1)
- herpes virus (1)
- heterogamety (1)
- heterosis (1)
- high-risk Prostate Cancer (1)
- high-risk prostate cancer (1)
- histology (1)
- homocysteine (1)
- honey bees (1)
- honeybee (1)
- host cell interface (1)
- human (1)
- human genomics (1)
- human melanoma (1)
- hybrid origin (1)
- hybrids (1)
- hyper-IL-6 (1)
- hypoxia-independent (1)
- immune cells (1)
- immunofluorescence microscopy (1)
- immunoprecipitation (1)
- immunotherapy (1)
- in vitro transcription (1)
- in-vivo expression (1)
- individuelles Kennen (1)
- induced pluripotent stem cells (1)
- inducible factor-I (1)
- infection (1)
- inflammation (1)
- inflammatory bowel disease (1)
- inhibition of H+ translocation (1)
- insect-fungus symbiosis (1)
- insecticide (1)
- integrated stress response (1)
- integrative genomics viewer (1)
- interaction (1)
- intercellular junctions (1)
- interleukin-13 (1)
- interleukin-4 (1)
- intermuscular bone (1)
- intestinal epithelial barrier (1)
- introgressive hybridization (1)
- kappa-B (1)
- key innovation (1)
- kidneys (1)
- kinase inhibitors (1)
- kinesin (1)
- kinetochore (1)
- knockout (1)
- lamina (1)
- lampbrush chromosomes (1)
- land use (1)
- land-use intensification (1)
- left hemicolectomy (1)
- lentic inland water bodies (1)
- life-cycle (1)
- ligand (1)
- light-driven metabolism (1)
- likelihood approach (1)
- linkage map (1)
- lipid desaturation (1)
- lipogenesis (1)
- liver (1)
- liver metastasis (1)
- lobula plate (1)
- local cues (1)
- localisation (1)
- locomotor activity (1)
- long-term outcome (1)
- long‐term monitoring (1)
- low carb (1)
- lymphocyte activation (1)
- lymphocyte differentiation (1)
- machine learning (1)
- maize (1)
- malaria (1)
- male size polymorphism (1)
- male-specific traits (1)
- malignant tumors (1)
- map (1)
- master sex-determining gene (1)
- mathematical modeling (1)
- measles virus (1)
- mechanisms of disease (1)
- medaka fish (1)
- medakafish oryzias latipes (1)
- meiosis (1)
- melanogaster (1)
- melanogenesis (1)
- melanoma ; oncogene regulation ; esterase ; molecular marker sequences (1)
- melanoma dedifferentiation (1)
- melanoma malignancy (1)
- membrane receptor signaling (1)
- meta-analysis (1)
- meta-data (1)
- metabolome (1)
- metabolomics (1)
- metastasis-directed therapy (1)
- metastatic melanoma (1)
- methionine (1)
- miR-126 (1)
- miR-146a (1)
- miR-193a (1)
- miR-205 (1)
- miR-21 (1)
- miR-22 (1)
- miRNA (1)
- mice (1)
- microRNA-221 (1)
- microRNAs (1)
- microarrays (1)
- microbial ecology (1)
- microclimate (1)
- microdissection (1)
- microhabitat (1)
- microphthalmia associated transcription factor (1)
- mimecan (1)
- mini-exon (1)
- mitochondria (1)
- mitochondrial DNA (1)
- mitochondrial genome (1)
- mitotic gene expression (1)
- mitotic genes (1)
- mitotic progression (1)
- model reduction (1)
- molecular biology (1)
- molecular mechanism (1)
- molecular mechanisms (1)
- molecular neuroscience (1)
- molecular recognition (1)
- molekulare Phylogenie (1)
- monoclonal antibody (1)
- monodelphis domestica (1)
- monolayer (1)
- morphogenetic protein receptors (1)
- mosquito (1)
- motor learning (1)
- mouse model (1)
- mouse testis differentiation (1)
- mullerian hormone AMH (1)
- multimodal (1)
- multiple myeloma (1)
- multisensory navigation (1)
- natural disturbance (1)
- natural enemies (1)
- natural processing (1)
- natural variation (1)
- natürliche Feinde (1)
- navigation (1)
- necrobiome (1)
- neisseria meningitidis (1)
- neoadjuvant (1)
- nephroblastomatosis (1)
- nervous system (1)
- nest climate (1)
- network simulation (1)
- neural networks (1)
- neural patterning (1)
- neuroblastoma (1)
- neuroblastoma – diagnosis (1)
- neuroethology (1)
- neuronal and synaptic plasticity (1)
- neuronale Musterbildung (1)
- neurons (1)
- neuroscience (1)
- neurospheres (1)
- neurotrophic factors (1)
- non-SBI fungicide (1)
- non-muscle myosin (1)
- non-small cell lung cancer (1)
- nutrients (1)
- nutrition (1)
- octogenerians (1)
- olfactory information (1)
- oligorecurrence (1)
- oncogene amplification (1)
- oncogene-induced senescence (1)
- oncogenic transformation (1)
- optogenetics (1)
- oreochromis niloticus (1)
- organization (1)
- organoid (1)
- oryzias latipes (1)
- oryzias-latipes (1)
- osteoglycin (1)
- ovary (1)
- oxaliplatin (1)
- ozone (O3) (1)
- p38 (1)
- pancreatic cancer (1)
- paralogs (1)
- parasitology (1)
- parasitophorous vacuole (1)
- parten-offspring conflict (1)
- paternal introgression (1)
- patient data (1)
- patient-derived organoid (PDOs) (1)
- patient-derived tumor organoid (PDTO) (1)
- pediatric (1)
- pediatric adrenocortical adenoma (1)
- pediatric adrenocortical cancer (1)
- pediatric adrenocortical tumor (1)
- pediatrics (1)
- perfusion culture (1)
- peroxisomal biogenesis disease (1)
- pesticide mixture (1)
- pharmacology (1)
- phenology (1)
- phenotypic plasticity (1)
- pheromone trail (1)
- phytanic acid (1)
- phytanoyl-CoA Hydroxylase (1)
- phänotypsche Plastizität (1)
- piRNA (1)
- pigment pattern (1)
- plant genomics (1)
- plant guilds (1)
- plant physiology (1)
- plant quality (1)
- plant-herbivore interactions (1)
- plant-insect interactions (1)
- plant–insect interactions (1)
- plaque assay (1)
- plaque isolation (1)
- plasmodium falciparum (1)
- platelet activation factor (1)
- platyfish (1)
- pluripotency (1)
- poeciliid fishes (1)
- poeciliidae (1)
- pollen (1)
- pollen foraging (1)
- polymerase (1)
- polyploidy (1)
- postoperative inflammation (1)
- pp6oc-src (1)
- predation pressure (1)
- principal (1)
- prognosis (1)
- prognostic factors (1)
- prognostic marker (1)
- proliferation assays (1)
- promoter (1)
- promoter affinity (1)
- promoter invasion (1)
- protein analysis (1)
- protein crystallography (1)
- protein domains (1)
- protein expression (1)
- protein interaction (1)
- protein interactions (1)
- protein kinases (1)
- protein lipidations (1)
- protein modifications (1)
- protein synthesis (1)
- protein-protein recognition (1)
- proximity labeling (1)
- proximity ligation (1)
- psychiatric disorders (1)
- racemase (1)
- radiation response (1)
- radiotherapy (1)
- ras (1)
- reactivating p53 and inducing tumor apoptosis (RITA) (1)
- reactive oxygen (1)
- regression analysis (1)
- regulation (1)
- regulatory regions (1)
- relA (1)
- renal cancer (1)
- renal cell carcinoma (1)
- reporter screen (1)
- reproductive character displacement (1)
- resistance (1)
- response threshold models (1)
- retinoic acid (1)
- retrotransposons (1)
- reverse transcriptase-polymerase chain reaction (1)
- risk factor (1)
- risk spreading (1)
- robotic surgery (1)
- rolling-circle transposons (1)
- salivary gland (1)
- salvage radiotherapy (1)
- sarcomere (1)
- satellite DNA (1)
- scalable functional genomic screening (1)
- self-organization (1)
- semi-natural habitat (1)
- senescence (1)
- sensory cues (1)
- sensory neurons (1)
- sequence motif analysis (1)
- sequencing data (1)
- sex chromosome evolution (1)
- sex combs (1)
- sex-determining genes. (1)
- sex-determining region (1)
- sexual conflict (1)
- sexual development (1)
- sexual development dysgenesis (1)
- sexually antagonistic genes (1)
- signal peptide peptidase (1)
- signal tranduction (1)
- signaling (1)
- signalling (1)
- signalling pathways (1)
- simple repeat sequences (1)
- simple repetitive sequences (1)
- single cell analysis (1)
- single-port appendectomy (1)
- size polymorpbism (1)
- skin (1)
- small RNA-sequencing (1)
- small interferring RNA (1)
- snoRNA (1)
- social bees (1)
- social organization (1)
- socioeconomic (1)
- sodal domlnance (1)
- somatic mutations (1)
- spatial representation (1)
- species diversification (1)
- spermatogenesis (1)
- squalius alburnoides (1)
- squamous (1)
- squamous cell carcinoma (1)
- squamous tumors (1)
- stage III (1)
- stringent response (1)
- structural biology (1)
- sturgeon (1)
- sturgeon karyotype (1)
- sublethal effect (1)
- succession (1)
- successional trajectory (1)
- surgery (1)
- surgical and invasive medical procedures (1)
- surgical oncology (1)
- surgical site infection (1)
- survival (1)
- swordtails (1)
- synaptic plasticity (1)
- synergistic effect (1)
- synthetic biology (1)
- systematic review (1)
- systems biology (1)
- tandem repeats (1)
- target molecule (1)
- teleost fish (1)
- teleost flsh (1)
- teleostei (1)
- telomeres (1)
- temperature sensitive (1)
- temperatursensitiv (1)
- thermoregulation (1)
- thiol starvation (1)
- time series (1)
- tissue engineering (1)
- tools overview (1)
- topminnow (1)
- transcriptional rewiring (1)
- transcriptomics (1)
- transgenic fish (1)
- transitional shrubland (1)
- translation initiation (1)
- translational research (1)
- transmission (1)
- transplantation (1)
- transposition (1)
- tree selection (1)
- tremble dance (1)
- triglyceride accumulation (1)
- tropics (1)
- true bug (1)
- tumor (1)
- tumor disease (1)
- tumor surveillance (1)
- tumor-associated macrophage (1)
- tumour heterogeneity (1)
- tumour immunology (1)
- ubiquitin (1)
- ultrasound vocalizations (1)
- urbanization (1)
- vaccinia virus (1)
- variant detection (1)
- variants of unknown significance (1)
- vemurafenib (1)
- vertebrates (1)
- vessels (1)
- virulenceregulatory evolution (1)
- visual memory (1)
- visual system (1)
- volume (1)
- von Willebrand type C domain (1)
- water beetles (1)
- whole genome (1)
- whole genome duplication (1)
- whole genome duplications (1)
- whole-genome duplication (1)
- whole-genome sequencing (1)
- worker piping (1)
- wound infection (1)
- wrong labelling (1)
- xiphophorus maculatus (1)
- zoology (1)
- ΔNp63 (1)
- α-Galactosidase A (1)
- β3 adrenergic receptor (ADRB3) (1)
- ∆Np63 (1)
Institute
- Theodor-Boveri-Institut für Biowissenschaften (336)
- Klinik und Poliklinik für Allgemein-, Viszeral-, Gefäß- und Kinderchirurgie (Chirurgische Klinik I) (24)
- Comprehensive Cancer Center Mainfranken (21)
- Pathologisches Institut (15)
- Graduate School of Life Sciences (11)
- Medizinische Klinik und Poliklinik II (9)
- Rudolf-Virchow-Zentrum (8)
- Klinik und Poliklinik für Dermatologie, Venerologie und Allergologie (7)
- Klinik und Poliklinik für Strahlentherapie (7)
- Urologische Klinik und Poliklinik (7)
Sonstige beteiligte Institutionen
- Mildred-Scheel-Nachwuchszentrum (2)
- IZKF Laboratory for Microarray Applications, University Hospital of Wuerzburg, Wuerzburg, Germany (1)
- Microarray Core Unit, Interdisciplinary Center for Clinical Science, University of Würzburg, Versbacher Straße, Würzburg 97080, Germany (1)
- Mildred Scheel Early Career Center (1)
Interleukin-4 (IL-4) und Interleukin-13 (IL-13) sind bedeutende Regulatorproteine des Immunsystems. Sie spielen eine entscheidende Rolle bei der Entstehung und dem Verlauf von allergischen Erkrankungen, wie z.B. Asthma. Um ihre Signale in die Zielzelle zu transduzieren, kann von beiden Zytokinen der gleiche Zelloberflächenrezeptor verwendet werden, wodurch sich die überlappenden, biologischen Funktionen erklären lassen. Dieser gemeinsam genutzte Rezeptor ist aus den beiden Untereinheiten IL-4Ralpha; und IL-13Ralpha1 aufgebaut. Da IL-4 und IL-13 auf Aminosäureebene nur etwa 25% Sequenzidentität besitzen und stark unterschiedliche Affinitäten zu den beiden Rezeptorketten besitzen, stellt sich die Frage, durch welchen molekularen Erkennungsmechanismus, die Affinität und die Spezifität der Ligand-Rezeptor-Interaktion unabhängig voneinander reguliert werden kann. In dieser Arbeit gelang es, rekombinante Expressions- und Aufreinigungsstrategien für IL-13 und die extrazellulären Domänen der Rezeptorketten IL-13Ralpha1 und IL-13Ralpha2 zu entwickeln. Dadurch war es mögliche, eine breite Mutations-/Interaktionsanalyse der IL-13Ralpha1-Kette durchzuführen.Es konnte gezeigt werden, dass die N-terminale FnIII-ähnliche Domäne von IL-13Ralpha1 sowohl an der Bindung von IL-13 als auch an der Interaktion mit IL-4 beteiligt ist. Im funktionellen Bindeepitop der IL-13Ralpha1-Kette wurden die Aminosäurereste Arg84, Phe253 und Tyr321 als Hauptbindungsdeterminanten für die Interaktion mit IL-13 identifiziert. Durch die Interaktionsstudien der IL-13Ralpha1-Varianten mit IL-4 wurde gezeigt, dass diese Hauptbindungsdeterminanten auch für die niederaffine Bindung von IL-4 von größter Bedeutung sind. Die funktionellen Bindeepitope für IL-4 und IL-13 auf der IL-13Ralpha1-Kette sind nahezu identisch und überlappen in einem großen Bereich. Aufgrund der Ergebnisse aus der Mutagenesestudie war es möglich, ein Strukturmodell der extrazellulären Domäne der IL-13Ralpha1-Kette zu erstellen. Darin wird eine neuartige Orientierung der N-terminalen FnIII-Domäne und deren Beteiligung an der Ligandeninteraktion dargestellt. Mit Hilfe des Strukturmodells gelang es, neue Aminosäurerest auf der Oberfläche von IL-13 zu identifizieren, die an der Bindung zu IL-13Ralpha1 beteiligt sind, was die Relevanz des Strukturmodells weiter unterstreicht. In einem weiteren Teil dieser Arbeit wurde versucht, den molekularen Mechanismus aufzuklären, durch den es den superagonistischen IL-4-Varianten T13D und F82D gelingt, mit dreifach höherer Affinität an die IL-4Ralpha-Kette zu binden, als wildtypischer Ligand. Durch strukturelle und funktionelle Untersuchungen wurde gezeigt, dass der Affinitätssteigerung ein indirekter Mechanismus zugrunde liegt, bei dem eine Konformationsänderung und die Fixierung der Arg85-Seitenkette von IL-4 zur Ausbildung von zusätzlichen Ligand-Rezeptor-Interaktionen führt. Das Bindeepitop zwischen IL-4 und der IL-4Ralpha-Kette besitzt eine modulare Architektur aus drei unabhängig voneinander agierenden Interaktionsclustern. Bei der Interaktion von wildtypischem IL-4 mit IL-4Ralpha tragen nur zwei dieser Cluster in signifikanter Weise zur freien Bindeenergie bei. Im Falle der superagonistischen IL-4-Varianten ist jedoch auch das dritte Cluster an der Generierung von zusätzlicher, freier Bindeenergie beteiligt, wodurch die Affinität zwischen Ligand und Rezeptor erhöht wird. Damit stellt der modulare Aufbau der Interaktionsfläche zwischen IL-4 und der IL-4Ralpha-Kette möglicherweise einen Mechanismus dar, über den Proteine die Affinität von Wechselwirkungen über einen großen Bereicht variieren können, ohne dabei Spezifität einzubüssen. Da IL-4 und IL-13 als interessante Zielmoleküle für die Therapie von allergischen und asthmatischen Erkrankungen erkannt worden sind, können die in der vorliegenden Arbeit gewonnenen Informationen über den Bindemechanismus und die Einblicke in den molekularen Charakter der Interaktion zwischen den beiden Zytokinen und ihren spezifischen Rezeptorketten dabei helfen, neuartige und hoch spezifische, inhibitorische Moleküle zu entwickeln.
Die Bedeutung der genomischen Instabilität in humanen melanocytischen Läsionen ist Gegenstand vieler dermatologischer Studien und bis heute ungeklärt. Ist die Mikrosatelliteninstabilität bloße Begleiterscheinung der unkontrolliert proliferierenden Tumorzellen oder wird ihr ein pathogenetischer Mechanismus zuteil? In Fischen der Gattung Xiphophorus können durch klassische Kreuzungsexperimente melanocytische Läsionen verschiedener Malignitätsgrade induziert werden. Diese Läsionen sind auf Grund ihres genetisch kontrollierten Hintergrundes eindeutig definiert und reproduzierbar - und damit im Vorteil gegenüber der unsicheren Klassifikation humaner Hautläsionen. In der vorliegenden Arbeit wurde hauptsächlich der Frage nachgegangen, ob MIN+ ein obligates molekulares Ereignis für die Progression von Melanomen bis zum terminalen Stadium darstellt. Dieser Fragestellung wurde unter Verwendung PCR-basierter Mikrosatellitenanalysen sowie Multilocus DNA-Fingerprint Analysen nachgegangen. 23 Tumoren unterschiedlicher Malignität wurden im Vergleich zum tumorfreien Normalgewebe desselben Fisches an 12 Genloci unbekannter chromosomaler Lokalisation auf Mikrosatelliteninstabilität untersucht. Es wurde insgesamt eine Zahl von 263 informativen Loci erzielt, von denen sich nur 20 ( = 7.6%) als instabil erwiesen. Mittels der Multilocus-Fingerprint Analysen wurden 8 Melanome und deren korrespondiere Normalgewebe mit drei Sonden hybridisiert. Nur einer von 12 analysierbaren MLFPs zeigte eine genetische Aberration in Form einer Deletion einer einzelnen Bande im Tumorgewebe. Mit diesem Ergebnis wurde das in der Mikrosatellitenanalyse erhaltene Resultat einer nicht signifikanten Mikrosatelliteninstabilität im Xiphophorus-Melanom-Modell System bestätigt. Zusammenfassend kann gesagt werden, daß die Abwesenheit eines MIN+-Phänotypen in den Melanomen von Xiphophorus darauf hinweist, daß der Erwerb von MIN weder ein notwendiges Kriterium für die Initiation eines Tumors noch für seine Progression darstellt. Ein anderer Pfad der Tumorinitiation ist die direkte Schädigung oder der Verlust von Tumorsuppressorgenen, von in Mismatch Repair involvierten Genen oder durch die Transformation von Proto-Onkogenen zu Onkogenen. In dieser Arbeit wurde die Expression von drei Genen, die in der Regulation des Zellzyklus Schlüsselrollen spielen (rb, p53, cdkn2a), sowie einer Komponente des MMR-Systems (MSH2) auf RNA-Ebene untersucht. Ihre Expressionsstärke wurde in folgenden Geweben miteinander verglichen: Maligne Melanome, benigne Läsionen, tumorfreie Kontrollgewebe und die Xiphophorus-Melanomzellinie (PSM). MSH2 und p53 wurden in allen untersuchten Geweben auf gleichem Niveau exprimiert. Die vergleichende Expressionsanalyse des vermeintlichen "melanoma susceptibility gene" cdkn2a im Melanom-Modell und der PSM-Zellinie bestätigte die bereits vorbeschriebene Überexpression des Zellzyklusinhibitors in malignen Melanomen von Xiphophorus-Hybriden. Die Untersuchung des Expressionsmusters von Rb in den oben genannten Geweben ergab eine verminderte Transkription dieses Gens in malignen Melanomen. Eine mögliche Interpretation dieses Ergebnisses wäre, einen Defekt in Rb oder pRB zu Grunde zu legen und die Hochregulation von cdkn2a entsprechend einer negativen Rückkopplungsschleife als physiologische Konsequenz anzusehen.
Regulation of mitotic progression : Focus on Plk1 function and the novel Ska complex at kinetochores
(2006)
During mitosis the duplicated chromosomes have to be faithfully segregated into the nascent daughter cells in order to maintain genomic stability. This critical process is dependent on the rearrangement of the interphase microtubule (MT) network, resulting in the formation of a bipolar mitotic spindle. For proper chromosome segregation all chromosomes have to become connected to MTs emanating from opposite spindle poles. The MT attachment sites on the chromosomes are the kinetochores (KTs), which are also required to monitor the integrity of KT-MT interactions via the spindle assembly checkpoint (SAC). The first part of this work concerns the action of Polo-like kinase 1 (Plk1). Plk1 is one of the most prominent mitotic kinases and is involved in the regulation of multiple essential steps during mitosis consistent with its dynamic localisation to spindle poles, KTs and the central spindle. Despite a nice model of Plk1 targeting to different mitotic structures via its phosphopeptide binding Polo-box domain (PBD), the exact molecular details of Plk1 functioning, in particular at the KTs, remain obscure. By two different approaches we obtained cells with an unlocalised Plk1 kinase activity: first by generating stable HeLa S3 cell lines, which upon induction expressed the PBD and thus displaced endogenous Plk1 from its sites of action. Secondly, by rescuing cells RNAi-depleted of Plk1 with the catalytic Plk1 domain only. Centrosome maturation, bipolar spindle assembly and loss of cohesion between the chromatid arms proceeded normally in either cells, in contrast to Plk1-depleted cells, arguing that PBD-mediated targeting of Plk1 is less critical for the tested functions. Remarkably, however, both the PBD expressing as well as the Plk1-depleted cells rescued with the catalytic domain of Plk1 arrested in early mitosis in a SAC-dependent manner with uncongressed chromosomes. These data disclose a so far unrecognised role of Plk1 in proper chromosome congression and point at a particular requirement for PBD-mediated localised Plk1 activity at the KTs. In the second part of the thesis, we characterised a novel spindle and KT associated protein, termed Ska1, which was originally identified in a spindle inventory. Ska1 associated with KTs following MT attachment during prometaphase and formed a complex with at least another novel protein of identical localisation, called Ska2. Ska1 was required for Ska2 stability in vivo and depletion of either Ska1 or Ska2 resulted in the loss of both proteins from the KTs. The absence of Ska proteins did not disrupt overall KT structure but most strikingly induced cells to undergo a prolonged SAC-dependent delay in a metaphase-like state. The delay was characterised by weakened kinetochore-fibre stability, recruitment of Mad2 protein to a few KTs and the occasional loss of individual chromosomes from the metaphase plate. These data indicate that the Ska1/2 complex plays a critical role in the maintenance of a KT-MT attachments and/or SAC silencing.
The vertebrate spinal cord is composed of billions of neurons and glia cells, which are formed in a highly coordinated manner during early neurogenesis. Specification of these cells at distinct positions along the dorsoventral (DV) axis of the developing spinal cord is controlled by a ventrally located signaling center, the medial floor plate (MFP). Currently, the origin and time frame of specification of this important organizer are not clear. During my PhD thesis, I have analyzed the function of the novel secreted growth factor Midkine-a (Mdka) in zebrafish. In higher vertebrates, mdk and the related factor pleiotrophin (ptn) are widely expressed during embryogenesis and are implicated in a variety of processes. The in-vivo function of both factors, however, is unclear, as knock-out mice show no embryonic phenotype. We have isolated two mdk co-orthologs, mdka and mdkb, and one single ptn gene in zebrafish. Molecular phylogenetic analyses have shown that these genes evolved after two large gene block duplications. In contrast to higher vertebrates, zebrafish mdk and ptn genes have undergone functional divergence, resulting in mostly non-redundant expression patterns and functions. I have shown by overexpression and knock-down analyses that Mdka is required for MFP formation during zebrafish neurulation. Unlike the previously known MFP inducing factors, mdka is not expressed within the embryonic shield or tailbud but is dynamically expressed in the paraxial mesoderm. I used epistatic and mutant analyses to show that Mdka acts independently from these factors. This indicates a novel mechanism of Mdka dependent MFP formation during zebrafish neurulation. To get insight into the signaling properties of zebrafish Mdka, the function of both Mdk proteins and the candidate receptor Anaplastic lymphoma kinase (Alk) have been compared. Knock-down of mdka and mdkb resulted in the same reduction of iridophores as in mutants deficient for Alk. This indicates that Alk could be a putative receptor of Mdks during zebrafish embryogenesis. In most vertebrate species a lateral floor plate (LFP) domain adjacent to the MFP has been defined. In higher vertebrates it has been shown that the LFP is located within the p3 domain, which forms V3 interneurons. It is unclear, how different cell types in this domain are organized during early embryogenesis. I have analyzed a novel homeobox gene in zebrafish, nkx2.2b, which is exclusively expressed in the LFP. Overexpression, mutant and inhibitor analyses showed that nkx2.2b is activated by Sonic hedgehog (Shh), but repressed by retinoids and the motoneuron-inducing factor Islet-1 (Isl1). I could show that in zebrafish LFP and p3 neuronal cells are located at the same level along the DV axis, but alternate along the anteroposterior (AP) axis. Moreover, these two different cell populations require different levels of HH signaling and nkx2.2 activities. This provides new insights into the structure of the vertebrate spinal cord and suggests a novel mechanism of neural patterning.
Flagellar motility and chemotaxis are essential virulence traits required for the ability of Helicobacter pylori to colonize the gastric mucosa. The flagellar regulatory network and the complex chemotaxis system of H. pylori are fundamentally different from other bacteria, despite many similarities. In H. pylori expression of the flagella is controlled by a complex regulatory cascade involving the two-component system FlgR-HP244, the sigma factors 54 and 28 and the anti-sigma 28 factor FlgM. Thus far, the input signal for histidine kinase HP244, which activates the transcriptional regulator FlgR, which triggers sigma factor 54-dependent transcription of the flagellar class 2 genes, is not known. Based on a yeast two-hybrid screen a highly significant protein-protein interaction between the H. pylori protein HP137 and both the histidine kinase HP244 and the flagellar hook protein HP908 (FlgE´) has been reported recently (Rain et al., 2001). So far, no function could be assigned to HP137. Interestingly, the interaction between HP137 and histidine kinase HP244 was observed in the characteristic block N sequence motif of the C-terminal ATP-binding kinase domain. In this work a potential role of HP137 in a feedback regulatory mechanism controlling the activity of histidine kinase HP244 in the flagellar regulation of H. pylori was investigated. Although the substitution of the gene encoding HP137 by a kanamycin cassette resulted in non-motile bacteria, the failure to restore motility by the reintroduction of hp137 in cis into the mutant strain, and the observation that HP137 has no significant effect on the activity of histidine kinase HP244 in vitro indicated that HP137 is not directly involved in flagellar regulation. Therefore, it was demonstrated that HP137 does not participate in the regulation of flagellar gene expression, neither in H. pylori nor in the closely related bacterium C. jejuni. Chemotactic signal transduction in H. pylori differs from the enterobacterial paradigm in several respects. In addition to a CheY response regulator protein (CheY1) H. pylori contains a CheY-like receiver domain (CheY2) which is C-terminally fused to the histidine kinase CheA. Furthermore, the genome of H. pylori encodes three CheV proteins consisting of an N-terminal CheW-like domain and a C-terminal receiver domain, while there are no orthologues of the chemotaxis genes cheB, cheR, and cheZ. To obtain insight into the mechanism controlling the chemotactic response of H. pylori the phosphotransfer reactions between the purified two-component signalling modules were investigated in vitro. Using in vitro phosphorylation assays it was shown that both H. pylori histidine kinases CheAY2 and CheA´ lacking the CheY-like domain (CheY2) act as ATP-dependent autokinases. Similar to other CheA proteins CheA´ shows a kinetic of phosphorylation represented by an exponential time course, while the kinetics of phosphorylation of CheAY2 is characterized by a short exponential time course followed by the hydrolysis of CheAY2~P. Therefore, it was demonstrated that the presence of the CheY2-like receiver domain influences the stability of the phosphorylated P1 domain of the CheA part of the bifunctional protein. Furthermore, it was proven that both CheY1 and CheY2 are phosphorylated by CheAY2 and CheA´~P and that the three CheV proteins mediate the dephosphorylation of CheA´~P, although with a clearly reduced efficiency as compared to CheY1 and CheY2. Moreover, CheA´ is capable of donating its phospho group to the CheY1 protein from C. jejuni and to CheY protein from E. coli. Retrophosphorylation experiments indicated that CheY1~P is able to transfer the phosphate group back to the HK CheAY2 and the receiver domain present in the bifunctional CheAY2 protein acts as a phosphate sink fine tuning the activity of the freely diffusible CheY1 protein, which is thought to interact with the flagellar motor. Hence, in this work evidence of a complex phosphorelay in the chemotaxis system was obtained which has similarities to other systems with multiple CheY proteins. The role of the CheV proteins remain unclear at the moment, but they might be engaged in a further fine regulation of the phosphate flow in this complex chemotaxis system and the independent function of the two domains CheA´ and CheY2 is not sufficient for normal chemotactic signalling in vivo.
Die BMPs (Bone morphogenetic proteins) sind Zytokine, die in fast allen Tieren exprimiert werden und zur TGF-β Superfamilie gehören. Sie spielen eine wichtige Rolle in der Knochenentwicklung, unter anderem auf Grund ihrer Fähigkeit, die Neubildung von Knochen auszulösen. Eine weitere Aufgabe der BMPs liegt in der Beeinflussung der Embryogenese. Hier tragen sie zur Differenzierung der einzelnen Keimblätter bei und werden während der Organogenese in vielen Organanlagen exprimiert. Ep45, ein Protein aus Xenopus laevis, gehört zur Familie der Serinproteaseinhibitoren und ist ein extrazellulärer Ligand von BMP4, ohne jedoch dessen Rezeptorbindung bzw. dessen Aktivität zu beeinflussen. Ep45, auch bekannt unter dem Namen pNiXa, wird in der Embryogenese von Xenopus laevis wirksam: Es induziert die Reifung von Oozyten, kann im weiteren Verlauf in verschiedenen Organanlagen nachgewiesen werden und wird in Zusammenhang gebracht mit Teratogenität, die durch Ni2+ hervorgerufen wird. Um auf die aufwendige Isolierung von Ep45 aus Xenopus-Oozyten bzw. –Embryonen verzichten zu können, sollte in dieser Arbeit eine Methode zur rekombinanten Expression und Isolierung von aktivem Ep45 entwickelt werden. Zunächst wurde die Expression von Ep45 in E. coli als lösliches Einzelprotein mit dem Vektor pET25b(+) angestrebt. Da sich jedoch zeigte, dass das Protein zum Großteil als unslösliche Aggregate in Form von inclusion bodies vorlag, wurden diese präpariert, denaturiert und eine Isolierung von Ep45 durch verschiedene Chromatographie-Verfahren (Kationenaustauschersäule, Gelchromatographie) unternommen. Durch die nachfolgenden Renaturierungsversuche konnte jedoch kein aktives Protein gewonnen werden. Zum Nachweis von aktivem Ep45 dienten ein Enzymassay, der auf der Serinproteaseinhibitor-Funktion von Ep45 beruht, sowie ein Bindungsassay. Dieser weist den Ep45-Chymotrypsin-Komplex nach, der bei der Inhibition von Chymotrypsin durch Ep45 entsteht. Als alternatives Expressionssystem kam deshalb das pMal™-Fusionsprotein-System zur Anwendung. Dazu wurde Ep45 an MBP gekoppelt, so dass eine Aufreinigung mittels Chromatographie an einer Amylosesäule möglich werden sollte. Nach Spaltung durch Faktor Xa sollten die beiden Proteine durch Chromatographie voneinander getrennt werden, so dass schließlich Ep45 als reines aktives Protein vorliegt. Trotz des Einsatzes diverser Chromatographie-Verfahren (Ionentauschersäule, hydrophobe Säule, Nickelsäule) gelang keine Isolierung von Ep45. Da in E. coli zwar eine Expression jedoch keine Aufreinigung von aktivem Ep45 gelang, wurde ein Expressionssystem unter Verwendung von Sf9-Zellen (Insektenzellen) eingesetzt. Nach Herstellung des Plasmids pIZT/V5-xEp45 wurden Versuche zur transienten Expression von Ep45 in Sf9-Zellen mittels des InsectSelect™ Systems durchgeführt, die bis zum Abschluss meiner praktischen Arbeit nicht zum Erfolg führten, aber innerhalb der Arbeitsgruppe weiter bearbeitet werden.
Das four-jointed (fj) Gen in Drosophila ist zum einen am proximo-distalen Längenwachstum der Extremitäten beteiligt, zum anderen spielt es auch eine Rolle in dem in neuerer Zeit verstärkt untersuchten planaren Zellpolaritätssignalweg (PCP-Signalweg). Über das in der Maus identifizierte homologe fjx1 Gen ist dagegen vergleichsweise wenig bekannt. Ziel dieser Arbeit war daher die nähere Charakterisierung von fjx1 sowie die Identifizierung möglicher Interaktionspartner. Durch RNA in situ Hybridisierung wurde zunächst das räumliche und zeitliche Expressionsmuster von fjx1 in Embryonen und adulten Organen untersucht. Dabei zeigte sich, dass fjx1 in allen Stadien vor allem im Gehirn, aber auch in epithelialen Strukturen verschiedener Organe exprimiert war. Obwohl die Expression von fjx1 ebenso wie die von fj über den Notch-Signalweg reguliert wird, konnte im Gegensatz zu Drosophila jedoch keine Regulation von fjx1 über den Wnt- und/oder den JAK/STAT-Signalweg nachgewiesen werden. Da Fj in Drosophila zumindest teilweise sezerniert wird und nicht-zellautomome Effekte zeigt, wurde ein Fjx1-Rezeptor gesucht. Mit Hilfe eines Fjx1-AP Fusionsproteins konnten Bindungsstellen überlappend bzw. angrenzend zu Regionen mit fjx1-Expression gefunden werden. Beispielsweise zeigten in der embryonalen Lunge und der Niere sowohl die in situ Hybridisierung (fjx1-Expression) als auch die Inkubation mit dem Fusionsprotein (Lokalisation des Bindungspartners) Färbung in epithelialen Strukturen, während im adulten Gehirn die Färbungen in jeweils benachbarten Schichten des Hippocampus und des Kleinhirns detektiert wurden. Durch Expressionsklonierung bzw. Coimmunpräzipitation konnte der Rezeptor jedoch nicht identifiziert werden. Aufgrund der Tatsache dass fj in Drosophila in enger Beziehung zu dachsous (ds) und fat (ft) steht, wurden die homologen Gene in der Maus gesucht und deren Expressionsmuster analysiert. In Embryonalstadien war dchs1 komplementär zu fjx1 in mesenchymalen Geweben zu finden, ähnlich der Situation in Drosophila, wo fj und ds in gegenläufigen Gradienten exprimiert sind. Das homologe Gen von ft, fat-j, war hingegen nicht ubiquitär exprimiert, sondern wie dchs1 im Mesenchym. Ergänzend dazu wurden die fat-like (ftl) Homologen, fat1-3, epithelial detektiert. Die Expression in adulten Organen wurde mit Real-Time-PCR untersucht, die zeigte, dass alle Gene (fj, ds und fat Homologe) relativ stark im adulten Gehirn zu finden sind. Mit Hilfe von RNA in situ Hybridisierungen konnten die Gene im Riechhirn, im Hippocampus und im Kortex des Großhirns sowie in der Körnerschicht des Kleinhirns lokalisiert werden. Um Hinweise auf die Funktion von Fjx1 zu erhalten, wurde in Datenbanken nach Proteinen mit ähnlicher Aminosäuresequenz gesucht, die eventuell Auskunft über mögliche Proteindomänen geben sollten. Bei den gefundenen fünf Mausproteinen handelte es sich jedoch um hypothetische bzw. noch nicht untersuchte Proteine, so dass Rückschlüsse auf die Funktion von Fjx1 nicht möglich waren. Die Expression dieser Gene war nach Datenbankangaben entweder sehr spezifisch, beschränkt auf ein bestimmtes Gewebe (z.B. Milchdrüse oder Nebenniere) oder schwach und dafür ubiquitär, was sich auch durch eine schwache, einheitliche Färbung in der RNA in situ Hybridisierung bestätigte. Die Proteinstruktur von Fjx1 und der Fjx1-ähnlichen Proteine sowie die Art der konservierten Reste geben Grund zu der Annahme, dass es sich um (sezernierte) Glykosyltransferasen handeln könnte, was durch die zumindest zeitweise Lokalisation von Fjx1 im Golgi-Apparat bestärkt wird. Auch die in Drosophila gefundenen Ergebnisse sprechen für eine derartige Funktion von Fj, obwohl auch hier noch keine konkreten biochemischen Belege vorliegen. Die Ergebnisse dieser Arbeit deuten auf eine Konservierung des in Drosophila entdeckten Fj/Ds/Ft-Siganlwegs in Vertebraten hin, wenn auch der genaue Mechanismus der Interaktion zwischen den Proteinen noch nicht geklärt ist und weiterer Untersuchungen bedarf.
BMPs influence a variety of cellular processes. They have been shown to regulate proliferation, differentiation, migration and apoptosis and thus play central roles during developmental processes and tissue homeostasis. Ligand mediated signal transduction is transmitted via BMP type I and BMP type II receptors, both members of the serine/threonine kinase superfamily. The BMP receptor mediated signal transduction is not explored in detail. Therefore our aim was to address different aspects of BMP mediated signal transduction with main focus on BRII and its regulation. Due to the existence of two alternative splice variants, a long and a short form, the function of the two variants and the impact of the C-terminal extension are of general interest. Moreover, mutations in the BMPR2 gene were identified to be responsible for PPH, a autosomal dominant lung disease. In this thesis, BRII phosphorylation and signalling mediated by different receptor oligomers were investigated and multiple BRII associated proteins were identified. We could show that the oligomerization pattern of BMP receptors exhibits a higher degree of flexibility compared to other receptors of that superfamily. In the present work the BMP2 mediated signal transduction should be examined, depending on the receptor oligomerization pattern. Using kinase-deficient mutants, it could be demonstrated, that signalling via preformed BMP receptor complexes is mediated by the well characterized Smad1/5/8 pathway, whereas signalling initiated by BMP2 induced recruitment of the receptors activates the p38 pathway and leads to Alkaline Phosphatase production. To further study signalling events triggered directly from the BRII a proteomics-based screen for BRII associated proteins was performed. 53 associated proteins were found, the majority being signal transducing molecules, but in addition metabolic proteins, transcriptional regulators and others were identified. These proteins enable to gain a deeper insight in BMP mediated signalling. One of the interactors, the receptor tyrosine kinase c-kit, was characterized in more detail. It could be demonstrated, that BRII and c-kit form a complex in vitro and in vivo, and the interaction is enhanced upon BMP2 stimulation. 2D phosphopeptid mapping showed that BRII is phosphorylated at S757 upon activation of c-kit by SCF. Moreover, c-kit and its ligand SCF are modulating BMP2 pathways, by enhancing Smad1/5 phosphorylation, Smad-transcriptional activity, Alkaline Phosphatase production and expression of Cbfa1. All these pathways hint towards modulation of the osteoblast development via c-kit. Thus, we were able to develop a novel paradigm for the BMP2 meditated signalling. One of the initial triggers for BRII is the auto-phosphorylation of BRII. Here we analyze ligand-independent as well as ligand-dependent phosphorylation of BRII. Some phosphorylation sites in BRII were identified. The general phosphorylation occurs mostly on serines. S815, S818 and Y825 are identified targets of phosphorylation whose function is still unclear. However phosphorylation of S336 is demonstrated to be essential for BRII activation. The elucidation of BMP receptor phosphorylation and oligomerization as well as the impact of a number of BRII associated proteins (such as c-kit), demonstrated in this thesis that BMP signalling has to be regulated precisely on multiple levels. This can be useful for the development of selective signalling inhibitors for basic research and therapeutic approaches of PPH and other diseases.
Kälteschockproteine werden in Bakterien, gleichermaßen wie die gut charakterisierten Hitzeschockproteine, bei hohen Temperaturschwankungen stark induziert und ermöglichen der Zelle durch unterschiedliche Funktionen ein Wachstum in der Kälte. In dieser Promotionsarbeit wurde begonnen, die Kälteschock-Antwort von Bakterien des Genus Bordetella zu charakterisieren. Sowohl B. bronchiseptica als auch B. pertussis codieren für fünf Kälteschockproteine, die als CspA, CspB, CspC, CspD und CspE bezeichnet werden. Die fünf Proteine weisen eine signifikante Homologie zum Haupt-Kälteschockprotein CspA aus E. coli auf. Während in den Modellorganismen E. coli und B. subtilis mindestens vier (E. coli) bzw. alle drei (B. subtilis) csp-Gene deletiert sein müssen, um einen Wachstumsdefizit zu erkennen, genügt im Falle von B. bronchiseptica eine einzige Insertionsmutation im Gen cspB, um einen temperaturunabhängigen Wachstumsdefekt zu beobachten. Nach einem Kälteschock werden in B. bronchiseptica drei der fünf csp-Gene, cspA, cspB und cspC, deutlich induziert. Betrachtet man das Expressionsmuster der fünf csp-Gene unter verschiedenen Stressbedingungen, wie Zugabe von translationshemmenden Antibiotika, Hitzeschock oder osmotischer Stress, so lässt sich ein komplexes Expressionsmuster aufzeichnen. Außerdem besitzen die drei kälteinduzierbaren Gene cspA, cspB und cspC mehrere Transkriptionsstartpunkte, deren Transkriptmengen unter den verschiedenen Schockbedingungen stark variieren. Es stellte sich heraus, dass eine Überexpression von CspB aus B. bronchiseptica für die E. coli – Zelle toxisch ist, daher wurde das CspB-Protein als GST-Fusionsprotein exprimiert und über Glutathion-Sepharose aufgereinigt. Um eine potentielle Funktion von CspB in der Zelle zu untersuchen, wurden Filterbindeassays mit CspB::GST durchgeführt. Es wurde eine hochaffine, aber unspezifische Bindung an ssDNA festgestellt, was auf eine mögliche Funktion von CspB als Chaperon hindeutet. Nach Synthese eines CspB-spezifischen Antikörpers wurde die Kälteinduktion von CspB auch auf Proteinebene nachgewiesen. Durch 2D-Gelelektrophorese und massenspektrometrische Charakterisierung konnten 17 weitere kälteinduzierbare Proteine aus B. bronchiseptica identifiziert werden. Darunter waren u. a. ein Chaperon mit Ähnlichkeit zu GroES, ein Translationsinhibitor BB2940 und das CspB. Diese kälteinduzierbaren Proteine ähneln den CIPs aus E. coli. Weiterhin konnten noch das UspA und mehrere am Metabolismus beteiligte Proteine als CIPs aus B. bronchiseptica identifiziert werden, was signifikante Unterschiede in Bezug auf die Kälteadaptation zwischen den beiden Organismen aufzeigt. Betrachtet man die Promotorbereiche aller identifizierten csp-Gene, so fällt eine für diese Gene typische sehr lange 5’UTR auf. Innerhalb dieser upstream Region findet man in vier der fünf csp-Gene einen 9 bp langen Consensus mit der Sequenz TCCTTGATT, der in nahezu gleichem Abstand vom postulierten Startcodon vorkommt. Diese identifizierte 9bp-box ist für eine effiziente Transkription in der Kälte jedoch nicht von Bedeutung. Auf posttranskriptioneller Ebene wird die lange 5’UTR für die Stabilisierung der cold-shock mRNA in der Kälte verantwortlich gemacht. Außerdem ist das Vorhandensein der kompletten 5’UTR essentiell für eine effiziente Translation bei niedriger Temperatur, wobei eine Mutation der 9bp-box einen geringen, aber signifikanten negativen Effekt auf die Translation ausübt. Sechs Gene, der neu identifizierten CIPs, beinhalten ebenfalls eine 9bp-box in ihrer upstream Region. Interessanterweise werden zwei der fünf csp-Gene, cspC und cspD, vom BvgAS Zweikomponentensystem, dem Haupttranskriptionsregulator der Virulenzgene im Genus Bordetella, reguliert. Die beiden Gene gehören zu den Bvg-negativ regulierten Genen, die in der Bvg-minus-Phase exprimiert werden. Weiterhin beeinflusst eine leichte Überexpression von CspB aus B. pertussis die Expression der Adenylatzyklase sowohl in B. pertussis, als auch in B. bronchiseptica negativ. Dieser für das CspB spezifische Effekt erinnert an das strukturell verwandte Tex-Protein (Fuchs et al, 1996; König et al, 2002). Beide Proteine beeinflussen die Expression der Virulenzfaktoren negativ, wobei für CspB gezeigt werden konnte, dass es einen direkten Einfluss auf die verminderte cyaA-Expression auf Transkriptionsebene besitzt. Dies zeigt eine Verbindung der Kälteschockantwort mit dem Virulenz-Regulon der Bordetellen, deren Rolle im Infektionszyklus bislang ungeklärt ist.